# TARGET T0465 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0465.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 35.5806 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.082 0.041 0.032 0.029 0.076 0.092 0.006 0.642 2 S 0.068 0.070 0.023 0.037 0.075 0.241 0.010 0.476 3 E 0.105 0.105 0.020 0.018 0.043 0.100 0.011 0.599 4 N 0.085 0.275 0.013 0.019 0.029 0.147 0.012 0.420 5 Q 0.227 0.184 0.015 0.017 0.023 0.079 0.029 0.427 6 N 0.113 0.176 0.025 0.012 0.021 0.093 0.019 0.542 7 E 0.173 0.186 0.034 0.021 0.037 0.149 0.023 0.376 8 K 0.134 0.260 0.032 0.018 0.024 0.116 0.022 0.394 9 V 0.136 0.211 0.083 0.024 0.049 0.065 0.017 0.416 10 Y 0.068 0.190 0.100 0.057 0.059 0.095 0.013 0.419 11 D 0.049 0.181 0.055 0.039 0.070 0.082 0.014 0.509 12 L 0.103 0.241 0.079 0.035 0.113 0.082 0.012 0.334 13 S 0.068 0.107 0.020 0.019 0.047 0.541 0.016 0.182 14 F 0.330 0.165 0.012 0.013 0.019 0.146 0.033 0.281 15 F 0.224 0.455 0.030 0.016 0.017 0.033 0.026 0.200 16 M 0.119 0.308 0.047 0.042 0.073 0.062 0.025 0.324 17 P 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.994 18 G 0.040 0.060 0.011 0.023 0.055 0.082 0.014 0.716 19 Q 0.647 0.033 0.009 0.006 0.006 0.060 0.035 0.205 20 T 0.396 0.107 0.028 0.018 0.019 0.042 0.017 0.371 21 I 0.087 0.096 0.103 0.056 0.076 0.100 0.010 0.472 22 D 0.040 0.077 0.024 0.041 0.062 0.163 0.011 0.583 23 A 0.053 0.064 0.025 0.021 0.052 0.039 0.008 0.739 24 E 0.055 0.126 0.026 0.055 0.061 0.223 0.022 0.432 25 E 0.130 0.047 0.020 0.022 0.026 0.105 0.023 0.627 26 V 0.153 0.116 0.056 0.118 0.143 0.062 0.015 0.337 27 E 0.039 0.038 0.020 0.065 0.114 0.038 0.012 0.674 28 V 0.039 0.011 0.054 0.176 0.143 0.027 0.006 0.545 29 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 30 I 0.007 0.002 0.018 0.076 0.262 0.058 0.002 0.576 31 S 0.074 0.012 0.019 0.082 0.122 0.108 0.008 0.574 32 K 0.109 0.017 0.014 0.065 0.103 0.086 0.007 0.599 33 R 0.175 0.037 0.029 0.108 0.108 0.163 0.006 0.375 34 F 0.140 0.049 0.034 0.169 0.234 0.110 0.008 0.255 35 V 0.046 0.050 0.033 0.274 0.311 0.042 0.005 0.239 36 D 0.012 0.054 0.017 0.250 0.415 0.026 0.005 0.221 37 K 0.038 0.053 0.024 0.113 0.217 0.078 0.016 0.462 38 E 0.034 0.034 0.007 0.033 0.042 0.380 0.035 0.435 39 G 0.349 0.029 0.011 0.039 0.018 0.045 0.156 0.353 40 N 0.323 0.009 0.041 0.038 0.040 0.277 0.030 0.241 41 V 0.015 0.001 0.010 0.018 0.033 0.053 0.006 0.863 42 V 0.048 0.001 0.038 0.275 0.451 0.077 0.002 0.109 43 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 44 F 0.002 0.001 0.075 0.193 0.569 0.022 0.001 0.139 45 I 0.033 0.001 0.276 0.288 0.294 0.018 0.003 0.088 46 F 0.010 0.002 0.097 0.168 0.302 0.025 0.001 0.397 47 K 0.006 0.001 0.441 0.184 0.291 0.019 0.001 0.056 48 A 0.003 0.001 0.061 0.031 0.054 0.034 0.001 0.814 49 I 0.030 0.005 0.191 0.072 0.183 0.113 0.006 0.400 50 T 0.028 0.007 0.024 0.022 0.039 0.292 0.005 0.584 51 T 0.029 0.013 0.014 0.009 0.022 0.043 0.004 0.866 52 D 0.016 0.012 0.004 0.003 0.006 0.556 0.003 0.399 53 R 0.080 0.049 0.002 0.002 0.004 0.626 0.006 0.231 54 I 0.009 0.918 0.003 0.003 0.005 0.011 0.001 0.051 55 D 0.004 0.844 0.003 0.004 0.008 0.022 0.003 0.112 56 E 0.025 0.869 0.002 0.003 0.005 0.021 0.004 0.072 57 L 0.020 0.958 0.001 0.001 0.003 0.002 0.002 0.014 58 E 0.009 0.967 0.002 0.002 0.005 0.001 0.002 0.012 59 K 0.014 0.931 0.002 0.003 0.004 0.003 0.009 0.035 60 E 0.068 0.826 0.005 0.004 0.003 0.004 0.034 0.055 61 N 0.252 0.516 0.012 0.009 0.006 0.009 0.104 0.092 62 T 0.188 0.244 0.118 0.057 0.035 0.050 0.084 0.223 63 T 0.045 0.060 0.104 0.071 0.079 0.095 0.016 0.530 64 Y 0.033 0.042 0.055 0.090 0.160 0.103 0.006 0.511 65 K 0.029 0.057 0.084 0.203 0.167 0.089 0.006 0.365 66 N 0.015 0.038 0.046 0.132 0.127 0.057 0.006 0.579 67 V 0.053 0.035 0.060 0.149 0.207 0.076 0.010 0.409 68 K 0.032 0.026 0.022 0.078 0.103 0.155 0.010 0.574 69 G 0.066 0.027 0.018 0.044 0.067 0.118 0.040 0.621 70 R 0.241 0.022 0.026 0.026 0.029 0.138 0.028 0.490 71 G 0.043 0.011 0.030 0.039 0.028 0.100 0.017 0.731 72 R 0.089 0.007 0.026 0.040 0.091 0.168 0.008 0.571 73 V 0.032 0.007 0.030 0.052 0.120 0.066 0.002 0.691 74 K 0.017 0.014 0.041 0.125 0.224 0.142 0.003 0.434 75 E 0.040 0.037 0.034 0.059 0.113 0.115 0.005 0.598 76 L 0.105 0.129 0.083 0.076 0.125 0.102 0.009 0.370 77 D 0.044 0.174 0.027 0.049 0.064 0.172 0.009 0.461 78 S 0.062 0.174 0.030 0.016 0.054 0.080 0.011 0.573 79 Q 0.026 0.047 0.004 0.002 0.006 0.684 0.006 0.224 80 R 0.092 0.151 0.001 0.001 0.002 0.541 0.009 0.202 81 F 0.008 0.957 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.023 82 Y 0.005 0.947 0.002 0.002 0.003 0.009 0.003 0.029 83 A 0.013 0.934 0.003 0.004 0.006 0.008 0.003 0.030 84 R 0.007 0.972 0.002 0.004 0.004 0.002 0.002 0.008 85 I 0.011 0.949 0.004 0.007 0.008 0.002 0.005 0.013 86 A 0.018 0.887 0.016 0.019 0.023 0.005 0.011 0.022 87 V 0.015 0.844 0.027 0.029 0.033 0.010 0.008 0.034 88 E 0.019 0.801 0.036 0.044 0.036 0.009 0.014 0.041 89 T 0.079 0.533 0.091 0.079 0.058 0.017 0.046 0.096 90 T 0.089 0.183 0.160 0.136 0.112 0.022 0.046 0.252 91 V 0.045 0.081 0.228 0.090 0.151 0.040 0.035 0.331 92 Y 0.047 0.034 0.165 0.149 0.151 0.058 0.010 0.387 93 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 94 T 0.017 0.009 0.026 0.025 0.080 0.188 0.006 0.650 95 F 0.382 0.013 0.026 0.011 0.017 0.044 0.010 0.496 96 K 0.087 0.016 0.013 0.007 0.011 0.540 0.007 0.319 97 A 0.186 0.022 0.009 0.003 0.015 0.494 0.006 0.265 98 K 0.049 0.120 0.005 0.002 0.005 0.036 0.002 0.780 99 E 0.014 0.084 0.002 0.001 0.003 0.416 0.003 0.477 100 L 0.078 0.598 0.003 0.002 0.006 0.082 0.005 0.226 101 R 0.008 0.962 0.001 0.001 0.003 0.002 0.001 0.022 102 E 0.010 0.941 0.001 0.002 0.003 0.004 0.004 0.035 103 A 0.042 0.904 0.005 0.001 0.001 0.002 0.015 0.030 104 Y 0.151 0.773 0.005 0.005 0.003 0.002 0.031 0.030 105 K 0.386 0.185 0.065 0.012 0.009 0.023 0.119 0.201 106 T 0.182 0.094 0.244 0.015 0.019 0.044 0.025 0.377 107 E 0.050 0.052 0.067 0.013 0.018 0.121 0.014 0.663 108 D 0.047 0.025 0.027 0.010 0.013 0.242 0.005 0.630 109 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 110 V 0.005 0.009 0.006 0.003 0.014 0.373 0.001 0.590 111 E 0.058 0.028 0.001 0.001 0.002 0.547 0.003 0.360 112 V 0.025 0.865 0.001 0.001 0.002 0.012 0.001 0.094 113 A 0.010 0.911 0.001 0.001 0.005 0.004 0.001 0.067 114 K 0.012 0.929 0.001 0.001 0.002 0.003 0.003 0.049 115 R 0.103 0.829 0.001 0.001 0.001 0.002 0.021 0.041 116 V 0.142 0.771 0.009 0.004 0.004 0.002 0.033 0.034 117 L 0.115 0.605 0.054 0.019 0.017 0.011 0.041 0.138 118 S 0.064 0.272 0.146 0.026 0.031 0.043 0.042 0.377 119 V 0.080 0.191 0.123 0.017 0.021 0.077 0.027 0.465 120 G 0.021 0.069 0.047 0.005 0.006 0.118 0.012 0.722 121 G 0.095 0.075 0.053 0.014 0.010 0.141 0.035 0.577 122 E 0.313 0.046 0.039 0.008 0.010 0.190 0.012 0.381 123 Y 0.044 0.181 0.081 0.027 0.057 0.106 0.004 0.499 124 A 0.032 0.277 0.022 0.039 0.088 0.120 0.007 0.414 125 N 0.065 0.326 0.012 0.021 0.037 0.115 0.010 0.415 126 W 0.066 0.688 0.008 0.012 0.023 0.039 0.006 0.159 127 L 0.017 0.888 0.006 0.008 0.014 0.015 0.004 0.048 128 N 0.029 0.847 0.004 0.009 0.010 0.017 0.012 0.072 129 K 0.062 0.804 0.009 0.006 0.007 0.014 0.012 0.085 130 A 0.027 0.888 0.013 0.008 0.012 0.009 0.006 0.037 131 I 0.010 0.906 0.015 0.013 0.013 0.007 0.006 0.031 132 E 0.017 0.846 0.026 0.013 0.016 0.008 0.012 0.062 133 I 0.047 0.727 0.085 0.023 0.027 0.013 0.017 0.061 134 N 0.047 0.700 0.061 0.031 0.022 0.019 0.026 0.095 135 G 0.173 0.196 0.138 0.035 0.039 0.036 0.077 0.305 136 F 0.319 0.059 0.146 0.019 0.027 0.154 0.024 0.252 137 D 0.040 0.043 0.048 0.015 0.030 0.212 0.015 0.597 138 D 0.052 0.031 0.018 0.007 0.015 0.084 0.007 0.786 139 D 0.015 0.007 0.003 0.001 0.002 0.781 0.004 0.188 140 L 0.280 0.040 0.005 0.002 0.008 0.263 0.009 0.393 141 E 0.036 0.237 0.006 0.003 0.006 0.294 0.004 0.414 142 D 0.041 0.352 0.003 0.004 0.005 0.156 0.008 0.431 143 L 0.067 0.659 0.005 0.004 0.009 0.024 0.006 0.227 144 E 0.011 0.814 0.004 0.006 0.022 0.018 0.002 0.123 145 E 0.004 0.880 0.004 0.011 0.015 0.008 0.002 0.076 146 A 0.011 0.925 0.002 0.005 0.007 0.005 0.005 0.040 147 A 0.037 0.893 0.006 0.008 0.012 0.004 0.007 0.033 148 K 0.034 0.823 0.013 0.017 0.015 0.012 0.011 0.075 149 N 0.054 0.670 0.014 0.018 0.018 0.016 0.027 0.183 150 L 0.221 0.393 0.034 0.021 0.033 0.023 0.036 0.239 151 E 0.078 0.173 0.026 0.023 0.032 0.269 0.032 0.367 152 H 0.164 0.103 0.021 0.020 0.029 0.159 0.032 0.471 153 H 0.132 0.175 0.024 0.018 0.021 0.103 0.016 0.511 154 H 0.079 0.077 0.021 0.015 0.022 0.132 0.020 0.634 155 H 0.100 0.052 0.022 0.017 0.027 0.108 0.020 0.655 156 H 0.097 0.036 0.016 0.017 0.030 0.105 0.016 0.683 157 H 0.067 0.022 0.015 0.016 0.027 0.097 0.010 0.745