# TARGET T0465 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t04-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0465.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 35.4237 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.070 0.134 0.033 0.078 0.055 0.096 0.159 0.375 2 S 0.164 0.088 0.019 0.027 0.044 0.079 0.136 0.445 3 E 0.083 0.050 0.010 0.026 0.017 0.095 0.056 0.663 4 N 0.087 0.076 0.010 0.016 0.029 0.085 0.041 0.656 5 Q 0.092 0.159 0.017 0.028 0.029 0.080 0.051 0.544 6 N 0.135 0.104 0.012 0.035 0.028 0.079 0.063 0.545 7 E 0.069 0.076 0.044 0.083 0.075 0.087 0.109 0.457 8 K 0.203 0.096 0.039 0.031 0.092 0.053 0.037 0.448 9 V 0.110 0.023 0.033 0.042 0.060 0.102 0.102 0.529 10 Y 0.018 0.051 0.077 0.108 0.086 0.098 0.048 0.514 11 D 0.292 0.128 0.028 0.022 0.057 0.051 0.070 0.352 12 L 0.181 0.169 0.028 0.073 0.029 0.066 0.061 0.392 13 S 0.257 0.035 0.021 0.019 0.049 0.076 0.051 0.492 14 F 0.017 0.023 0.045 0.039 0.073 0.156 0.044 0.602 15 F 0.086 0.055 0.059 0.023 0.058 0.122 0.051 0.545 16 M 0.349 0.023 0.012 0.018 0.014 0.063 0.328 0.194 17 P 0.033 0.052 0.015 0.013 0.012 0.130 0.051 0.693 18 G 0.048 0.052 0.018 0.004 0.015 0.105 0.032 0.725 19 Q 0.041 0.155 0.022 0.046 0.019 0.121 0.075 0.520 20 T 0.100 0.125 0.014 0.023 0.042 0.102 0.066 0.528 21 I 0.108 0.121 0.042 0.054 0.077 0.079 0.128 0.392 22 D 0.250 0.065 0.027 0.036 0.082 0.060 0.088 0.392 23 A 0.089 0.034 0.048 0.079 0.118 0.092 0.083 0.456 24 E 0.079 0.018 0.045 0.077 0.179 0.085 0.047 0.470 25 E 0.065 0.008 0.025 0.052 0.105 0.096 0.047 0.602 26 V 0.010 0.010 0.058 0.084 0.107 0.126 0.024 0.580 27 E 0.029 0.017 0.025 0.060 0.081 0.117 0.046 0.625 28 V 0.036 0.036 0.038 0.136 0.066 0.118 0.076 0.494 29 P 0.124 0.071 0.038 0.051 0.068 0.086 0.057 0.505 30 I 0.099 0.132 0.036 0.062 0.081 0.074 0.069 0.446 31 S 0.079 0.205 0.039 0.052 0.109 0.074 0.063 0.380 32 K 0.035 0.191 0.027 0.130 0.174 0.056 0.102 0.284 33 R 0.038 0.126 0.035 0.153 0.221 0.044 0.058 0.325 34 F 0.045 0.039 0.053 0.211 0.346 0.042 0.069 0.195 35 V 0.032 0.006 0.096 0.200 0.151 0.058 0.086 0.371 36 D 0.588 0.002 0.008 0.031 0.036 0.024 0.028 0.281 37 K 0.279 0.002 0.016 0.008 0.019 0.049 0.020 0.608 38 E 0.016 0.001 0.014 0.006 0.014 0.094 0.007 0.849 39 G 0.013 0.001 0.002 0.009 0.011 0.104 0.007 0.856 40 N 0.009 0.002 0.043 0.116 0.095 0.158 0.028 0.548 41 V 0.026 0.002 0.020 0.037 0.061 0.076 0.026 0.754 42 V 0.007 0.005 0.141 0.248 0.178 0.071 0.110 0.239 43 P 0.008 0.003 0.231 0.175 0.266 0.040 0.031 0.245 44 F 0.007 0.003 0.151 0.311 0.331 0.024 0.024 0.150 45 I 0.021 0.005 0.343 0.220 0.184 0.043 0.024 0.160 46 F 0.074 0.007 0.112 0.075 0.127 0.063 0.070 0.471 47 K 0.052 0.013 0.155 0.121 0.107 0.079 0.072 0.400 48 A 0.006 0.004 0.060 0.022 0.062 0.122 0.021 0.703 49 I 0.004 0.035 0.145 0.027 0.032 0.094 0.023 0.639 50 T 0.236 0.634 0.003 0.002 0.002 0.012 0.066 0.044 51 T 0.147 0.633 0.003 0.002 0.001 0.019 0.093 0.103 52 D 0.013 0.757 0.007 0.001 0.001 0.011 0.092 0.117 53 R 0.017 0.881 0.004 0.001 0.001 0.007 0.045 0.044 54 I 0.024 0.922 0.001 0.001 0.001 0.004 0.034 0.014 55 D 0.009 0.867 0.002 0.003 0.003 0.009 0.048 0.059 56 E 0.029 0.720 0.012 0.004 0.014 0.014 0.125 0.083 57 L 0.045 0.302 0.058 0.032 0.024 0.032 0.427 0.080 58 E 0.149 0.054 0.075 0.023 0.026 0.060 0.404 0.208 59 K 0.121 0.022 0.021 0.014 0.012 0.084 0.117 0.607 60 E 0.023 0.015 0.047 0.012 0.019 0.125 0.040 0.720 61 N 0.030 0.014 0.062 0.023 0.041 0.147 0.033 0.650 62 T 0.021 0.009 0.033 0.044 0.056 0.134 0.057 0.646 63 T 0.016 0.010 0.078 0.138 0.133 0.095 0.061 0.469 64 Y 0.045 0.007 0.051 0.107 0.165 0.067 0.047 0.510 65 K 0.016 0.004 0.084 0.209 0.167 0.070 0.053 0.398 66 N 0.036 0.002 0.027 0.101 0.124 0.067 0.024 0.619 67 V 0.201 0.003 0.028 0.090 0.103 0.066 0.051 0.458 68 K 0.086 0.002 0.010 0.022 0.024 0.069 0.011 0.777 69 G 0.074 0.005 0.003 0.011 0.024 0.072 0.012 0.799 70 R 0.019 0.007 0.005 0.051 0.043 0.098 0.018 0.758 71 G 0.029 0.013 0.012 0.098 0.123 0.074 0.028 0.624 72 R 0.075 0.035 0.038 0.184 0.163 0.065 0.042 0.399 73 V 0.246 0.051 0.054 0.084 0.118 0.048 0.072 0.328 74 K 0.094 0.024 0.042 0.080 0.105 0.069 0.082 0.503 75 E 0.022 0.039 0.031 0.042 0.079 0.105 0.050 0.633 76 L 0.032 0.108 0.033 0.034 0.040 0.099 0.040 0.614 77 D 0.139 0.681 0.003 0.005 0.004 0.021 0.044 0.103 78 S 0.056 0.732 0.003 0.002 0.002 0.025 0.084 0.097 79 Q 0.008 0.874 0.003 0.002 0.002 0.009 0.055 0.047 80 R 0.013 0.779 0.007 0.003 0.006 0.009 0.150 0.033 81 F 0.003 0.935 0.005 0.007 0.005 0.004 0.028 0.014 82 Y 0.006 0.945 0.004 0.003 0.007 0.002 0.029 0.005 83 A 0.003 0.904 0.009 0.016 0.014 0.003 0.039 0.012 84 R 0.012 0.618 0.043 0.034 0.088 0.010 0.168 0.027 85 I 0.018 0.233 0.076 0.114 0.126 0.021 0.359 0.052 86 A 0.033 0.073 0.152 0.111 0.164 0.043 0.340 0.085 87 V 0.028 0.042 0.196 0.148 0.140 0.078 0.176 0.192 88 E 0.010 0.015 0.153 0.078 0.144 0.094 0.054 0.452 89 T 0.006 0.009 0.254 0.141 0.204 0.091 0.036 0.260 90 T 0.005 0.005 0.203 0.126 0.168 0.100 0.052 0.342 91 V 0.015 0.007 0.162 0.089 0.078 0.100 0.044 0.504 92 Y 0.179 0.049 0.076 0.042 0.038 0.110 0.097 0.409 93 P 0.079 0.075 0.033 0.013 0.016 0.073 0.045 0.665 94 T 0.162 0.036 0.014 0.008 0.009 0.077 0.049 0.644 95 F 0.041 0.067 0.038 0.012 0.026 0.125 0.132 0.559 96 K 0.017 0.281 0.016 0.003 0.008 0.052 0.031 0.591 97 A 0.121 0.816 0.001 0.001 0.001 0.004 0.039 0.019 98 K 0.008 0.846 0.001 0.004 0.001 0.012 0.041 0.088 99 E 0.034 0.846 0.004 0.001 0.005 0.006 0.044 0.061 100 L 0.048 0.652 0.011 0.006 0.004 0.015 0.217 0.046 101 R 0.152 0.263 0.042 0.014 0.012 0.043 0.334 0.138 102 E 0.185 0.071 0.009 0.007 0.009 0.060 0.128 0.532 103 A 0.041 0.037 0.056 0.007 0.008 0.131 0.054 0.667 104 Y 0.083 0.024 0.101 0.005 0.005 0.114 0.095 0.573 105 K 0.088 0.021 0.017 0.003 0.002 0.093 0.046 0.730 106 T 0.006 0.013 0.014 0.002 0.002 0.113 0.014 0.836 107 E 0.006 0.045 0.028 0.002 0.002 0.091 0.015 0.810 108 D 0.050 0.780 0.005 0.001 0.001 0.016 0.067 0.081 109 P 0.020 0.893 0.003 0.001 0.001 0.007 0.041 0.036 110 V 0.011 0.877 0.003 0.001 0.001 0.004 0.083 0.022 111 E 0.013 0.858 0.009 0.001 0.002 0.007 0.055 0.054 112 V 0.041 0.787 0.019 0.003 0.005 0.013 0.062 0.070 113 A 0.031 0.810 0.018 0.007 0.005 0.014 0.078 0.037 114 K 0.111 0.310 0.025 0.009 0.011 0.039 0.257 0.238 115 R 0.042 0.207 0.033 0.023 0.020 0.066 0.143 0.465 116 V 0.052 0.108 0.112 0.017 0.027 0.120 0.102 0.462 117 L 0.054 0.053 0.081 0.018 0.014 0.129 0.120 0.532 118 S 0.099 0.076 0.015 0.005 0.004 0.097 0.029 0.675 119 V 0.177 0.334 0.019 0.003 0.007 0.052 0.061 0.346 120 G 0.022 0.285 0.025 0.005 0.007 0.083 0.056 0.515 121 G 0.030 0.290 0.032 0.012 0.016 0.082 0.214 0.324 122 E 0.018 0.651 0.030 0.033 0.022 0.036 0.098 0.112 123 Y 0.119 0.769 0.007 0.003 0.008 0.010 0.028 0.057 124 A 0.033 0.504 0.016 0.018 0.011 0.036 0.276 0.105 125 N 0.014 0.732 0.012 0.007 0.012 0.025 0.094 0.104 126 W 0.036 0.878 0.003 0.001 0.003 0.007 0.039 0.032 127 L 0.013 0.864 0.003 0.006 0.003 0.012 0.055 0.044 128 N 0.008 0.854 0.005 0.005 0.006 0.012 0.057 0.054 129 K 0.025 0.750 0.020 0.008 0.015 0.016 0.089 0.077 130 A 0.037 0.291 0.119 0.039 0.039 0.037 0.351 0.088 131 I 0.033 0.109 0.191 0.062 0.061 0.072 0.264 0.208 132 E 0.094 0.060 0.081 0.029 0.055 0.097 0.071 0.512 133 I 0.053 0.035 0.164 0.039 0.060 0.103 0.078 0.468 134 N 0.033 0.016 0.155 0.021 0.037 0.119 0.046 0.572 135 G 0.031 0.023 0.056 0.016 0.023 0.143 0.061 0.647 136 F 0.069 0.074 0.032 0.018 0.015 0.103 0.034 0.655 137 D 0.405 0.132 0.005 0.004 0.005 0.058 0.046 0.345 138 D 0.023 0.158 0.009 0.004 0.005 0.115 0.047 0.638 139 D 0.059 0.808 0.003 0.001 0.002 0.018 0.024 0.087 140 L 0.090 0.814 0.001 0.001 0.001 0.008 0.056 0.029 141 E 0.003 0.845 0.002 0.006 0.004 0.020 0.035 0.084 142 D 0.004 0.954 0.001 0.001 0.007 0.003 0.018 0.012 143 L 0.002 0.955 0.003 0.009 0.004 0.002 0.022 0.004 144 E 0.005 0.936 0.004 0.010 0.007 0.002 0.032 0.004 145 E 0.014 0.828 0.009 0.018 0.022 0.005 0.074 0.029 146 A 0.057 0.585 0.041 0.033 0.063 0.023 0.101 0.097 147 A 0.084 0.475 0.043 0.045 0.059 0.053 0.105 0.135 148 K 0.063 0.218 0.019 0.022 0.040 0.068 0.071 0.499 149 N 0.133 0.234 0.012 0.017 0.021 0.061 0.093 0.429 150 L 0.163 0.102 0.018 0.017 0.019 0.081 0.124 0.477 151 E 0.092 0.030 0.020 0.017 0.023 0.081 0.074 0.664 152 H 0.145 0.014 0.010 0.011 0.017 0.068 0.031 0.703 153 H 0.129 0.008 0.019 0.018 0.029 0.086 0.048 0.663 154 H 0.092 0.004 0.015 0.016 0.031 0.086 0.027 0.731 155 H 0.116 0.003 0.009 0.012 0.028 0.086 0.021 0.725 156 H 0.031 0.002 0.011 0.026 0.038 0.121 0.016 0.755 157 H 0.050 0.005 0.012 0.041 0.078 0.113 0.028 0.673