This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATAA S A 3 3 NATAA E A 4 4 NATAA N A 5 5 NATAA Q A 6 6 NATAA N A 7 7 NATAA E A 8 8 NATAA K A 9 9 NATAA V A 10 10 NATAA Y A 11 11 NATAA D A 12 12 NATAA L A 13 13 NATAA S A 14 14 NATAA F A 15 15 NATAA F A 16 16 NATAA M A 17 17 NATRO P A 18 18 NATAA G A 19 19 NATAA Q A 20 20 NATAA T A 21 21 NATAA I A 22 22 NATAA D A 23 23 NATAA A A 24 24 NATAA E A 25 25 NATAA E A 26 26 NATAA V A 27 27 NATAA E A 28 28 NATAA V A 29 29 NATRO P A 30 30 NATAA I A 31 31 NATAA S A 32 32 NATAA K A 33 33 NATAA R A 34 34 NATAA F A 35 35 NATAA V A 36 36 NATAA D A 37 37 NATAA K A 38 38 NATAA E A 39 39 NATAA G A 40 40 NATAA N A 41 41 NATAA V A 42 42 NATAA V A 43 43 NATRO P A 44 44 NATAA F A 45 45 NATAA I A 46 46 NATAA F A 47 47 NATAA K A 48 48 NATAA A A 49 49 NATAA I A 50 50 NATAA T A 51 51 NATAA T A 52 52 NATAA D A 53 53 NATAA R A 54 54 NATAA I A 55 55 NATAA D A 56 56 NATAA E A 57 57 NATAA L A 58 58 NATAA E A 59 59 NATAA K A 60 60 NATAA E A 61 61 NATAA N A 62 62 NATAA T A 63 63 NATAA T A 64 64 NATAA Y A 65 65 NATAA K A 66 66 NATAA N A 67 67 NATAA V A 68 68 NATAA K A 69 69 NATAA G A 70 70 NATAA R A 71 71 NATAA G A 72 72 NATAA R A 73 73 NATAA V A 74 74 NATAA K A 75 75 NATAA E A 76 76 NATAA L A 77 77 NATAA D A 78 78 NATAA S A 79 79 NATAA Q A 80 80 NATAA R A 81 81 NATAA F A 82 82 NATAA Y A 83 83 NATAA A A 84 84 NATAA R A 85 85 NATAA I A 86 86 NATAA A A 87 87 NATAA V A 88 88 NATAA E A 89 89 NATAA T A 90 90 NATAA T A 91 91 NATAA V A 92 92 NATAA Y A 93 93 NATRO P A 94 94 NATAA T A 95 95 NATAA F A 96 96 NATAA K A 97 97 NATAA A A 98 98 NATAA K A 99 99 NATAA E A 100 100 NATAA L A 101 101 NATAA R A 102 102 NATAA E A 103 103 NATAA A A 104 104 NATAA Y A 105 105 NATAA K A 106 106 NATAA T A 107 107 NATAA E A 108 108 NATAA D A 109 109 NATRO P A 110 110 NATAA V A 111 111 NATAA E A 112 112 NATAA V A 113 113 NATAA A A 114 114 NATAA K A 115 115 NATAA R A 116 116 NATAA V A 117 117 NATAA L A 118 118 NATAA S A 119 119 NATAA V A 120 120 NATAA G A 121 121 NATAA G A 122 122 NATAA E A 123 123 NATAA Y A 124 124 NATAA A A 125 125 NATAA N A 126 126 NATAA W A 127 127 NATAA L A 128 128 NATAA N A 129 129 NATAA K A 130 130 NATAA A A 131 131 NATAA I A 132 132 NATAA E A 133 133 NATAA I A 134 134 NATAA N A 135 135 NATAA G A 136 136 NATAA F A 137 137 NATAA D A 138 138 NATAA D A 139 139 NATAA D A 140 140 NATAA L A 141 141 NATAA E A 142 142 NATAA D A 143 143 NATAA L A 144 144 NATAA E A 145 145 NATAA E A 146 146 NATAA A A 147 147 NATAA A A 148 148 NATAA K A 149 149 NATAA N A 150 150 NATAA L A 151 151 NATAA E A 152 152 NATAA H A 153 153 NATAA H A 154 154 NATAA H A 155 155 NATAA H A 156 156 NATAA H A 157 157 NATAA H