# TARGET T0462 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0462.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 71.0371 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.019 0.017 0.037 0.125 0.113 0.123 0.093 0.474 2 K 0.147 0.056 0.032 0.056 0.082 0.088 0.085 0.453 3 L 0.232 0.042 0.022 0.061 0.070 0.069 0.048 0.455 4 S 0.098 0.023 0.020 0.059 0.085 0.084 0.044 0.587 5 R 0.011 0.004 0.040 0.051 0.110 0.104 0.058 0.622 6 L 0.084 0.002 0.022 0.037 0.058 0.114 0.025 0.659 7 V 0.691 0.001 0.009 0.027 0.016 0.034 0.046 0.176 8 P 0.009 0.001 0.006 0.006 0.027 0.106 0.005 0.841 9 G 0.008 0.001 0.015 0.007 0.052 0.059 0.012 0.846 10 V 0.035 0.002 0.026 0.359 0.187 0.079 0.035 0.277 11 P 0.004 0.001 0.088 0.111 0.270 0.066 0.026 0.433 12 A 0.001 0.001 0.089 0.233 0.506 0.018 0.018 0.134 13 R 0.002 0.001 0.151 0.400 0.386 0.008 0.018 0.034 14 I 0.004 0.001 0.139 0.281 0.273 0.022 0.030 0.249 15 K 0.003 0.001 0.147 0.386 0.375 0.014 0.013 0.062 16 R 0.012 0.003 0.157 0.149 0.288 0.051 0.044 0.297 17 L 0.013 0.007 0.140 0.168 0.197 0.077 0.042 0.358 18 E 0.074 0.026 0.082 0.108 0.117 0.090 0.045 0.459 19 V 0.165 0.185 0.022 0.028 0.031 0.083 0.076 0.409 20 S 0.045 0.487 0.009 0.007 0.011 0.046 0.033 0.363 21 G 0.027 0.759 0.008 0.006 0.006 0.025 0.032 0.138 22 E 0.011 0.919 0.002 0.006 0.004 0.009 0.013 0.035 23 L 0.014 0.956 0.002 0.001 0.002 0.003 0.011 0.011 24 H 0.013 0.911 0.001 0.002 0.003 0.003 0.058 0.009 25 E 0.010 0.665 0.020 0.015 0.011 0.009 0.223 0.047 26 K 0.027 0.680 0.029 0.025 0.027 0.018 0.124 0.069 27 L 0.267 0.073 0.171 0.033 0.047 0.041 0.269 0.099 28 V 0.764 0.006 0.011 0.009 0.007 0.026 0.022 0.156 29 G 0.046 0.001 0.002 0.002 0.004 0.021 0.004 0.920 30 M 0.003 0.001 0.004 0.004 0.011 0.112 0.004 0.861 31 G 0.002 0.001 0.039 0.080 0.200 0.203 0.027 0.450 32 F 0.014 0.001 0.013 0.017 0.019 0.055 0.012 0.870 33 V 0.608 0.001 0.037 0.060 0.020 0.036 0.072 0.165 34 P 0.038 0.001 0.011 0.007 0.020 0.063 0.006 0.853 35 G 0.010 0.001 0.036 0.012 0.073 0.065 0.012 0.790 36 E 0.003 0.002 0.131 0.243 0.333 0.063 0.021 0.204 37 E 0.002 0.003 0.079 0.197 0.274 0.047 0.027 0.370 38 I 0.004 0.004 0.127 0.368 0.232 0.020 0.045 0.200 39 E 0.007 0.005 0.199 0.340 0.333 0.014 0.047 0.056 40 I 0.035 0.010 0.150 0.221 0.340 0.023 0.041 0.182 41 V 0.026 0.005 0.138 0.323 0.281 0.028 0.022 0.176 42 Q 0.012 0.004 0.048 0.201 0.327 0.054 0.041 0.313 43 V 0.013 0.002 0.046 0.080 0.121 0.079 0.035 0.625 44 A 0.356 0.002 0.022 0.116 0.086 0.074 0.036 0.308 45 P 0.404 0.001 0.007 0.012 0.014 0.058 0.032 0.471 46 L 0.008 0.001 0.008 0.006 0.023 0.140 0.009 0.806 47 G 0.007 0.001 0.006 0.003 0.012 0.058 0.008 0.905 48 D 0.156 0.010 0.015 0.105 0.062 0.136 0.084 0.433 49 P 0.006 0.003 0.057 0.049 0.118 0.100 0.031 0.636 50 I 0.002 0.001 0.136 0.198 0.537 0.018 0.020 0.088 51 V 0.001 0.001 0.147 0.295 0.398 0.011 0.046 0.101 52 C 0.001 0.001 0.287 0.435 0.191 0.008 0.021 0.057 53 K 0.078 0.002 0.203 0.220 0.316 0.021 0.044 0.115 54 I 0.216 0.003 0.116 0.050 0.050 0.064 0.050 0.452 55 G 0.024 0.003 0.061 0.026 0.088 0.109 0.009 0.680 56 N 0.004 0.003 0.032 0.019 0.099 0.068 0.044 0.732 57 R 0.003 0.010 0.083 0.263 0.320 0.057 0.065 0.199 58 N 0.005 0.013 0.097 0.339 0.315 0.018 0.085 0.127 59 I 0.010 0.037 0.103 0.367 0.203 0.029 0.034 0.217 60 T 0.008 0.045 0.299 0.173 0.273 0.020 0.065 0.116 61 L 0.016 0.093 0.177 0.210 0.183 0.035 0.144 0.141 62 R 0.112 0.306 0.053 0.074 0.086 0.035 0.166 0.167 63 K 0.148 0.196 0.032 0.043 0.050 0.060 0.161 0.309 64 R 0.046 0.145 0.030 0.037 0.050 0.079 0.105 0.506 65 E 0.234 0.073 0.020 0.023 0.048 0.064 0.103 0.435 66 A 0.099 0.020 0.018 0.023 0.026 0.101 0.092 0.620 67 D 0.026 0.017 0.040 0.047 0.118 0.103 0.032 0.616 68 L 0.009 0.006 0.029 0.026 0.104 0.071 0.031 0.724 69 I 0.005 0.005 0.135 0.278 0.246 0.086 0.026 0.219 70 E 0.010 0.008 0.150 0.162 0.335 0.045 0.053 0.236 71 V 0.014 0.011 0.121 0.245 0.169 0.050 0.078 0.312 72 E 0.034 0.012 0.190 0.197 0.173 0.060 0.060 0.274 73 V 0.152 0.011 0.066 0.065 0.066 0.067 0.080 0.492 74 V 0.179 0.017 0.034 0.035 0.039 0.077 0.046 0.573 75 G 0.072 0.008 0.014 0.012 0.022 0.077 0.021 0.775 76 G 0.018 0.017 0.008 0.019 0.029 0.100 0.018 0.792 77 E 0.039 0.042 0.012 0.020 0.033 0.086 0.019 0.750 78 L 0.128 0.119 0.021 0.087 0.072 0.089 0.063 0.420 79 P 0.077 0.133 0.028 0.056 0.078 0.069 0.045 0.515 80 L 0.093 0.063 0.041 0.093 0.117 0.065 0.077 0.452 81 I 0.037 0.026 0.049 0.155 0.164 0.093 0.091 0.384 82 L 0.063 0.012 0.035 0.045 0.089 0.094 0.089 0.572 83 A 0.267 0.008 0.016 0.028 0.029 0.084 0.070 0.498 84 D 0.137 0.011 0.006 0.010 0.017 0.072 0.039 0.708 85 D 0.019 0.006 0.009 0.006 0.025 0.110 0.012 0.813 86 G 0.027 0.011 0.031 0.050 0.141 0.126 0.037 0.577 87 T 0.017 0.010 0.033 0.119 0.140 0.087 0.084 0.511 88 Y 0.007 0.014 0.074 0.173 0.208 0.075 0.061 0.387 89 E 0.020 0.023 0.065 0.186 0.247 0.055 0.049 0.354 90 I 0.023 0.015 0.099 0.189 0.160 0.061 0.089 0.364 91 T 0.038 0.035 0.106 0.146 0.172 0.076 0.098 0.329 92 K 0.123 0.052 0.054 0.083 0.131 0.093 0.068 0.396 93 L 0.106 0.040 0.031 0.037 0.051 0.117 0.038 0.581 94 N 0.127 0.100 0.020 0.030 0.056 0.101 0.050 0.515 95 G 0.051 0.184 0.012 0.020 0.049 0.095 0.039 0.550 96 G 0.045 0.333 0.019 0.038 0.071 0.069 0.050 0.374 97 R 0.043 0.483 0.018 0.074 0.082 0.048 0.046 0.206 98 R 0.026 0.465 0.021 0.068 0.086 0.046 0.046 0.243 99 F 0.022 0.744 0.018 0.035 0.050 0.018 0.034 0.079 100 L 0.042 0.729 0.016 0.028 0.035 0.019 0.043 0.088 101 F 0.042 0.298 0.085 0.088 0.058 0.031 0.246 0.152 102 R 0.130 0.469 0.023 0.042 0.040 0.029 0.111 0.156 103 M 0.500 0.086 0.025 0.013 0.020 0.038 0.068 0.250 104 K 0.149 0.047 0.007 0.025 0.027 0.069 0.029 0.646 105 N 0.019 0.007 0.002 0.007 0.013 0.034 0.008 0.909 106 L 0.015 0.005 0.009 0.054 0.060 0.165 0.042 0.650 107 G 0.012 0.002 0.038 0.087 0.094 0.110 0.140 0.517 108 I 0.433 0.001 0.010 0.011 0.014 0.048 0.042 0.441 109 E 0.736 0.001 0.005 0.003 0.002 0.016 0.022 0.215 110 S 0.018 0.001 0.010 0.003 0.017 0.110 0.004 0.838 111 G 0.001 0.001 0.044 0.007 0.080 0.103 0.013 0.752 112 K 0.001 0.001 0.161 0.339 0.302 0.041 0.025 0.132 113 K 0.001 0.001 0.260 0.257 0.209 0.018 0.049 0.206 114 I 0.001 0.001 0.301 0.342 0.189 0.012 0.028 0.128 115 Q 0.001 0.001 0.609 0.171 0.154 0.007 0.015 0.043 116 V 0.012 0.001 0.369 0.210 0.156 0.025 0.052 0.177 117 S 0.012 0.002 0.390 0.099 0.139 0.055 0.045 0.257 118 G 0.047 0.004 0.094 0.059 0.132 0.108 0.053 0.503 119 R 0.038 0.006 0.058 0.073 0.100 0.135 0.065 0.525 120 R 0.013 0.005 0.081 0.057 0.129 0.150 0.054 0.512 121 Y 0.010 0.007 0.145 0.110 0.217 0.092 0.093 0.326 122 Y 0.018 0.009 0.162 0.111 0.140 0.090 0.069 0.401 123 I 0.051 0.019 0.206 0.133 0.136 0.083 0.092 0.281 124 E 0.040 0.030 0.090 0.077 0.156 0.127 0.080 0.399 125 G 0.030 0.033 0.087 0.041 0.104 0.113 0.106 0.486 126 R 0.033 0.093 0.122 0.131 0.181 0.108 0.088 0.245 127 E 0.023 0.067 0.108 0.069 0.159 0.099 0.095 0.381 128 I 0.042 0.053 0.128 0.177 0.178 0.079 0.109 0.234 129 D 0.076 0.075 0.091 0.138 0.204 0.085 0.109 0.221 130 L 0.081 0.061 0.065 0.047 0.094 0.142 0.057 0.454 131 G 0.054 0.050 0.062 0.101 0.157 0.102 0.076 0.398 132 Y 0.024 0.028 0.041 0.040 0.103 0.109 0.199 0.456 133 G 0.049 0.055 0.052 0.063 0.106 0.108 0.266 0.302 134 E 0.171 0.040 0.024 0.097 0.140 0.089 0.100 0.339 135 A 0.028 0.011 0.018 0.039 0.083 0.106 0.067 0.648 136 T 0.007 0.007 0.079 0.104 0.292 0.094 0.046 0.372 137 K 0.009 0.003 0.079 0.151 0.305 0.077 0.059 0.317 138 I 0.004 0.002 0.133 0.234 0.181 0.075 0.047 0.324 139 W 0.033 0.004 0.162 0.127 0.212 0.074 0.061 0.328 140 V 0.083 0.006 0.057 0.140 0.137 0.080 0.121 0.377 141 R 0.012 0.005 0.089 0.061 0.114 0.110 0.038 0.571 142 R 0.011 0.005 0.077 0.061 0.168 0.104 0.039 0.536 143 V 0.020 0.009 0.078 0.103 0.081 0.112 0.040 0.557 144 S 0.122 0.037 0.092 0.072 0.070 0.107 0.087 0.412 145 D 0.121 0.034 0.046 0.043 0.056 0.113 0.067 0.520 146 A 0.094 0.021 0.029 0.024 0.041 0.097 0.071 0.623 147 G 0.249 0.019 0.019 0.022 0.030 0.096 0.081 0.484 148 E 0.080 0.012 0.012 0.041 0.049 0.111 0.047 0.648 149 E 0.011 0.004 0.013 0.022 0.065 0.096 0.017 0.772 150 S 0.022 0.004 0.030 0.061 0.127 0.132 0.039 0.584 151 H 0.084 0.005 0.026 0.103 0.105 0.110 0.051 0.516 152 P 0.080 0.006 0.018 0.042 0.056 0.080 0.048 0.671 153 Q 0.038 0.006 0.017 0.035 0.067 0.112 0.038 0.686 154 K 0.032 0.006 0.018 0.028 0.058 0.094 0.037 0.727