This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 1 NATAA M A 2 2 NATAA N A 3 3 NATAA S A 4 4 NATAA E A 5 5 NATAA V A 6 6 NATAA I A 7 7 NATAA K A 8 8 NATAA E A 9 9 NATAA F A 10 10 NATAA L A 11 11 NATAA E A 12 12 NATAA D A 13 13 NATAA I A 14 14 NATAA G A 15 15 NATAA E A 16 16 NATAA D A 17 17 NATAA Y A 18 18 NATAA I A 19 19 NATAA E A 20 20 NATAA L A 21 21 NATAA E A 22 22 NATAA N A 23 23 NATAA E A 24 24 NATAA I A 25 25 NATAA H A 26 26 NATAA L A 27 27 NATAA K A 28 28 NATRO P A 29 29 NATAA E A 30 30 NATAA V A 31 31 NATAA F A 32 32 NATAA Y A 33 33 NATAA E A 34 34 NATAA V A 35 35 NATAA W A 36 36 NATAA K A 37 37 NATAA Y A 38 38 NATAA V A 39 39 NATAA G A 40 40 NATAA E A 41 41 NATRO P A 42 42 NATAA E A 43 43 NATAA L A 44 44 NATAA K A 45 45 NATAA T A 46 46 NATAA Y A 47 47 NATAA V A 48 48 NATAA I A 49 49 NATAA E A 50 50 NATAA D A 51 51 NATAA E A 52 52 NATAA I A 53 53 NATAA V A 54 54 NATAA E A 55 55 NATRO P A 56 56 NATAA G A 57 57 NATAA E A 58 58 NATAA Y A 59 59 NATAA D A 60 60 NATRO P A 61 61 NATRO P A 62 62 NATAA E A 63 63 NATAA M A 64 64 NATAA K A 65 65 NATAA Y A 66 66 NATAA T A 67 67 NATAA N A 68 68 NATAA V A 69 69 NATAA K A 70 70 NATAA K A 71 71 NATAA V A 72 72 NATAA K A 73 73 NATAA I A 74 74 NATAA K A 75 75 NATAA K A 76 76 NATAA V A 77 77 NATAA Y A 78 78 NATAA F A 79 79 NATAA E A 80 80 NATAA T A 81 81 NATAA L A 82 82 NATAA D A 83 83 NATAA N A 84 84 NATAA V A 85 85 NATAA R A 86 86 NATAA V A 87 87 NATAA V A 88 88 NATAA T A 89 89 NATAA D A 90 90 NATAA Y A 91 91 NATAA S A 92 92 NATAA E A 93 93 NATAA F A 94 94 NATAA Q A 95 95 NATAA K A 96 96 NATAA I A 97 97 NATAA L A 98 98 NATAA K A 99 99 NATAA K A 100 100 NATAA R A 101 101 NATAA G A 102 102 NATAA T A 103 103 NATAA K A 104 104 NATAA L A 105 105 NATAA E A 106 106 NATAA H A 107 107 NATAA H A 108 108 NATAA H A 109 109 NATAA H A 110 110 NATAA H A 111 111 NATAA H