# TARGET T0407 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0407.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 2397 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.078 0.028 0.024 0.045 0.059 0.079 0.156 0.135 0.159 0.127 0.113 2 E 0.133 0.271 0.087 0.290 0.168 0.027 0.013 0.005 0.003 0.001 0.001 3 V 0.002 0.003 0.006 0.010 0.006 0.017 0.055 0.074 0.221 0.271 0.335 4 K 0.014 0.033 0.033 0.194 0.240 0.168 0.158 0.063 0.051 0.028 0.017 5 K 0.102 0.196 0.209 0.227 0.114 0.062 0.043 0.019 0.015 0.009 0.004 6 V 0.034 0.035 0.054 0.149 0.153 0.180 0.178 0.092 0.062 0.039 0.025 7 L 0.008 0.007 0.012 0.015 0.014 0.026 0.087 0.162 0.224 0.250 0.196 8 V 0.024 0.078 0.103 0.220 0.185 0.124 0.120 0.066 0.041 0.029 0.012 9 S 0.037 0.051 0.117 0.124 0.115 0.118 0.146 0.092 0.094 0.067 0.039 10 A 0.154 0.089 0.079 0.162 0.141 0.114 0.123 0.049 0.046 0.030 0.013 11 F 0.054 0.059 0.044 0.115 0.114 0.117 0.164 0.123 0.102 0.067 0.039 12 L 0.008 0.013 0.022 0.033 0.031 0.056 0.121 0.141 0.195 0.207 0.174 13 L 0.018 0.038 0.064 0.126 0.137 0.136 0.168 0.114 0.091 0.068 0.039 14 T 0.063 0.086 0.135 0.176 0.145 0.120 0.116 0.065 0.046 0.033 0.015 15 T 0.076 0.075 0.081 0.228 0.177 0.140 0.113 0.045 0.035 0.021 0.009 16 C 0.009 0.008 0.012 0.018 0.020 0.035 0.106 0.168 0.228 0.217 0.178 17 L 0.023 0.053 0.081 0.189 0.185 0.121 0.145 0.082 0.061 0.043 0.017 18 M 0.017 0.039 0.104 0.084 0.076 0.097 0.148 0.124 0.134 0.113 0.065 19 S 0.071 0.160 0.115 0.198 0.163 0.099 0.104 0.041 0.025 0.017 0.006 20 G 0.166 0.118 0.054 0.106 0.091 0.099 0.144 0.094 0.064 0.042 0.022 21 Q 0.417 0.187 0.087 0.132 0.075 0.040 0.030 0.015 0.009 0.006 0.003 22 A 0.298 0.188 0.098 0.177 0.095 0.055 0.048 0.020 0.011 0.006 0.003 23 Q 0.042 0.041 0.041 0.087 0.089 0.120 0.179 0.129 0.128 0.087 0.055 24 R 0.123 0.147 0.151 0.213 0.144 0.087 0.074 0.028 0.018 0.010 0.004 25 R 0.077 0.110 0.186 0.192 0.136 0.103 0.096 0.044 0.029 0.018 0.009 26 N 0.101 0.073 0.087 0.125 0.123 0.137 0.160 0.078 0.058 0.036 0.020 27 E 0.234 0.191 0.123 0.188 0.112 0.057 0.052 0.020 0.013 0.008 0.003 28 I 0.089 0.053 0.079 0.108 0.107 0.122 0.155 0.112 0.085 0.057 0.033 29 Q 0.203 0.199 0.135 0.180 0.109 0.062 0.055 0.024 0.016 0.011 0.004 30 V 0.036 0.047 0.041 0.090 0.093 0.136 0.207 0.142 0.104 0.062 0.042 31 P 0.344 0.176 0.111 0.122 0.082 0.052 0.048 0.027 0.019 0.013 0.006 32 D 0.280 0.184 0.090 0.175 0.113 0.066 0.050 0.020 0.011 0.007 0.003 33 L 0.070 0.051 0.033 0.069 0.071 0.099 0.152 0.138 0.138 0.098 0.082 34 D 0.275 0.256 0.073 0.137 0.101 0.059 0.049 0.023 0.015 0.009 0.004 35 G 0.413 0.178 0.087 0.127 0.075 0.043 0.036 0.019 0.011 0.007 0.004 36 Y 0.119 0.068 0.041 0.098 0.114 0.131 0.143 0.097 0.085 0.061 0.043 37 T 0.142 0.154 0.064 0.199 0.137 0.105 0.101 0.042 0.031 0.016 0.009 38 T 0.111 0.082 0.072 0.161 0.153 0.122 0.118 0.072 0.054 0.032 0.021 39 L 0.026 0.029 0.039 0.083 0.100 0.147 0.184 0.132 0.121 0.082 0.056 40 K 0.033 0.064 0.065 0.203 0.184 0.145 0.144 0.065 0.052 0.029 0.016 41 C 0.002 0.003 0.006 0.007 0.011 0.019 0.067 0.157 0.243 0.242 0.242 42 D 0.017 0.034 0.049 0.108 0.140 0.117 0.162 0.110 0.122 0.092 0.049 43 F 0.002 0.003 0.007 0.008 0.011 0.018 0.062 0.120 0.245 0.273 0.251 44 H 0.008 0.014 0.022 0.048 0.070 0.090 0.169 0.142 0.177 0.146 0.113 45 M 0.004 0.005 0.009 0.013 0.018 0.025 0.079 0.154 0.242 0.239 0.212 46 H 0.008 0.011 0.017 0.042 0.060 0.068 0.138 0.172 0.185 0.155 0.144 47 S 0.009 0.010 0.016 0.030 0.039 0.057 0.120 0.141 0.212 0.200 0.167 48 V 0.033 0.049 0.042 0.114 0.133 0.133 0.165 0.125 0.098 0.065 0.043 49 F 0.044 0.031 0.030 0.083 0.086 0.103 0.153 0.143 0.135 0.115 0.077 50 S 0.036 0.026 0.020 0.047 0.048 0.064 0.115 0.129 0.167 0.175 0.173 51 D 0.125 0.172 0.048 0.163 0.140 0.092 0.090 0.059 0.051 0.035 0.023 52 G 0.178 0.064 0.030 0.069 0.063 0.078 0.119 0.088 0.113 0.111 0.085 53 L 0.106 0.094 0.043 0.194 0.179 0.115 0.097 0.053 0.055 0.040 0.025 54 V 0.082 0.060 0.029 0.066 0.063 0.080 0.146 0.125 0.138 0.107 0.105 55 W 0.060 0.145 0.045 0.176 0.172 0.111 0.118 0.065 0.047 0.040 0.020 56 P 0.020 0.028 0.019 0.040 0.050 0.088 0.153 0.162 0.176 0.141 0.123 57 T 0.322 0.167 0.095 0.233 0.105 0.040 0.021 0.008 0.005 0.003 0.001 58 V 0.177 0.085 0.094 0.191 0.136 0.101 0.102 0.054 0.030 0.020 0.010 59 R 0.004 0.036 0.031 0.071 0.083 0.084 0.173 0.142 0.167 0.139 0.069 60 V 0.001 0.001 0.005 0.008 0.013 0.052 0.187 0.225 0.228 0.159 0.123 61 D 0.050 0.028 0.591 0.212 0.058 0.032 0.016 0.006 0.003 0.004 0.001 62 E 0.003 0.011 0.120 0.253 0.292 0.161 0.124 0.022 0.010 0.004 0.001 63 A 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.004 0.031 0.065 0.192 0.299 0.402 64 Y 0.001 0.004 0.038 0.056 0.078 0.222 0.371 0.108 0.068 0.036 0.019 65 R 0.012 0.020 0.791 0.106 0.044 0.014 0.007 0.003 0.002 0.001 0.001 66 D 0.036 0.034 0.084 0.134 0.179 0.235 0.239 0.035 0.014 0.007 0.003 67 G 0.398 0.134 0.051 0.098 0.065 0.059 0.080 0.037 0.036 0.022 0.020 68 L 0.003 0.003 0.005 0.009 0.014 0.035 0.088 0.137 0.215 0.201 0.291 69 D 0.044 0.176 0.228 0.257 0.165 0.062 0.039 0.014 0.009 0.004 0.002 70 A 0.002 0.005 0.009 0.010 0.015 0.032 0.103 0.173 0.231 0.209 0.212 71 I 0.001 0.003 0.003 0.006 0.011 0.022 0.070 0.142 0.221 0.234 0.287 72 S 0.001 0.001 0.003 0.003 0.005 0.010 0.046 0.130 0.217 0.277 0.307 73 L 0.001 0.001 0.004 0.004 0.006 0.009 0.041 0.098 0.201 0.308 0.327 74 T 0.001 0.002 0.004 0.006 0.010 0.018 0.066 0.104 0.205 0.272 0.311 75 E 0.006 0.010 0.010 0.038 0.065 0.080 0.163 0.214 0.186 0.126 0.103 76 H 0.013 0.016 0.014 0.053 0.082 0.092 0.176 0.179 0.152 0.123 0.099 77 I 0.022 0.020 0.018 0.058 0.074 0.094 0.163 0.156 0.157 0.133 0.105 78 E 0.157 0.122 0.060 0.196 0.147 0.109 0.082 0.053 0.036 0.024 0.014 79 Y 0.055 0.030 0.025 0.070 0.070 0.111 0.145 0.126 0.139 0.129 0.102 80 R 0.141 0.127 0.055 0.135 0.113 0.100 0.097 0.062 0.066 0.060 0.044 81 P 0.353 0.148 0.046 0.095 0.074 0.063 0.076 0.045 0.040 0.032 0.026 82 H 0.183 0.093 0.041 0.095 0.088 0.098 0.114 0.085 0.081 0.069 0.052 83 K 0.140 0.134 0.049 0.154 0.130 0.107 0.109 0.065 0.052 0.036 0.024 84 Q 0.242 0.120 0.048 0.141 0.121 0.095 0.097 0.058 0.039 0.024 0.015 85 D 0.150 0.115 0.060 0.146 0.131 0.120 0.113 0.068 0.049 0.032 0.017 86 V 0.020 0.029 0.025 0.061 0.058 0.088 0.166 0.162 0.158 0.138 0.094 87 V 0.016 0.017 0.023 0.056 0.066 0.093 0.179 0.173 0.154 0.133 0.089 88 S 0.103 0.102 0.120 0.159 0.129 0.106 0.104 0.064 0.050 0.042 0.021 89 D 0.058 0.134 0.089 0.209 0.144 0.132 0.115 0.046 0.036 0.025 0.012 90 H 0.009 0.007 0.007 0.015 0.023 0.036 0.104 0.175 0.222 0.203 0.199 91 N 0.106 0.073 0.090 0.168 0.156 0.165 0.124 0.053 0.031 0.024 0.009 92 R 0.046 0.095 0.228 0.327 0.162 0.068 0.042 0.017 0.008 0.005 0.002 93 S 0.001 0.002 0.005 0.005 0.007 0.016 0.090 0.164 0.272 0.248 0.190 94 F 0.001 0.004 0.014 0.032 0.055 0.153 0.307 0.180 0.131 0.086 0.038 95 D 0.070 0.032 0.742 0.109 0.016 0.017 0.007 0.003 0.002 0.002 0.001 96 L 0.001 0.004 0.037 0.072 0.117 0.242 0.357 0.109 0.040 0.016 0.006 97 C 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.003 0.023 0.071 0.207 0.372 0.318 98 R 0.001 0.003 0.131 0.129 0.291 0.225 0.170 0.032 0.009 0.006 0.001 99 E 0.009 0.014 0.904 0.051 0.012 0.007 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 100 Q 0.002 0.005 0.016 0.019 0.037 0.117 0.387 0.200 0.115 0.068 0.034 101 A 0.172 0.106 0.105 0.055 0.045 0.056 0.147 0.117 0.076 0.079 0.041 102 E 0.246 0.082 0.398 0.152 0.048 0.044 0.018 0.006 0.003 0.002 0.001 103 K 0.261 0.177 0.290 0.150 0.061 0.036 0.017 0.005 0.002 0.001 0.001 104 L 0.058 0.030 0.015 0.037 0.053 0.137 0.257 0.162 0.112 0.079 0.059 105 G 0.425 0.213 0.078 0.144 0.065 0.046 0.018 0.005 0.004 0.002 0.001 106 I 0.002 0.003 0.017 0.011 0.014 0.026 0.065 0.117 0.198 0.238 0.309 107 L 0.028 0.072 0.058 0.145 0.168 0.139 0.184 0.093 0.059 0.034 0.021 108 L 0.003 0.004 0.010 0.010 0.010 0.018 0.049 0.074 0.172 0.293 0.357 109 I 0.003 0.005 0.012 0.017 0.024 0.038 0.077 0.120 0.184 0.227 0.293 110 K 0.013 0.031 0.027 0.051 0.062 0.096 0.152 0.124 0.160 0.157 0.127 111 G 0.015 0.015 0.016 0.043 0.059 0.080 0.134 0.139 0.179 0.168 0.152 112 S 0.008 0.009 0.012 0.028 0.049 0.065 0.143 0.184 0.199 0.179 0.127 113 E 0.007 0.017 0.017 0.064 0.079 0.072 0.127 0.189 0.175 0.142 0.111 114 I 0.001 0.002 0.004 0.007 0.007 0.014 0.044 0.086 0.207 0.303 0.324 115 T 0.012 0.023 0.038 0.108 0.102 0.113 0.184 0.116 0.138 0.086 0.079 116 R 0.013 0.021 0.024 0.053 0.055 0.098 0.180 0.148 0.176 0.126 0.106 117 A 0.064 0.047 0.038 0.127 0.127 0.133 0.173 0.101 0.086 0.063 0.044 118 M 0.140 0.090 0.047 0.131 0.110 0.096 0.129 0.095 0.072 0.051 0.040 119 A 0.209 0.176 0.042 0.156 0.115 0.090 0.086 0.047 0.035 0.025 0.019 120 P 0.372 0.180 0.041 0.133 0.104 0.055 0.049 0.026 0.020 0.012 0.009 121 G 0.075 0.055 0.024 0.075 0.092 0.115 0.155 0.118 0.124 0.098 0.070 122 H 0.020 0.038 0.022 0.095 0.130 0.164 0.197 0.117 0.105 0.066 0.046 123 F 0.002 0.004 0.005 0.011 0.020 0.036 0.108 0.217 0.236 0.187 0.176 124 N 0.002 0.005 0.010 0.022 0.031 0.049 0.130 0.174 0.211 0.215 0.151 125 A 0.001 0.001 0.003 0.004 0.005 0.008 0.035 0.104 0.207 0.259 0.374 126 I 0.001 0.002 0.006 0.010 0.013 0.027 0.081 0.137 0.235 0.238 0.252 127 F 0.003 0.006 0.015 0.029 0.034 0.067 0.154 0.163 0.198 0.177 0.153 128 L 0.006 0.012 0.017 0.051 0.066 0.116 0.214 0.192 0.150 0.106 0.070 129 S 0.055 0.072 0.049 0.131 0.138 0.123 0.151 0.113 0.077 0.063 0.029 130 D 0.165 0.135 0.055 0.161 0.144 0.103 0.099 0.062 0.036 0.027 0.013 131 S 0.365 0.175 0.058 0.113 0.078 0.057 0.053 0.035 0.028 0.023 0.013 132 N 0.244 0.171 0.057 0.134 0.105 0.079 0.079 0.046 0.039 0.029 0.016 133 P 0.148 0.092 0.045 0.106 0.092 0.094 0.133 0.090 0.087 0.067 0.045 134 L 0.113 0.108 0.060 0.132 0.120 0.129 0.132 0.081 0.062 0.042 0.023 135 E 0.171 0.227 0.098 0.196 0.115 0.073 0.061 0.026 0.017 0.011 0.005 136 Q 0.055 0.042 0.031 0.091 0.110 0.124 0.187 0.137 0.107 0.066 0.050 137 K 0.308 0.144 0.096 0.140 0.102 0.066 0.066 0.032 0.023 0.016 0.008 138 D 0.114 0.212 0.126 0.231 0.127 0.077 0.065 0.022 0.014 0.010 0.004 139 Y 0.009 0.015 0.013 0.032 0.048 0.088 0.185 0.224 0.183 0.111 0.092 140 K 0.257 0.166 0.113 0.188 0.113 0.072 0.050 0.020 0.010 0.008 0.002 141 D 0.209 0.143 0.200 0.247 0.100 0.052 0.028 0.012 0.005 0.003 0.001 142 A 0.002 0.005 0.010 0.019 0.026 0.053 0.149 0.173 0.230 0.184 0.148 143 F 0.001 0.003 0.012 0.023 0.033 0.070 0.197 0.167 0.209 0.171 0.114 144 R 0.009 0.026 0.406 0.210 0.140 0.096 0.061 0.025 0.014 0.010 0.003 145 E 0.005 0.018 0.157 0.179 0.180 0.175 0.179 0.050 0.034 0.015 0.007 146 A 0.001 0.001 0.004 0.004 0.004 0.009 0.054 0.103 0.224 0.256 0.341 147 K 0.011 0.019 0.080 0.140 0.142 0.180 0.218 0.092 0.062 0.038 0.019 148 K 0.031 0.052 0.378 0.209 0.133 0.079 0.059 0.025 0.016 0.011 0.006 149 Q 0.046 0.044 0.056 0.107 0.127 0.171 0.233 0.102 0.061 0.035 0.019 150 G 0.427 0.143 0.042 0.093 0.060 0.057 0.072 0.037 0.035 0.021 0.013 151 A 0.036 0.025 0.023 0.045 0.051 0.074 0.137 0.128 0.179 0.158 0.145 152 F 0.023 0.039 0.037 0.077 0.092 0.112 0.182 0.152 0.136 0.079 0.072 153 M 0.005 0.009 0.011 0.023 0.029 0.046 0.123 0.151 0.224 0.197 0.180 154 F 0.002 0.003 0.005 0.008 0.011 0.019 0.063 0.118 0.211 0.224 0.336 155 W 0.004 0.006 0.009 0.018 0.024 0.043 0.102 0.129 0.201 0.213 0.251 156 N 0.006 0.008 0.012 0.033 0.043 0.060 0.131 0.182 0.206 0.165 0.155 157 H 0.007 0.008 0.010 0.026 0.034 0.049 0.127 0.178 0.206 0.175 0.180 158 P 0.021 0.018 0.016 0.044 0.049 0.072 0.149 0.151 0.190 0.166 0.125 159 G 0.056 0.052 0.033 0.117 0.119 0.146 0.159 0.124 0.090 0.062 0.042 160 W 0.033 0.030 0.021 0.071 0.084 0.121 0.166 0.148 0.139 0.112 0.075 161 D 0.154 0.141 0.054 0.146 0.129 0.088 0.092 0.063 0.055 0.049 0.031 162 S 0.272 0.147 0.045 0.111 0.099 0.075 0.083 0.061 0.046 0.036 0.024 163 Q 0.203 0.171 0.057 0.121 0.095 0.089 0.088 0.060 0.050 0.041 0.024 164 Q 0.119 0.125 0.047 0.145 0.136 0.116 0.130 0.075 0.050 0.037 0.021 165 P 0.489 0.130 0.052 0.092 0.061 0.052 0.053 0.031 0.020 0.013 0.007 166 D 0.252 0.218 0.081 0.190 0.112 0.062 0.044 0.020 0.012 0.008 0.003 167 T 0.027 0.040 0.025 0.059 0.063 0.088 0.176 0.155 0.159 0.122 0.087 168 T 0.072 0.061 0.054 0.153 0.172 0.190 0.164 0.067 0.037 0.020 0.009 169 K 0.304 0.143 0.288 0.159 0.051 0.026 0.015 0.006 0.004 0.003 0.001 170 W 0.007 0.029 0.031 0.071 0.079 0.138 0.239 0.174 0.118 0.075 0.040 171 W 0.002 0.004 0.007 0.012 0.023 0.051 0.145 0.230 0.203 0.191 0.133 172 P 0.223 0.083 0.415 0.165 0.047 0.036 0.016 0.006 0.003 0.003 0.001 173 E 0.019 0.047 0.222 0.299 0.192 0.125 0.066 0.017 0.008 0.004 0.001 174 H 0.001 0.001 0.002 0.002 0.003 0.006 0.045 0.105 0.248 0.280 0.309 175 T 0.002 0.007 0.027 0.070 0.121 0.275 0.302 0.102 0.053 0.029 0.011 176 A 0.026 0.027 0.819 0.086 0.019 0.011 0.006 0.002 0.002 0.002 0.001 177 L 0.002 0.007 0.026 0.040 0.063 0.161 0.346 0.174 0.096 0.052 0.033 178 Y 0.002 0.003 0.008 0.008 0.008 0.019 0.076 0.133 0.212 0.264 0.267 179 Q 0.033 0.051 0.250 0.235 0.223 0.108 0.060 0.021 0.009 0.007 0.003 180 E 0.094 0.112 0.422 0.196 0.097 0.042 0.024 0.008 0.004 0.002 0.001 181 G 0.217 0.068 0.037 0.089 0.081 0.124 0.180 0.079 0.064 0.038 0.022 182 C 0.020 0.015 0.012 0.023 0.026 0.049 0.125 0.136 0.205 0.196 0.192 183 M 0.030 0.052 0.066 0.094 0.096 0.132 0.175 0.101 0.113 0.076 0.065 184 H 0.012 0.027 0.039 0.050 0.072 0.091 0.169 0.146 0.175 0.128 0.091 185 G 0.007 0.008 0.011 0.020 0.027 0.048 0.117 0.142 0.191 0.194 0.235 186 I 0.001 0.002 0.003 0.006 0.009 0.016 0.050 0.118 0.200 0.261 0.335 187 E 0.003 0.007 0.015 0.030 0.042 0.054 0.113 0.203 0.192 0.161 0.179 188 V 0.002 0.003 0.009 0.012 0.013 0.025 0.076 0.108 0.212 0.289 0.252 189 A 0.011 0.013 0.022 0.050 0.051 0.084 0.176 0.152 0.183 0.131 0.126 190 N 0.025 0.027 0.026 0.081 0.090 0.125 0.186 0.164 0.133 0.086 0.057 191 G 0.071 0.062 0.040 0.109 0.112 0.120 0.150 0.111 0.099 0.081 0.046 192 H 0.131 0.088 0.052 0.149 0.136 0.100 0.123 0.074 0.069 0.049 0.030 193 L 0.110 0.068 0.037 0.088 0.076 0.090 0.138 0.104 0.117 0.103 0.070 194 Y 0.052 0.094 0.048 0.128 0.110 0.127 0.151 0.094 0.087 0.066 0.043 195 M 0.071 0.105 0.043 0.120 0.126 0.119 0.150 0.101 0.076 0.053 0.035 196 P 0.503 0.130 0.051 0.101 0.072 0.050 0.042 0.022 0.014 0.010 0.006 197 E 0.168 0.163 0.067 0.248 0.172 0.087 0.055 0.022 0.011 0.006 0.002 198 A 0.002 0.005 0.007 0.013 0.015 0.024 0.091 0.132 0.250 0.248 0.211 199 I 0.001 0.003 0.010 0.030 0.054 0.141 0.280 0.194 0.148 0.087 0.053 200 Q 0.027 0.046 0.471 0.256 0.082 0.054 0.031 0.015 0.009 0.007 0.002 201 W 0.001 0.004 0.027 0.055 0.080 0.161 0.310 0.179 0.105 0.048 0.029 202 C 0.001 0.001 0.005 0.003 0.003 0.005 0.031 0.066 0.198 0.311 0.377 203 L 0.002 0.005 0.072 0.114 0.146 0.245 0.250 0.077 0.048 0.027 0.014 204 D 0.018 0.038 0.548 0.180 0.115 0.050 0.031 0.010 0.005 0.003 0.002 205 K 0.028 0.019 0.034 0.073 0.091 0.188 0.318 0.123 0.065 0.040 0.021 206 N 0.552 0.181 0.050 0.095 0.042 0.026 0.024 0.011 0.009 0.006 0.004 207 L 0.010 0.009 0.013 0.022 0.027 0.051 0.113 0.166 0.207 0.185 0.198 208 T 0.079 0.146 0.082 0.163 0.145 0.131 0.125 0.052 0.043 0.020 0.014 209 M 0.002 0.004 0.004 0.005 0.008 0.016 0.065 0.115 0.216 0.266 0.299 210 I 0.003 0.004 0.005 0.007 0.012 0.022 0.077 0.141 0.212 0.222 0.295 211 G 0.001 0.001 0.003 0.003 0.005 0.008 0.034 0.080 0.169 0.275 0.422 212 T 0.002 0.003 0.005 0.009 0.017 0.021 0.064 0.113 0.192 0.233 0.341 213 S 0.003 0.004 0.006 0.013 0.027 0.037 0.098 0.155 0.214 0.207 0.235 214 D 0.007 0.011 0.011 0.038 0.067 0.081 0.156 0.191 0.185 0.141 0.112 215 I 0.009 0.010 0.012 0.032 0.046 0.060 0.122 0.155 0.189 0.196 0.170 216 H 0.016 0.018 0.019 0.055 0.077 0.104 0.154 0.160 0.160 0.131 0.107 217 Q 0.049 0.062 0.048 0.117 0.129 0.115 0.136 0.110 0.098 0.083 0.054 218 P 0.041 0.031 0.031 0.063 0.070 0.082 0.134 0.130 0.142 0.155 0.121 219 I 0.083 0.076 0.048 0.131 0.129 0.113 0.133 0.094 0.081 0.067 0.045 220 Q 0.157 0.140 0.071 0.141 0.110 0.089 0.096 0.065 0.056 0.046 0.029 221 T 0.147 0.096 0.054 0.127 0.129 0.117 0.130 0.078 0.058 0.041 0.023 222 D 0.210 0.130 0.070 0.156 0.113 0.083 0.090 0.053 0.043 0.032 0.019 223 Y 0.046 0.039 0.035 0.080 0.090 0.128 0.180 0.145 0.121 0.081 0.055 224 D 0.168 0.186 0.113 0.168 0.115 0.072 0.078 0.041 0.028 0.021 0.010 225 F 0.028 0.025 0.026 0.066 0.078 0.121 0.190 0.183 0.130 0.090 0.062 226 E 0.440 0.190 0.096 0.121 0.055 0.034 0.026 0.015 0.011 0.008 0.004 227 K 0.223 0.138 0.057 0.147 0.120 0.095 0.103 0.050 0.033 0.023 0.013 228 G 0.292 0.107 0.034 0.081 0.078 0.084 0.108 0.074 0.067 0.043 0.033 229 E 0.227 0.191 0.060 0.155 0.118 0.086 0.077 0.032 0.028 0.017 0.009 230 H 0.129 0.088 0.060 0.128 0.117 0.108 0.135 0.090 0.070 0.043 0.032 231 R 0.084 0.064 0.034 0.107 0.129 0.158 0.170 0.100 0.073 0.051 0.030 232 T 0.030 0.064 0.053 0.186 0.161 0.171 0.140 0.079 0.059 0.037 0.020 233 M 0.003 0.004 0.010 0.020 0.027 0.049 0.111 0.189 0.210 0.209 0.167 234 T 0.005 0.012 0.031 0.077 0.092 0.131 0.193 0.157 0.132 0.115 0.054 235 F 0.003 0.016 0.061 0.119 0.122 0.116 0.160 0.163 0.116 0.084 0.040 236 V 0.001 0.002 0.013 0.012 0.011 0.025 0.089 0.133 0.219 0.286 0.208 237 F 0.003 0.009 0.035 0.057 0.053 0.073 0.191 0.160 0.180 0.152 0.088 238 A 0.006 0.023 0.078 0.098 0.097 0.136 0.184 0.128 0.114 0.094 0.043 239 K 0.047 0.074 0.125 0.201 0.206 0.140 0.127 0.039 0.021 0.015 0.004 240 E 0.260 0.111 0.112 0.180 0.106 0.071 0.080 0.036 0.023 0.016 0.006 241 R 0.157 0.085 0.060 0.098 0.107 0.100 0.151 0.102 0.068 0.047 0.026 242 S 0.121 0.374 0.138 0.133 0.072 0.046 0.055 0.024 0.018 0.012 0.005 243 L 0.020 0.030 0.034 0.072 0.090 0.190 0.251 0.149 0.090 0.045 0.029 244 Q 0.681 0.103 0.129 0.058 0.014 0.006 0.004 0.002 0.001 0.001 0.001 245 G 0.093 0.128 0.103 0.242 0.163 0.139 0.086 0.027 0.012 0.006 0.002 246 I 0.006 0.009 0.015 0.020 0.025 0.043 0.115 0.141 0.215 0.208 0.204 247 R 0.016 0.025 0.098 0.159 0.191 0.224 0.183 0.055 0.029 0.015 0.005 248 E 0.032 0.055 0.621 0.165 0.072 0.026 0.016 0.007 0.004 0.002 0.001 249 A 0.005 0.012 0.028 0.035 0.043 0.103 0.261 0.172 0.167 0.109 0.065 250 L 0.017 0.021 0.036 0.054 0.063 0.103 0.227 0.168 0.144 0.105 0.061 251 D 0.114 0.123 0.352 0.188 0.096 0.054 0.037 0.017 0.009 0.007 0.003 252 N 0.117 0.121 0.176 0.166 0.131 0.112 0.095 0.040 0.023 0.013 0.006 253 R 0.194 0.104 0.059 0.107 0.098 0.096 0.138 0.081 0.062 0.043 0.020 254 R 0.154 0.107 0.098 0.212 0.152 0.117 0.082 0.037 0.023 0.013 0.006 255 T 0.024 0.042 0.108 0.125 0.126 0.144 0.174 0.112 0.076 0.045 0.024 256 A 0.019 0.044 0.058 0.112 0.125 0.126 0.203 0.116 0.102 0.062 0.033 257 A 0.010 0.012 0.034 0.032 0.031 0.054 0.133 0.131 0.206 0.200 0.158 258 Y 0.016 0.044 0.126 0.185 0.189 0.114 0.140 0.080 0.053 0.036 0.017 259 F 0.009 0.035 0.046 0.052 0.050 0.086 0.182 0.144 0.162 0.143 0.092 260 H 0.060 0.060 0.058 0.160 0.181 0.159 0.156 0.076 0.044 0.031 0.014 261 E 0.525 0.127 0.138 0.113 0.041 0.022 0.015 0.009 0.005 0.004 0.001 262 L 0.021 0.035 0.044 0.144 0.150 0.179 0.185 0.110 0.071 0.041 0.021 263 L 0.010 0.015 0.029 0.030 0.033 0.047 0.136 0.159 0.204 0.192 0.145 264 I 0.027 0.042 0.189 0.183 0.172 0.143 0.127 0.056 0.033 0.021 0.008 265 G 0.055 0.074 0.346 0.160 0.092 0.090 0.081 0.039 0.031 0.022 0.009 266 R 0.020 0.029 0.035 0.070 0.080 0.131 0.240 0.145 0.119 0.085 0.045 267 E 0.159 0.089 0.074 0.125 0.118 0.122 0.134 0.071 0.055 0.035 0.018 268 D 0.316 0.139 0.197 0.148 0.081 0.046 0.035 0.016 0.011 0.008 0.004 269 L 0.032 0.052 0.055 0.114 0.109 0.142 0.207 0.126 0.086 0.052 0.027 270 L 0.007 0.012 0.014 0.019 0.025 0.039 0.126 0.163 0.217 0.214 0.164 271 R 0.050 0.068 0.111 0.197 0.180 0.195 0.121 0.042 0.020 0.012 0.005 272 P 0.239 0.116 0.286 0.175 0.064 0.051 0.033 0.015 0.010 0.007 0.003 273 F 0.003 0.009 0.011 0.027 0.036 0.067 0.170 0.216 0.189 0.161 0.110 274 F 0.002 0.004 0.011 0.015 0.020 0.044 0.131 0.185 0.202 0.216 0.169 275 E 0.058 0.053 0.456 0.206 0.103 0.061 0.032 0.013 0.007 0.007 0.002 276 K 0.015 0.056 0.192 0.234 0.175 0.170 0.114 0.026 0.012 0.005 0.002 277 C 0.003 0.004 0.007 0.009 0.011 0.019 0.085 0.119 0.245 0.262 0.238 278 V 0.013 0.014 0.038 0.064 0.092 0.232 0.278 0.122 0.074 0.049 0.024 279 K 0.019 0.061 0.620 0.204 0.065 0.018 0.007 0.003 0.002 0.001 0.001 280 I 0.001 0.002 0.008 0.009 0.013 0.043 0.155 0.229 0.221 0.174 0.145 281 E 0.015 0.019 0.053 0.084 0.095 0.101 0.213 0.137 0.126 0.116 0.041 282 E 0.064 0.067 0.511 0.187 0.081 0.047 0.023 0.009 0.005 0.004 0.001 283 V 0.011 0.025 0.120 0.109 0.119 0.187 0.219 0.099 0.059 0.032 0.018 284 S 0.040 0.037 0.038 0.044 0.045 0.071 0.190 0.148 0.160 0.153 0.075 285 R 0.252 0.245 0.174 0.152 0.076 0.045 0.030 0.013 0.007 0.005 0.002 286 N 0.290 0.144 0.165 0.170 0.099 0.061 0.039 0.017 0.009 0.004 0.002 287 E 0.405 0.145 0.057 0.094 0.072 0.059 0.068 0.033 0.031 0.024 0.013 288 Q 0.141 0.157 0.047 0.187 0.152 0.123 0.112 0.039 0.025 0.011 0.007 289 G 0.049 0.049 0.057 0.062 0.057 0.070 0.115 0.107 0.154 0.147 0.134 290 V 0.036 0.069 0.054 0.148 0.150 0.210 0.180 0.071 0.043 0.026 0.013 291 T 0.214 0.224 0.117 0.256 0.093 0.046 0.026 0.010 0.007 0.005 0.003 292 L 0.010 0.006 0.005 0.013 0.024 0.039 0.095 0.234 0.202 0.179 0.194 293 S 0.119 0.324 0.081 0.198 0.132 0.054 0.041 0.020 0.014 0.013 0.005 294 I 0.006 0.008 0.012 0.027 0.028 0.053 0.113 0.151 0.194 0.221 0.187 295 T 0.357 0.245 0.112 0.154 0.072 0.023 0.017 0.009 0.006 0.004 0.002 296 N 0.199 0.291 0.054 0.143 0.110 0.063 0.067 0.032 0.021 0.015 0.006 297 V 0.193 0.145 0.033 0.111 0.117 0.110 0.109 0.065 0.055 0.037 0.025 298 T 0.310 0.143 0.067 0.129 0.116 0.093 0.082 0.031 0.016 0.009 0.004 299 D 0.255 0.232 0.173 0.194 0.080 0.030 0.020 0.010 0.004 0.003 0.001 300 L 0.010 0.019 0.017 0.034 0.044 0.086 0.221 0.203 0.184 0.116 0.065 301 V 0.012 0.026 0.046 0.130 0.161 0.211 0.215 0.099 0.057 0.033 0.012 302 L 0.121 0.063 0.457 0.186 0.064 0.052 0.033 0.011 0.007 0.005 0.001 303 K 0.006 0.016 0.086 0.145 0.172 0.207 0.220 0.081 0.041 0.018 0.008 304 L 0.001 0.001 0.005 0.003 0.004 0.008 0.048 0.112 0.228 0.302 0.288 305 K 0.003 0.011 0.183 0.201 0.295 0.136 0.112 0.031 0.015 0.011 0.002 306 K 0.017 0.029 0.631 0.149 0.099 0.035 0.025 0.008 0.004 0.003 0.001 307 T 0.022 0.026 0.055 0.063 0.081 0.151 0.309 0.127 0.088 0.055 0.022 308 A 0.054 0.061 0.049 0.050 0.047 0.084 0.210 0.166 0.136 0.096 0.046 309 H 0.163 0.158 0.216 0.164 0.098 0.068 0.061 0.035 0.019 0.013 0.005 310 D 0.356 0.130 0.183 0.123 0.075 0.058 0.042 0.019 0.009 0.005 0.002 311 T 0.318 0.193 0.102 0.148 0.083 0.061 0.050 0.020 0.013 0.009 0.003 312 L 0.020 0.018 0.022 0.045 0.057 0.110 0.204 0.161 0.163 0.110 0.089 313 L 0.037 0.055 0.176 0.191 0.172 0.133 0.111 0.052 0.038 0.024 0.011 314 V 0.034 0.059 0.305 0.197 0.152 0.101 0.082 0.032 0.021 0.013 0.005 315 Y 0.013 0.030 0.063 0.081 0.086 0.115 0.220 0.157 0.116 0.078 0.042 316 F 0.008 0.016 0.025 0.040 0.046 0.090 0.194 0.175 0.188 0.144 0.075 317 R 0.156 0.144 0.247 0.194 0.121 0.057 0.043 0.018 0.010 0.008 0.002 318 D 0.232 0.159 0.142 0.211 0.109 0.063 0.050 0.017 0.009 0.005 0.002 319 M 0.035 0.034 0.017 0.038 0.055 0.085 0.184 0.178 0.171 0.118 0.085 320 T 0.178 0.449 0.087 0.124 0.082 0.027 0.029 0.012 0.006 0.004 0.001 321 L 0.291 0.133 0.145 0.120 0.079 0.078 0.073 0.044 0.020 0.011 0.005 322 K 0.472 0.270 0.121 0.085 0.026 0.012 0.007 0.003 0.002 0.001 0.001 323 P 0.136 0.122 0.044 0.138 0.111 0.150 0.185 0.069 0.027 0.012 0.005 324 H 0.216 0.085 0.119 0.130 0.119 0.121 0.099 0.054 0.030 0.019 0.008 325 T 0.097 0.082 0.318 0.252 0.118 0.079 0.037 0.009 0.004 0.002 0.001 326 R 0.009 0.022 0.123 0.086 0.089 0.130 0.201 0.116 0.112 0.074 0.038 327 Y 0.004 0.009 0.034 0.043 0.078 0.139 0.240 0.175 0.139 0.090 0.049 328 T 0.031 0.053 0.478 0.217 0.123 0.046 0.027 0.010 0.007 0.006 0.001 329 V 0.007 0.016 0.110 0.081 0.118 0.144 0.225 0.143 0.085 0.050 0.022 330 R 0.026 0.051 0.078 0.085 0.078 0.085 0.190 0.123 0.132 0.103 0.048 331 I 0.008 0.009 0.029 0.036 0.046 0.105 0.222 0.174 0.176 0.121 0.074 332 G 0.159 0.163 0.358 0.182 0.066 0.029 0.019 0.010 0.007 0.006 0.002 333 F 0.016 0.021 0.026 0.060 0.072 0.154 0.239 0.155 0.128 0.080 0.049 334 K 0.083 0.088 0.072 0.169 0.142 0.111 0.114 0.066 0.066 0.054 0.034 335 Q 0.086 0.094 0.123 0.182 0.200 0.109 0.109 0.046 0.028 0.015 0.008 336 G 0.078 0.094 0.143 0.211 0.162 0.108 0.094 0.052 0.035 0.016 0.008 337 I 0.007 0.007 0.014 0.019 0.018 0.036 0.102 0.111 0.228 0.246 0.214 338 K 0.013 0.033 0.046 0.120 0.129 0.144 0.200 0.131 0.097 0.054 0.032 339 G 0.083 0.136 0.140 0.166 0.128 0.090 0.094 0.055 0.049 0.037 0.021 340 G 0.038 0.021 0.020 0.039 0.047 0.072 0.154 0.167 0.165 0.144 0.133 341 D 0.221 0.178 0.050 0.135 0.098 0.076 0.079 0.056 0.048 0.037 0.021 342 V 0.098 0.064 0.035 0.106 0.093 0.112 0.142 0.106 0.104 0.084 0.056 343 N 0.089 0.113 0.053 0.204 0.195 0.126 0.093 0.050 0.039 0.024 0.016 344 F 0.032 0.020 0.014 0.029 0.033 0.053 0.114 0.135 0.191 0.187 0.193 345 E 0.053 0.112 0.058 0.227 0.204 0.125 0.097 0.050 0.036 0.026 0.012 346 V 0.004 0.005 0.009 0.013 0.013 0.024 0.063 0.123 0.215 0.254 0.276 347 T 0.022 0.039 0.039 0.167 0.171 0.172 0.153 0.082 0.071 0.058 0.026 348 N 0.077 0.093 0.100 0.188 0.132 0.113 0.117 0.066 0.056 0.041 0.018 349 F 0.012 0.027 0.026 0.106 0.113 0.138 0.189 0.142 0.127 0.074 0.046 350 I 0.006 0.007 0.013 0.018 0.018 0.029 0.093 0.132 0.228 0.251 0.207 351 V 0.016 0.059 0.100 0.212 0.207 0.110 0.134 0.066 0.046 0.033 0.017 352 A 0.012 0.041 0.056 0.087 0.093 0.137 0.186 0.123 0.115 0.085 0.065 353 P 0.301 0.263 0.089 0.198 0.086 0.027 0.019 0.008 0.005 0.003 0.001 354 D 0.511 0.144 0.035 0.110 0.083 0.042 0.039 0.019 0.009 0.005 0.003 355 K 0.240 0.211 0.052 0.166 0.129 0.076 0.060 0.027 0.019 0.012 0.007 356 G 0.129 0.109 0.049 0.165 0.140 0.123 0.141 0.061 0.047 0.021 0.014 357 L 0.005 0.007 0.015 0.020 0.027 0.046 0.112 0.145 0.226 0.218 0.179 358 K 0.019 0.055 0.062 0.184 0.189 0.157 0.156 0.073 0.055 0.032 0.018 359 Y 0.005 0.012 0.021 0.032 0.038 0.053 0.121 0.180 0.205 0.179 0.153 360 T 0.008 0.009 0.019 0.029 0.031 0.049 0.109 0.134 0.195 0.217 0.200 361 I 0.008 0.011 0.025 0.034 0.033 0.060 0.130 0.162 0.194 0.182 0.160 362 S 0.016 0.027 0.054 0.095 0.094 0.117 0.156 0.135 0.132 0.107 0.068 363 L 0.027 0.024 0.039 0.063 0.073 0.105 0.173 0.145 0.152 0.124 0.075