This file specifies which residues will be varied Column 2: Chain Column 4-7: sequential residue number Column 9-12: pdb residue number Column 14-18: id (described below) Column 21-40: amino acids to be used NATAA => use native amino acid ALLAA => all amino acids NATRO => native amino acid and rotamer PIKAA => select inividual amino acids POLAR => polar amino acids APOLA => apolar amino acids The following demo lines are in the proper format A 1 3 NATAA A 2 4 ALLAA A 3 6 NATRO A 4 7 NATAA B 5 1 PIKAA DFLM B 6 2 PIKAA HIL B 7 3 POLAR ------------------------------------------------- start A 1 241 NATAA R A 2 242 NATAA S A 3 243 NATAA L A 4 244 NATAA Q A 5 245 NATAA G A 6 246 NATAA I A 7 247 NATAA R A 8 248 NATAA E A 9 249 NATAA A A 10 250 NATAA L A 11 251 NATAA D A 12 252 NATAA N A 13 253 NATAA R A 14 254 NATAA R A 15 255 NATAA T A 16 256 NATAA A A 17 257 NATAA A A 18 258 NATAA Y A 19 259 NATAA F A 20 260 NATAA H A 21 261 NATAA E A 22 262 NATAA L A 23 263 NATAA L A 24 264 NATAA I A 25 265 NATAA G A 26 266 NATAA R A 27 267 NATAA E A 28 268 NATAA D A 29 269 NATAA L A 30 270 NATAA L A 31 271 NATAA R A 32 272 NATRO P A 33 273 NATAA F A 34 274 NATAA F A 35 275 NATAA E A 36 276 NATAA K A 37 277 NATRO C A 38 278 NATAA V A 39 279 NATAA K A 40 280 NATAA I A 41 281 NATAA E A 42 282 NATAA E A 43 283 NATAA V A 44 284 NATAA S A 45 285 NATAA R A 46 286 NATAA N A 47 287 NATAA E A 48 288 NATAA Q A 49 289 NATAA G A 50 290 NATAA V A 51 291 NATAA T A 52 292 NATAA L A 53 293 NATAA S A 54 294 NATAA I A 55 295 NATAA T A 56 296 NATAA N A 57 297 NATAA V A 58 298 NATAA T A 59 299 NATAA D A 60 300 NATAA L A 61 301 NATAA V A 62 302 NATAA L A 63 303 NATAA K A 64 304 NATAA L A 65 305 NATAA K A 66 306 NATAA K A 67 307 NATAA T A 68 308 NATAA A A 69 309 NATAA H A 70 310 NATAA D A 71 311 NATAA T A 72 312 NATAA L A 73 313 NATAA L A 74 314 NATAA V A 75 315 NATAA Y A 76 316 NATAA F A 77 317 NATAA R A 78 318 NATAA D A 79 319 NATAA M A 80 320 NATAA T A 81 321 NATAA L A 82 322 NATAA K A 83 323 NATRO P A 84 324 NATAA H A 85 325 NATAA T A 86 326 NATAA R A 87 327 NATAA Y A 88 328 NATAA T A 89 329 NATAA V A 90 330 NATAA R A 91 331 NATAA I A 92 332 NATAA G A 93 333 NATAA F A 94 334 NATAA K A 95 335 NATAA Q A 96 336 NATAA G A 97 337 NATAA I A 98 338 NATAA K A 99 339 NATAA G A 100 340 NATAA G A 101 341 NATAA D A 102 342 NATAA V A 103 343 NATAA N A 104 344 NATAA F A 105 345 NATAA E A 106 346 NATAA V A 107 347 NATAA T A 108 348 NATAA N A 109 349 NATAA F A 110 350 NATAA I A 111 351 NATAA V A 112 352 NATAA A A 113 353 NATRO P A 114 354 NATAA D A 115 355 NATAA K A 116 356 NATAA G A 117 357 NATAA L A 118 358 NATAA K A 119 359 NATAA Y A 120 360 NATAA T A 121 361 NATAA I A 122 362 NATAA S A 123 363 NATAA L