# TARGET T0278 # Using neural net t04-2621-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0278.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1975 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.252 0.126 0.065 0.108 0.092 0.083 0.092 0.068 0.055 0.036 0.021 2 K 0.381 0.188 0.065 0.133 0.085 0.052 0.044 0.024 0.015 0.009 0.004 3 R 0.245 0.171 0.068 0.180 0.141 0.087 0.060 0.027 0.014 0.006 0.002 4 L 0.008 0.017 0.008 0.030 0.048 0.081 0.166 0.189 0.195 0.160 0.099 5 S 0.285 0.284 0.097 0.164 0.079 0.035 0.025 0.012 0.009 0.005 0.005 6 L 0.084 0.030 0.010 0.042 0.053 0.068 0.150 0.162 0.170 0.128 0.104 7 R 0.235 0.197 0.064 0.158 0.109 0.081 0.072 0.034 0.024 0.014 0.011 8 E 0.217 0.167 0.066 0.187 0.128 0.086 0.071 0.033 0.024 0.014 0.007 9 A 0.136 0.098 0.037 0.129 0.112 0.103 0.128 0.096 0.076 0.054 0.030 10 W 0.005 0.017 0.017 0.061 0.088 0.139 0.220 0.175 0.141 0.091 0.047 11 P 0.007 0.017 0.020 0.059 0.076 0.108 0.188 0.179 0.159 0.115 0.071 12 Y 0.010 0.013 0.013 0.046 0.058 0.072 0.157 0.189 0.187 0.147 0.107 13 L 0.012 0.012 0.012 0.033 0.036 0.050 0.122 0.169 0.228 0.186 0.141 14 K 0.062 0.078 0.059 0.179 0.149 0.129 0.131 0.087 0.073 0.036 0.017 15 D 0.081 0.117 0.061 0.158 0.131 0.120 0.139 0.086 0.058 0.034 0.015 16 L 0.032 0.021 0.012 0.033 0.043 0.050 0.117 0.149 0.202 0.194 0.146 17 Q 0.139 0.135 0.056 0.149 0.133 0.119 0.135 0.062 0.041 0.020 0.011 18 Q 0.187 0.124 0.071 0.166 0.123 0.094 0.094 0.058 0.043 0.027 0.014 19 D 0.333 0.216 0.054 0.123 0.085 0.058 0.051 0.033 0.024 0.016 0.008 20 P 0.047 0.108 0.027 0.080 0.076 0.106 0.156 0.131 0.125 0.093 0.051 21 L 0.012 0.016 0.008 0.043 0.095 0.149 0.224 0.160 0.144 0.093 0.057 22 A 0.375 0.163 0.148 0.143 0.073 0.042 0.031 0.012 0.008 0.004 0.002 23 V 0.003 0.018 0.027 0.157 0.191 0.177 0.198 0.115 0.070 0.032 0.013 24 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.006 0.037 0.098 0.220 0.300 0.332 25 L 0.001 0.003 0.029 0.152 0.247 0.274 0.184 0.059 0.033 0.014 0.005 26 E 0.012 0.047 0.564 0.200 0.089 0.049 0.027 0.007 0.003 0.001 0.001 27 W 0.001 0.001 0.003 0.008 0.015 0.051 0.241 0.230 0.215 0.153 0.082 28 G 0.001 0.001 0.003 0.006 0.009 0.020 0.117 0.185 0.268 0.250 0.141 29 R 0.005 0.030 0.375 0.311 0.178 0.070 0.022 0.006 0.003 0.001 0.001 30 A 0.032 0.110 0.270 0.198 0.169 0.131 0.069 0.014 0.005 0.002 0.001 31 H 0.002 0.004 0.002 0.014 0.027 0.071 0.223 0.244 0.206 0.139 0.068 32 P 0.366 0.189 0.026 0.088 0.080 0.070 0.081 0.046 0.029 0.016 0.010 33 R 0.266 0.160 0.100 0.196 0.123 0.075 0.043 0.019 0.011 0.006 0.003 34 L 0.009 0.014 0.008 0.036 0.056 0.088 0.199 0.201 0.197 0.128 0.064 35 F 0.010 0.018 0.012 0.047 0.052 0.084 0.168 0.174 0.179 0.135 0.121 36 L 0.010 0.013 0.009 0.028 0.036 0.062 0.136 0.173 0.211 0.196 0.126 37 P 0.072 0.070 0.037 0.128 0.104 0.123 0.152 0.120 0.095 0.060 0.039 38 L 0.032 0.021 0.007 0.029 0.033 0.053 0.135 0.168 0.192 0.174 0.157 39 P 0.164 0.104 0.034 0.122 0.089 0.081 0.102 0.080 0.084 0.073 0.067 40 R 0.197 0.181 0.061 0.197 0.138 0.087 0.068 0.031 0.021 0.012 0.007 41 F 0.038 0.058 0.030 0.115 0.123 0.103 0.148 0.140 0.114 0.081 0.050 42 P 0.015 0.034 0.025 0.120 0.186 0.187 0.206 0.122 0.064 0.030 0.013 43 L 0.001 0.002 0.002 0.014 0.038 0.093 0.222 0.232 0.187 0.125 0.085 44 A 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.010 0.054 0.146 0.232 0.285 0.267 45 L 0.001 0.001 0.001 0.003 0.006 0.014 0.080 0.161 0.248 0.251 0.235 46 I 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.006 0.035 0.090 0.210 0.306 0.349 47 F 0.001 0.002 0.001 0.015 0.030 0.049 0.125 0.201 0.232 0.207 0.137 48 D 0.004 0.088 0.019 0.109 0.118 0.126 0.185 0.150 0.104 0.067 0.031 49 P 0.018 0.030 0.018 0.127 0.243 0.229 0.175 0.082 0.047 0.021 0.010 50 E 0.647 0.166 0.038 0.077 0.037 0.017 0.011 0.003 0.002 0.001 0.001 51 G 0.002 0.011 0.007 0.093 0.123 0.171 0.255 0.163 0.104 0.049 0.023 52 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.024 0.069 0.199 0.308 0.394 53 E 0.001 0.002 0.014 0.094 0.185 0.310 0.245 0.085 0.040 0.017 0.007 54 G 0.001 0.017 0.199 0.246 0.196 0.170 0.101 0.039 0.019 0.009 0.003 55 A 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.017 0.105 0.168 0.216 0.265 0.221 56 L 0.001 0.001 0.002 0.003 0.004 0.007 0.054 0.137 0.234 0.312 0.247 57 L 0.001 0.005 0.081 0.162 0.266 0.200 0.154 0.071 0.038 0.017 0.007 58 A 0.012 0.052 0.171 0.207 0.176 0.181 0.137 0.038 0.017 0.007 0.002 59 E 0.142 0.099 0.039 0.116 0.108 0.119 0.191 0.097 0.054 0.027 0.007 60 G 0.279 0.091 0.025 0.064 0.048 0.063 0.113 0.097 0.093 0.073 0.052 61 T 0.262 0.268 0.090 0.136 0.088 0.056 0.045 0.023 0.017 0.010 0.006 62 T 0.196 0.175 0.070 0.138 0.097 0.083 0.093 0.057 0.044 0.029 0.018 63 K 0.239 0.138 0.065 0.145 0.125 0.098 0.087 0.044 0.031 0.017 0.010 64 A 0.169 0.088 0.077 0.139 0.116 0.108 0.121 0.075 0.054 0.033 0.018 65 T 0.170 0.178 0.110 0.208 0.138 0.085 0.058 0.025 0.016 0.008 0.004 66 F 0.020 0.024 0.024 0.047 0.061 0.090 0.162 0.177 0.166 0.137 0.089 67 Q 0.233 0.205 0.081 0.150 0.110 0.074 0.069 0.033 0.023 0.015 0.009 68 Y 0.044 0.035 0.034 0.069 0.078 0.101 0.163 0.134 0.149 0.112 0.081 69 R 0.121 0.111 0.070 0.182 0.142 0.117 0.107 0.055 0.046 0.029 0.020 70 A 0.051 0.062 0.054 0.112 0.106 0.116 0.152 0.108 0.104 0.074 0.060 71 L 0.020 0.013 0.012 0.029 0.034 0.056 0.137 0.156 0.202 0.187 0.155 72 S 0.030 0.029 0.050 0.083 0.094 0.140 0.198 0.129 0.114 0.075 0.057 73 R 0.080 0.122 0.217 0.252 0.118 0.081 0.060 0.029 0.020 0.012 0.009 74 L 0.009 0.014 0.020 0.036 0.050 0.083 0.160 0.148 0.175 0.162 0.144 75 T 0.019 0.024 0.020 0.047 0.049 0.056 0.113 0.124 0.182 0.181 0.184 76 G 0.079 0.064 0.041 0.108 0.128 0.125 0.158 0.106 0.091 0.057 0.043 77 R 0.041 0.075 0.060 0.177 0.181 0.168 0.149 0.076 0.042 0.021 0.010 78 G 0.016 0.019 0.015 0.053 0.084 0.133 0.201 0.174 0.136 0.102 0.067 79 L 0.001 0.001 0.001 0.004 0.006 0.014 0.062 0.124 0.227 0.256 0.303 80 L 0.001 0.002 0.002 0.007 0.010 0.022 0.089 0.140 0.233 0.255 0.240 81 T 0.001 0.003 0.003 0.009 0.011 0.020 0.078 0.138 0.232 0.245 0.261 82 D 0.025 0.024 0.017 0.058 0.074 0.099 0.179 0.173 0.146 0.119 0.087 83 W 0.018 0.110 0.037 0.137 0.142 0.142 0.165 0.104 0.071 0.049 0.026 84 G 0.075 0.108 0.040 0.140 0.171 0.139 0.138 0.078 0.059 0.032 0.020 85 K 0.754 0.120 0.043 0.054 0.018 0.006 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 86 S 0.075 0.135 0.071 0.208 0.176 0.142 0.123 0.038 0.020 0.008 0.004 87 W 0.003 0.003 0.004 0.009 0.013 0.042 0.141 0.186 0.244 0.205 0.150 88 K 0.029 0.027 0.093 0.243 0.233 0.189 0.123 0.037 0.017 0.007 0.003 89 E 0.016 0.038 0.632 0.165 0.077 0.041 0.020 0.006 0.003 0.001 0.001 90 A 0.003 0.006 0.033 0.041 0.049 0.114 0.286 0.191 0.148 0.090 0.039 91 R 0.003 0.003 0.023 0.021 0.031 0.060 0.203 0.221 0.212 0.157 0.065 92 K 0.010 0.039 0.586 0.183 0.106 0.044 0.020 0.007 0.003 0.001 0.001 93 A 0.011 0.033 0.234 0.113 0.152 0.168 0.170 0.059 0.036 0.018 0.006 94 L 0.013 0.008 0.016 0.015 0.019 0.037 0.149 0.158 0.207 0.206 0.173 95 K 0.052 0.111 0.087 0.149 0.165 0.139 0.146 0.073 0.045 0.024 0.009 96 D 0.339 0.216 0.212 0.118 0.054 0.027 0.017 0.008 0.005 0.003 0.001 97 P 0.226 0.057 0.037 0.081 0.082 0.085 0.165 0.097 0.084 0.057 0.030 98 F 0.062 0.045 0.024 0.049 0.064 0.088 0.167 0.144 0.153 0.122 0.083 99 L 0.053 0.336 0.117 0.206 0.109 0.064 0.048 0.027 0.021 0.013 0.008 100 P 0.229 0.092 0.068 0.144 0.141 0.127 0.092 0.049 0.033 0.017 0.009 101 K 0.729 0.127 0.048 0.046 0.024 0.012 0.009 0.003 0.002 0.001 0.001 102 S 0.018 0.069 0.064 0.230 0.203 0.162 0.150 0.056 0.031 0.013 0.005 103 V 0.011 0.007 0.010 0.014 0.017 0.030 0.094 0.137 0.202 0.233 0.245 104 R 0.042 0.087 0.298 0.313 0.159 0.061 0.029 0.007 0.003 0.001 0.001 105 G 0.098 0.175 0.350 0.200 0.097 0.046 0.024 0.006 0.003 0.001 0.001 106 Y 0.002 0.006 0.008 0.019 0.024 0.063 0.189 0.175 0.193 0.179 0.142 107 R 0.023 0.041 0.054 0.106 0.169 0.205 0.267 0.081 0.038 0.012 0.004 108 E 0.299 0.125 0.439 0.104 0.022 0.007 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 109 A 0.007 0.026 0.075 0.159 0.189 0.226 0.203 0.069 0.029 0.013 0.004 110 M 0.001 0.002 0.010 0.005 0.006 0.021 0.117 0.183 0.257 0.226 0.172 111 E 0.002 0.009 0.094 0.220 0.302 0.231 0.112 0.022 0.007 0.002 0.001 112 E 0.045 0.061 0.727 0.115 0.033 0.013 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 113 E 0.001 0.002 0.023 0.037 0.058 0.113 0.316 0.192 0.141 0.083 0.035 114 A 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.004 0.065 0.137 0.248 0.291 0.251 115 W 0.001 0.001 0.204 0.307 0.304 0.137 0.035 0.008 0.003 0.001 0.001 116 A 0.002 0.014 0.512 0.138 0.144 0.117 0.055 0.011 0.004 0.002 0.001 117 F 0.001 0.001 0.002 0.003 0.007 0.027 0.201 0.221 0.265 0.174 0.099 118 F 0.001 0.001 0.003 0.004 0.010 0.024 0.182 0.241 0.239 0.192 0.104 119 G 0.013 0.046 0.664 0.176 0.070 0.021 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 120 E 0.033 0.081 0.254 0.173 0.192 0.141 0.098 0.017 0.008 0.002 0.001 121 W 0.003 0.002 0.002 0.004 0.007 0.017 0.084 0.140 0.251 0.269 0.220 122 R 0.120 0.187 0.051 0.152 0.140 0.133 0.130 0.045 0.024 0.011 0.006 123 G 0.373 0.164 0.124 0.125 0.081 0.057 0.040 0.018 0.010 0.005 0.002 124 E 0.355 0.202 0.045 0.123 0.092 0.072 0.059 0.026 0.013 0.009 0.004 125 E 0.366 0.184 0.064 0.163 0.094 0.054 0.040 0.017 0.010 0.005 0.003 126 R 0.066 0.057 0.026 0.096 0.135 0.164 0.196 0.112 0.085 0.043 0.022 127 D 0.120 0.312 0.135 0.206 0.114 0.058 0.035 0.011 0.006 0.003 0.002 128 L 0.007 0.008 0.004 0.016 0.025 0.047 0.141 0.166 0.210 0.205 0.171 129 D 0.071 0.106 0.058 0.229 0.243 0.160 0.089 0.024 0.013 0.004 0.002 130 H 0.225 0.185 0.148 0.243 0.106 0.052 0.028 0.008 0.004 0.001 0.001 131 E 0.015 0.021 0.043 0.116 0.119 0.164 0.254 0.121 0.082 0.042 0.022 132 M 0.003 0.003 0.015 0.012 0.015 0.025 0.114 0.152 0.228 0.230 0.204 133 L 0.002 0.006 0.072 0.116 0.153 0.184 0.257 0.114 0.058 0.029 0.010 134 A 0.002 0.012 0.162 0.155 0.194 0.235 0.154 0.044 0.025 0.013 0.005 135 L 0.001 0.001 0.013 0.007 0.009 0.020 0.152 0.200 0.243 0.220 0.133 136 S 0.001 0.001 0.006 0.005 0.007 0.015 0.098 0.149 0.243 0.279 0.198 137 L 0.001 0.005 0.164 0.030 0.025 0.035 0.124 0.120 0.165 0.183 0.146 138 R 0.002 0.008 0.109 0.087 0.116 0.163 0.226 0.120 0.083 0.055 0.030 139 L 0.001 0.002 0.022 0.006 0.006 0.010 0.087 0.148 0.256 0.280 0.182 140 L 0.001 0.001 0.016 0.009 0.007 0.009 0.045 0.091 0.207 0.289 0.325 141 G 0.001 0.002 0.039 0.015 0.017 0.038 0.172 0.170 0.222 0.193 0.133 142 R 0.001 0.004 0.087 0.055 0.085 0.143 0.245 0.159 0.120 0.068 0.034 143 A 0.001 0.001 0.010 0.005 0.005 0.012 0.074 0.119 0.235 0.283 0.255 144 L 0.001 0.002 0.005 0.011 0.018 0.037 0.129 0.176 0.266 0.221 0.134 145 F 0.004 0.013 0.021 0.035 0.047 0.077 0.211 0.180 0.205 0.129 0.079 146 G 0.030 0.037 0.046 0.110 0.139 0.134 0.186 0.130 0.104 0.055 0.029 147 K 0.188 0.162 0.083 0.185 0.139 0.100 0.087 0.032 0.014 0.007 0.003 148 P 0.429 0.178 0.054 0.143 0.096 0.045 0.034 0.011 0.006 0.002 0.001 149 L 0.010 0.007 0.002 0.010 0.022 0.042 0.130 0.174 0.234 0.219 0.150 150 S 0.151 0.528 0.084 0.137 0.051 0.023 0.015 0.005 0.003 0.002 0.001 151 P 0.336 0.115 0.041 0.139 0.126 0.108 0.082 0.030 0.015 0.006 0.002 152 S 0.843 0.103 0.017 0.021 0.008 0.004 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 153 L 0.031 0.182 0.097 0.229 0.157 0.133 0.098 0.037 0.021 0.010 0.004 154 A 0.054 0.045 0.038 0.075 0.109 0.161 0.220 0.135 0.093 0.047 0.021 155 E 0.232 0.137 0.302 0.204 0.079 0.031 0.013 0.002 0.001 0.001 0.001 156 H 0.019 0.061 0.320 0.355 0.155 0.057 0.025 0.005 0.002 0.001 0.001 157 A 0.001 0.002 0.015 0.010 0.012 0.035 0.163 0.189 0.237 0.206 0.130 158 L 0.001 0.002 0.048 0.059 0.123 0.254 0.338 0.108 0.046 0.017 0.005 159 K 0.007 0.020 0.827 0.107 0.027 0.008 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 160 A 0.001 0.002 0.027 0.035 0.081 0.207 0.374 0.145 0.074 0.041 0.014 161 L 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.003 0.038 0.094 0.255 0.321 0.280 162 D 0.002 0.007 0.227 0.234 0.260 0.166 0.078 0.017 0.007 0.002 0.001 163 R 0.004 0.022 0.632 0.169 0.100 0.049 0.018 0.004 0.001 0.001 0.001 164 I 0.001 0.001 0.010 0.006 0.009 0.025 0.148 0.177 0.269 0.214 0.141 165 M 0.002 0.001 0.006 0.006 0.011 0.037 0.210 0.224 0.234 0.169 0.099 166 A 0.009 0.034 0.640 0.185 0.080 0.030 0.012 0.005 0.002 0.001 0.001 167 Q 0.018 0.051 0.130 0.095 0.131 0.193 0.221 0.079 0.049 0.024 0.010 168 T 0.037 0.017 0.013 0.019 0.018 0.027 0.084 0.133 0.214 0.242 0.196 169 R 0.103 0.084 0.032 0.080 0.098 0.134 0.177 0.101 0.085 0.062 0.043 170 S 0.199 0.158 0.131 0.138 0.104 0.079 0.070 0.045 0.039 0.025 0.014 171 P 0.134 0.081 0.033 0.098 0.107 0.110 0.150 0.100 0.088 0.062 0.037 172 L 0.043 0.023 0.022 0.042 0.043 0.060 0.108 0.127 0.184 0.177 0.171 173 A 0.070 0.067 0.091 0.148 0.127 0.128 0.139 0.087 0.073 0.044 0.026 174 L 0.037 0.037 0.076 0.100 0.091 0.122 0.173 0.141 0.108 0.074 0.042 175 L 0.014 0.015 0.021 0.030 0.036 0.053 0.127 0.156 0.201 0.198 0.150 176 D 0.086 0.110 0.100 0.135 0.104 0.093 0.117 0.081 0.085 0.058 0.032 177 L 0.119 0.077 0.085 0.106 0.084 0.087 0.122 0.089 0.099 0.080 0.051 178 A 0.253 0.150 0.091 0.119 0.096 0.078 0.084 0.047 0.039 0.027 0.015 179 A 0.126 0.094 0.058 0.093 0.070 0.090 0.130 0.097 0.107 0.084 0.050 180 E 0.078 0.069 0.078 0.140 0.131 0.142 0.156 0.081 0.069 0.038 0.018 181 A 0.183 0.082 0.273 0.147 0.080 0.066 0.066 0.039 0.033 0.020 0.011 182 R 0.046 0.064 0.144 0.157 0.148 0.138 0.142 0.071 0.049 0.027 0.013 183 F 0.010 0.010 0.037 0.026 0.028 0.058 0.146 0.155 0.213 0.190 0.126 184 R 0.023 0.040 0.200 0.200 0.186 0.145 0.125 0.044 0.026 0.009 0.003 185 K 0.079 0.077 0.602 0.133 0.058 0.026 0.014 0.005 0.003 0.002 0.001 186 D 0.012 0.034 0.056 0.064 0.069 0.132 0.244 0.141 0.127 0.080 0.041 187 R 0.007 0.010 0.022 0.039 0.070 0.159 0.290 0.178 0.128 0.067 0.029 188 G 0.233 0.139 0.471 0.101 0.034 0.013 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 189 A 0.027 0.068 0.217 0.227 0.190 0.134 0.088 0.028 0.014 0.006 0.002 190 L 0.002 0.004 0.008 0.007 0.007 0.014 0.065 0.115 0.235 0.285 0.257 191 Y 0.003 0.009 0.038 0.107 0.189 0.280 0.254 0.072 0.034 0.011 0.004 192 R 0.049 0.050 0.804 0.072 0.017 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 193 E 0.003 0.008 0.033 0.079 0.126 0.242 0.340 0.096 0.044 0.020 0.009 194 A 0.001 0.001 0.006 0.002 0.003 0.008 0.070 0.145 0.275 0.288 0.202 195 E 0.003 0.009 0.192 0.261 0.247 0.179 0.079 0.019 0.008 0.003 0.001 196 A 0.007 0.025 0.735 0.119 0.063 0.033 0.013 0.003 0.001 0.001 0.001 197 L 0.001 0.004 0.018 0.019 0.042 0.119 0.360 0.195 0.139 0.073 0.028 198 I 0.003 0.005 0.023 0.015 0.024 0.043 0.215 0.196 0.221 0.165 0.090 199 V 0.042 0.108 0.553 0.169 0.086 0.026 0.011 0.003 0.001 0.001 0.001 200 H 0.197 0.136 0.165 0.148 0.139 0.090 0.078 0.025 0.014 0.006 0.002 201 P 0.221 0.106 0.047 0.081 0.084 0.084 0.147 0.101 0.072 0.043 0.016 202 P 0.341 0.178 0.038 0.088 0.087 0.085 0.096 0.039 0.026 0.015 0.008 203 L 0.277 0.107 0.077 0.140 0.126 0.093 0.088 0.045 0.028 0.015 0.005 204 S 0.529 0.142 0.044 0.074 0.049 0.043 0.051 0.027 0.020 0.015 0.006 205 H 0.234 0.182 0.138 0.221 0.111 0.054 0.038 0.013 0.006 0.002 0.001 206 L 0.023 0.022 0.008 0.024 0.050 0.080 0.165 0.207 0.185 0.154 0.081 207 P 0.031 0.661 0.126 0.120 0.040 0.013 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 208 R 0.123 0.071 0.034 0.180 0.261 0.188 0.102 0.026 0.011 0.003 0.001 209 E 0.884 0.080 0.018 0.013 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 210 R 0.013 0.054 0.059 0.401 0.238 0.142 0.073 0.014 0.005 0.001 0.001 211 A 0.003 0.002 0.003 0.004 0.006 0.013 0.070 0.141 0.244 0.287 0.228 212 L 0.001 0.005 0.051 0.113 0.182 0.318 0.225 0.062 0.027 0.011 0.005 213 S 0.006 0.027 0.579 0.192 0.095 0.053 0.032 0.008 0.005 0.002 0.001 214 E 0.001 0.002 0.005 0.017 0.035 0.115 0.388 0.206 0.115 0.076 0.042 215 A 0.001 0.001 0.005 0.003 0.003 0.005 0.046 0.112 0.255 0.320 0.248 216 V 0.002 0.004 0.065 0.057 0.092 0.135 0.225 0.164 0.122 0.084 0.051 217 T 0.002 0.009 0.196 0.143 0.149 0.184 0.175 0.078 0.039 0.018 0.007 218 L 0.001 0.001 0.014 0.003 0.004 0.008 0.060 0.134 0.239 0.290 0.246 219 L 0.002 0.002 0.009 0.011 0.010 0.018 0.088 0.145 0.212 0.248 0.253 220 V 0.002 0.008 0.099 0.027 0.032 0.048 0.128 0.131 0.194 0.170 0.160 221 A 0.005 0.009 0.028 0.030 0.036 0.063 0.172 0.155 0.184 0.164 0.154 222 G 0.031 0.030 0.024 0.045 0.054 0.066 0.172 0.163 0.181 0.140 0.093 223 H 0.036 0.046 0.026 0.088 0.123 0.136 0.201 0.131 0.106 0.066 0.042 224 E 0.143 0.087 0.058 0.124 0.155 0.151 0.130 0.058 0.044 0.027 0.023 225 T 0.027 0.023 0.018 0.039 0.054 0.076 0.191 0.150 0.163 0.141 0.118 226 V 0.021 0.019 0.015 0.040 0.060 0.088 0.203 0.147 0.170 0.132 0.105 227 A 0.031 0.012 0.016 0.029 0.039 0.063 0.183 0.139 0.189 0.177 0.122 228 S 0.009 0.009 0.027 0.047 0.074 0.123 0.225 0.162 0.159 0.107 0.058 229 A 0.001 0.002 0.024 0.008 0.007 0.013 0.074 0.119 0.211 0.274 0.266 230 L 0.001 0.001 0.013 0.005 0.006 0.012 0.072 0.124 0.206 0.288 0.275 231 T 0.001 0.005 0.112 0.027 0.027 0.045 0.172 0.142 0.180 0.169 0.119 232 W 0.001 0.003 0.081 0.029 0.030 0.033 0.130 0.151 0.188 0.190 0.165 233 S 0.001 0.001 0.006 0.002 0.002 0.004 0.036 0.084 0.220 0.319 0.326 234 F 0.001 0.001 0.025 0.007 0.007 0.012 0.084 0.110 0.242 0.283 0.229 235 L 0.001 0.001 0.141 0.027 0.031 0.062 0.209 0.128 0.157 0.130 0.116 236 L 0.001 0.001 0.007 0.003 0.008 0.041 0.266 0.205 0.221 0.160 0.088 237 L 0.001 0.001 0.007 0.004 0.004 0.008 0.071 0.147 0.264 0.296 0.199 238 S 0.001 0.002 0.013 0.012 0.019 0.038 0.146 0.188 0.244 0.207 0.130 239 H 0.019 0.056 0.113 0.124 0.140 0.166 0.200 0.087 0.057 0.026 0.011 240 R 0.009 0.075 0.076 0.116 0.105 0.128 0.213 0.121 0.091 0.048 0.017 241 P 0.284 0.156 0.154 0.152 0.089 0.069 0.065 0.018 0.009 0.003 0.001 242 D 0.751 0.126 0.062 0.044 0.013 0.004 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 243 W 0.003 0.008 0.017 0.028 0.028 0.078 0.278 0.231 0.188 0.102 0.038 244 Q 0.001 0.002 0.017 0.036 0.076 0.197 0.336 0.166 0.100 0.049 0.020 245 K 0.026 0.038 0.782 0.106 0.030 0.012 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 246 R 0.001 0.006 0.055 0.172 0.247 0.279 0.171 0.050 0.014 0.005 0.001 247 V 0.001 0.001 0.017 0.003 0.003 0.007 0.063 0.114 0.257 0.292 0.242 248 A 0.002 0.007 0.245 0.243 0.234 0.151 0.096 0.016 0.005 0.001 0.001 249 E 0.003 0.020 0.785 0.119 0.052 0.015 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 250 S 0.001 0.004 0.041 0.020 0.030 0.083 0.296 0.195 0.166 0.111 0.053 251 E 0.012 0.010 0.073 0.035 0.043 0.079 0.332 0.196 0.138 0.060 0.023 252 E 0.018 0.039 0.672 0.165 0.071 0.023 0.008 0.002 0.001 0.001 0.001 253 A 0.028 0.068 0.229 0.161 0.155 0.174 0.133 0.032 0.013 0.006 0.002 254 A 0.011 0.012 0.033 0.024 0.025 0.039 0.154 0.181 0.233 0.189 0.099 255 L 0.012 0.020 0.056 0.075 0.122 0.196 0.262 0.118 0.072 0.043 0.023 256 A 0.030 0.054 0.295 0.192 0.150 0.104 0.093 0.039 0.023 0.013 0.007 257 A 0.006 0.015 0.035 0.046 0.057 0.067 0.188 0.173 0.183 0.143 0.087 258 F 0.007 0.006 0.018 0.018 0.020 0.029 0.104 0.145 0.227 0.224 0.200 259 Q 0.029 0.033 0.096 0.181 0.197 0.175 0.139 0.067 0.045 0.025 0.013 260 E 0.005 0.012 0.035 0.047 0.058 0.103 0.263 0.190 0.148 0.097 0.042 261 A 0.006 0.006 0.015 0.018 0.014 0.021 0.076 0.117 0.211 0.259 0.257 262 L 0.006 0.006 0.009 0.021 0.027 0.050 0.160 0.177 0.214 0.192 0.138 263 R 0.008 0.023 0.046 0.100 0.118 0.125 0.179 0.159 0.123 0.078 0.042 264 L 0.012 0.020 0.027 0.043 0.048 0.060 0.129 0.167 0.207 0.174 0.113 265 Y 0.011 0.010 0.007 0.040 0.064 0.092 0.201 0.205 0.193 0.112 0.065 266 P 0.027 0.030 0.027 0.053 0.059 0.089 0.178 0.174 0.176 0.123 0.064 267 P 0.012 0.013 0.013 0.030 0.030 0.042 0.114 0.164 0.224 0.207 0.151 268 A 0.013 0.014 0.013 0.029 0.027 0.045 0.108 0.163 0.220 0.203 0.163 269 W 0.020 0.018 0.014 0.038 0.045 0.074 0.166 0.182 0.197 0.152 0.094 270 I 0.013 0.014 0.016 0.039 0.041 0.061 0.129 0.173 0.204 0.179 0.130 271 L 0.010 0.017 0.014 0.043 0.047 0.058 0.115 0.151 0.203 0.191 0.152 272 T 0.021 0.029 0.028 0.078 0.083 0.095 0.146 0.149 0.166 0.118 0.087 273 R 0.031 0.030 0.034 0.079 0.098 0.133 0.186 0.139 0.123 0.088 0.059 274 R 0.040 0.082 0.078 0.170 0.170 0.133 0.144 0.079 0.056 0.032 0.016 275 L 0.005 0.004 0.004 0.011 0.013 0.019 0.056 0.090 0.182 0.244 0.372 276 E 0.079 0.126 0.105 0.219 0.179 0.126 0.096 0.036 0.021 0.009 0.005 277 R 0.220 0.169 0.096 0.195 0.119 0.083 0.066 0.026 0.014 0.007 0.004 278 P 0.244 0.168 0.089 0.195 0.121 0.076 0.054 0.024 0.015 0.009 0.006 279 L 0.007 0.008 0.005 0.017 0.030 0.054 0.128 0.146 0.210 0.203 0.191 280 L 0.065 0.225 0.116 0.287 0.163 0.076 0.043 0.013 0.007 0.003 0.003 281 L 0.002 0.003 0.002 0.006 0.013 0.027 0.089 0.131 0.219 0.228 0.280 282 G 0.144 0.218 0.115 0.269 0.141 0.060 0.033 0.010 0.005 0.002 0.002 283 E 0.673 0.150 0.037 0.082 0.035 0.014 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 284 D 0.016 0.028 0.017 0.081 0.101 0.128 0.206 0.137 0.119 0.090 0.076 285 R 0.075 0.263 0.087 0.221 0.149 0.100 0.064 0.018 0.012 0.006 0.005 286 L 0.001 0.001 0.001 0.004 0.007 0.015 0.054 0.103 0.185 0.214 0.417 287 P 0.264 0.254 0.106 0.154 0.095 0.057 0.039 0.013 0.007 0.004 0.007 288 Q 0.072 0.101 0.044 0.244 0.193 0.146 0.134 0.040 0.018 0.007 0.003 289 G 0.747 0.124 0.020 0.065 0.028 0.010 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 290 T 0.001 0.001 0.002 0.011 0.025 0.042 0.136 0.188 0.238 0.197 0.159 291 T 0.004 0.031 0.036 0.142 0.209 0.252 0.210 0.065 0.030 0.012 0.010 292 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.035 0.108 0.219 0.286 0.346 293 V 0.001 0.001 0.001 0.006 0.012 0.029 0.114 0.176 0.194 0.222 0.244 294 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.026 0.076 0.225 0.288 0.376 295 S 0.001 0.001 0.001 0.005 0.006 0.014 0.070 0.135 0.240 0.265 0.263 296 P 0.001 0.001 0.002 0.004 0.006 0.014 0.071 0.153 0.235 0.284 0.230 297 Y 0.001 0.002 0.003 0.016 0.028 0.056 0.163 0.218 0.242 0.171 0.099 298 V 0.002 0.003 0.006 0.014 0.018 0.037 0.128 0.191 0.240 0.204 0.158 299 T 0.002 0.002 0.005 0.009 0.010 0.017 0.062 0.130 0.243 0.278 0.242 300 Q 0.001 0.002 0.003 0.013 0.016 0.029 0.090 0.157 0.245 0.244 0.199 301 R 0.002 0.007 0.010 0.039 0.068 0.108 0.188 0.197 0.181 0.129 0.072 302 L 0.005 0.011 0.015 0.041 0.068 0.089 0.172 0.186 0.209 0.135 0.070 303 Y 0.011 0.018 0.012 0.066 0.096 0.118 0.216 0.169 0.159 0.093 0.042 304 F 0.005 0.008 0.004 0.026 0.046 0.072 0.195 0.203 0.224 0.136 0.082 305 P 0.364 0.206 0.075 0.178 0.085 0.045 0.027 0.011 0.005 0.002 0.001 306 E 0.359 0.303 0.056 0.151 0.070 0.035 0.018 0.005 0.002 0.001 0.001 307 G 0.048 0.027 0.009 0.044 0.055 0.075 0.133 0.180 0.201 0.145 0.084 308 E 0.451 0.229 0.046 0.119 0.067 0.040 0.027 0.011 0.006 0.003 0.001 309 A 0.046 0.126 0.093 0.264 0.202 0.121 0.094 0.033 0.014 0.005 0.002 310 F 0.007 0.004 0.002 0.010 0.018 0.040 0.119 0.203 0.230 0.219 0.147 311 Q 0.054 0.200 0.075 0.326 0.207 0.081 0.036 0.011 0.006 0.002 0.001 312 P 0.013 0.013 0.012 0.030 0.038 0.052 0.126 0.155 0.241 0.197 0.123 313 E 0.064 0.075 0.051 0.174 0.170 0.159 0.154 0.075 0.046 0.020 0.011 314 R 0.019 0.053 0.038 0.111 0.116 0.120 0.208 0.146 0.102 0.061 0.027 315 F 0.016 0.023 0.027 0.065 0.080 0.096 0.143 0.147 0.155 0.149 0.098 316 L 0.017 0.044 0.049 0.103 0.134 0.147 0.206 0.126 0.091 0.052 0.031 317 A 0.105 0.134 0.132 0.230 0.153 0.092 0.082 0.037 0.020 0.010 0.004 318 E 0.252 0.159 0.107 0.158 0.099 0.072 0.075 0.035 0.022 0.014 0.008 319 R 0.392 0.177 0.067 0.124 0.074 0.050 0.052 0.026 0.019 0.012 0.006 320 G 0.446 0.165 0.043 0.078 0.054 0.049 0.055 0.034 0.031 0.025 0.020 321 T 0.145 0.188 0.064 0.152 0.106 0.092 0.105 0.058 0.044 0.029 0.018 322 P 0.445 0.179 0.060 0.096 0.067 0.054 0.042 0.022 0.017 0.011 0.007 323 S 0.259 0.204 0.063 0.193 0.121 0.063 0.048 0.022 0.014 0.007 0.004 324 G 0.227 0.099 0.049 0.128 0.118 0.105 0.107 0.071 0.050 0.030 0.015 325 R 0.045 0.092 0.080 0.222 0.216 0.150 0.109 0.045 0.026 0.011 0.005 326 Y 0.004 0.010 0.010 0.038 0.056 0.087 0.172 0.208 0.186 0.139 0.090 327 F 0.011 0.016 0.012 0.051 0.082 0.108 0.200 0.205 0.165 0.098 0.052 328 P 0.034 0.023 0.016 0.046 0.054 0.075 0.175 0.172 0.183 0.133 0.089 329 F 0.015 0.012 0.007 0.032 0.036 0.050 0.112 0.161 0.209 0.206 0.160 330 G 0.044 0.055 0.016 0.075 0.082 0.099 0.161 0.148 0.139 0.105 0.075 331 L 0.062 0.063 0.031 0.093 0.090 0.097 0.132 0.116 0.118 0.107 0.090 332 G 0.111 0.053 0.022 0.061 0.069 0.080 0.136 0.140 0.136 0.111 0.081 333 Q 0.124 0.167 0.057 0.210 0.181 0.100 0.075 0.039 0.024 0.013 0.009 334 R 0.042 0.039 0.018 0.053 0.063 0.078 0.145 0.155 0.161 0.143 0.103 335 L 0.070 0.070 0.040 0.166 0.181 0.171 0.145 0.066 0.050 0.025 0.017 336 C 0.048 0.036 0.038 0.062 0.065 0.094 0.188 0.142 0.144 0.105 0.078 337 L 0.006 0.019 0.022 0.054 0.051 0.064 0.121 0.143 0.176 0.188 0.157 338 G 0.003 0.009 0.010 0.017 0.025 0.049 0.152 0.184 0.219 0.180 0.152 339 R 0.037 0.037 0.061 0.188 0.225 0.185 0.136 0.060 0.039 0.021 0.011 340 D 0.025 0.043 0.079 0.157 0.183 0.186 0.204 0.069 0.033 0.014 0.007 341 F 0.003 0.004 0.030 0.033 0.024 0.024 0.077 0.106 0.202 0.236 0.261 342 A 0.003 0.001 0.012 0.010 0.012 0.021 0.120 0.150 0.210 0.252 0.209 343 L 0.002 0.006 0.119 0.175 0.225 0.215 0.154 0.054 0.031 0.013 0.005 344 L 0.002 0.004 0.060 0.027 0.050 0.120 0.319 0.152 0.128 0.089 0.049 345 E 0.001 0.002 0.007 0.011 0.015 0.032 0.138 0.165 0.231 0.237 0.162 346 G 0.002 0.004 0.016 0.007 0.007 0.015 0.103 0.160 0.235 0.272 0.181 347 P 0.014 0.033 0.205 0.133 0.123 0.131 0.142 0.082 0.065 0.047 0.026 348 I 0.013 0.023 0.211 0.053 0.045 0.057 0.178 0.127 0.133 0.097 0.063 349 V 0.001 0.003 0.037 0.021 0.018 0.023 0.101 0.148 0.228 0.228 0.191 350 L 0.001 0.001 0.008 0.004 0.005 0.010 0.091 0.121 0.246 0.295 0.220 351 R 0.001 0.003 0.175 0.105 0.113 0.162 0.200 0.089 0.076 0.048 0.027 352 A 0.001 0.003 0.054 0.046 0.068 0.139 0.340 0.163 0.108 0.057 0.021 353 F 0.001 0.001 0.007 0.005 0.005 0.008 0.058 0.130 0.245 0.303 0.239 354 F 0.001 0.001 0.016 0.016 0.016 0.024 0.091 0.146 0.234 0.274 0.183 355 R 0.001 0.004 0.077 0.102 0.192 0.208 0.225 0.107 0.057 0.020 0.007 356 R 0.006 0.040 0.126 0.197 0.190 0.202 0.163 0.048 0.019 0.007 0.002 357 F 0.001 0.001 0.002 0.005 0.008 0.017 0.097 0.189 0.304 0.257 0.118 358 R 0.131 0.334 0.128 0.272 0.096 0.027 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 359 L 0.001 0.002 0.002 0.005 0.010 0.017 0.083 0.148 0.283 0.264 0.184 360 D 0.206 0.356 0.105 0.233 0.072 0.019 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 361 P 0.081 0.080 0.021 0.087 0.105 0.122 0.228 0.122 0.089 0.045 0.020 362 L 0.065 0.051 0.018 0.082 0.093 0.117 0.160 0.132 0.122 0.094 0.065 363 P 0.399 0.351 0.049 0.102 0.048 0.024 0.014 0.006 0.004 0.002 0.001 364 F 0.220 0.115 0.042 0.140 0.121 0.108 0.108 0.064 0.043 0.026 0.012 365 P 0.526 0.188 0.042 0.092 0.056 0.034 0.026 0.014 0.010 0.006 0.004 366 R 0.234 0.212 0.106 0.215 0.115 0.058 0.035 0.012 0.007 0.003 0.002 367 V 0.077 0.048 0.027 0.076 0.091 0.104 0.155 0.144 0.129 0.090 0.059 368 L 0.073 0.103 0.062 0.149 0.147 0.128 0.138 0.087 0.058 0.035 0.019 369 A 0.160 0.121 0.074 0.145 0.113 0.094 0.118 0.073 0.053 0.033 0.016 370 Q 0.144 0.101 0.067 0.191 0.142 0.122 0.102 0.053 0.038 0.025 0.014 371 V 0.012 0.012 0.009 0.024 0.031 0.051 0.122 0.159 0.212 0.213 0.156 372 T 0.061 0.106 0.059 0.169 0.129 0.095 0.126 0.088 0.081 0.052 0.035 373 L 0.023 0.019 0.013 0.030 0.041 0.058 0.130 0.152 0.194 0.183 0.157 374 R 0.049 0.138 0.056 0.203 0.175 0.127 0.114 0.062 0.041 0.022 0.014 375 P 0.090 0.060 0.031 0.105 0.124 0.119 0.138 0.104 0.096 0.074 0.058 376 E 0.396 0.176 0.079 0.155 0.087 0.044 0.033 0.014 0.008 0.004 0.002 377 G 0.259 0.148 0.065 0.175 0.120 0.088 0.078 0.034 0.020 0.009 0.004 378 G 0.204 0.155 0.064 0.171 0.124 0.096 0.078 0.045 0.031 0.020 0.013 379 L 0.011 0.027 0.013 0.044 0.057 0.085 0.172 0.172 0.176 0.145 0.096 380 P 0.135 0.157 0.093 0.243 0.168 0.094 0.062 0.025 0.014 0.006 0.003 381 A 0.018 0.010 0.004 0.014 0.021 0.032 0.099 0.149 0.246 0.226 0.180 382 R 0.079 0.180 0.096 0.274 0.179 0.087 0.058 0.024 0.014 0.006 0.003 383 P 0.061 0.033 0.011 0.041 0.058 0.074 0.145 0.161 0.181 0.144 0.091 384 R 0.181 0.201 0.073 0.177 0.125 0.084 0.080 0.039 0.023 0.013 0.005 385 E 0.352 0.161 0.047 0.119 0.088 0.066 0.072 0.042 0.027 0.018 0.007 386 G 0.396 0.167 0.050 0.132 0.079 0.052 0.048 0.030 0.023 0.015 0.008 387 V 0.228 0.086 0.045 0.088 0.077 0.082 0.115 0.092 0.083 0.066 0.039 388 R 0.184 0.223 0.082 0.168 0.113 0.072 0.069 0.039 0.028 0.015 0.007 389 A 0.394 0.163 0.055 0.103 0.077 0.054 0.051 0.039 0.031 0.021 0.011