# TARGET T0263 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0263.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 15 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.048 0.004 0.003 0.001 0.101 0.842 2 A 0.253 0.006 0.013 0.002 0.124 0.602 3 T 0.562 0.009 0.008 0.001 0.081 0.340 4 L 0.814 0.007 0.006 0.001 0.040 0.132 5 L 0.882 0.005 0.002 0.001 0.027 0.084 6 Q 0.898 0.005 0.001 0.001 0.023 0.072 7 L 0.867 0.006 0.002 0.001 0.031 0.094 8 H 0.830 0.008 0.003 0.001 0.053 0.105 9 F 0.670 0.022 0.017 0.003 0.139 0.149 10 A 0.394 0.038 0.038 0.005 0.324 0.202 11 F 0.076 0.020 0.035 0.006 0.608 0.254 12 N 0.020 0.009 0.020 0.011 0.602 0.338 13 G 0.011 0.011 0.016 0.024 0.614 0.325 14 P 0.006 0.009 0.013 0.064 0.445 0.463 15 F 0.002 0.004 0.033 0.571 0.214 0.176 16 G 0.002 0.002 0.009 0.827 0.063 0.097 17 D 0.001 0.001 0.002 0.991 0.005 0.002 18 A 0.001 0.001 0.002 0.995 0.002 0.001 19 M 0.001 0.001 0.002 0.995 0.002 0.001 20 A 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 21 E 0.001 0.001 0.001 0.992 0.004 0.003 22 Q 0.001 0.001 0.002 0.987 0.005 0.006 23 L 0.001 0.001 0.002 0.980 0.006 0.011 24 K 0.001 0.001 0.006 0.967 0.012 0.014 25 P 0.001 0.001 0.012 0.945 0.020 0.023 26 L 0.001 0.001 0.015 0.957 0.012 0.015 27 A 0.001 0.001 0.038 0.917 0.026 0.018 28 E 0.001 0.001 0.065 0.874 0.041 0.019 29 S 0.001 0.001 0.068 0.892 0.027 0.013 30 I 0.001 0.001 0.069 0.871 0.050 0.009 31 N 0.001 0.003 0.067 0.826 0.090 0.014 32 Q 0.003 0.002 0.047 0.699 0.187 0.063 33 E 0.010 0.004 0.040 0.313 0.449 0.183 34 P 0.018 0.007 0.043 0.124 0.431 0.378 35 G 0.079 0.009 0.027 0.023 0.398 0.463 36 F 0.502 0.006 0.015 0.008 0.202 0.266 37 L 0.888 0.005 0.004 0.002 0.034 0.067 38 W 0.973 0.003 0.001 0.001 0.008 0.016 39 K 0.966 0.001 0.001 0.001 0.008 0.023 40 V 0.957 0.002 0.001 0.001 0.008 0.030 41 W 0.934 0.002 0.001 0.001 0.014 0.048 42 T 0.892 0.013 0.001 0.001 0.026 0.068 43 E 0.725 0.051 0.001 0.001 0.066 0.155 44 S 0.212 0.032 0.004 0.002 0.699 0.050 45 E 0.027 0.001 0.015 0.007 0.931 0.020 46 K 0.012 0.002 0.011 0.003 0.954 0.019 47 N 0.045 0.012 0.011 0.003 0.888 0.040 48 H 0.258 0.033 0.008 0.006 0.280 0.414 49 E 0.532 0.149 0.008 0.004 0.123 0.184 50 A 0.558 0.018 0.007 0.003 0.191 0.222 51 G 0.437 0.007 0.004 0.002 0.212 0.339 52 G 0.650 0.009 0.003 0.003 0.119 0.216 53 I 0.917 0.003 0.001 0.002 0.025 0.053 54 Y 0.965 0.002 0.001 0.001 0.008 0.024 55 L 0.971 0.002 0.001 0.001 0.007 0.020 56 F 0.898 0.007 0.002 0.001 0.022 0.071 57 T 0.378 0.017 0.001 0.001 0.087 0.516 58 D 0.093 0.006 0.001 0.010 0.135 0.756 59 E 0.002 0.001 0.025 0.892 0.056 0.024 60 K 0.001 0.001 0.009 0.964 0.021 0.005 61 S 0.001 0.001 0.007 0.983 0.007 0.003 62 A 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 63 L 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 64 A 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 65 Y 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 66 L 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 67 E 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 68 K 0.001 0.001 0.001 0.995 0.002 0.003 69 H 0.001 0.001 0.001 0.995 0.002 0.002 70 T 0.001 0.001 0.001 0.989 0.005 0.004 71 A 0.001 0.001 0.002 0.989 0.005 0.005 72 R 0.001 0.001 0.004 0.979 0.010 0.006 73 L 0.001 0.001 0.007 0.971 0.015 0.006 74 K 0.001 0.001 0.011 0.952 0.024 0.011 75 N 0.002 0.001 0.015 0.900 0.050 0.033 76 L 0.005 0.002 0.018 0.709 0.101 0.165 77 G 0.008 0.003 0.003 0.055 0.097 0.833 78 V 0.039 0.008 0.004 0.085 0.162 0.702 79 E 0.143 0.008 0.012 0.112 0.200 0.525 80 E 0.566 0.015 0.019 0.101 0.126 0.173 81 V 0.784 0.005 0.016 0.072 0.065 0.059 82 V 0.860 0.002 0.009 0.048 0.042 0.038 83 A 0.915 0.001 0.003 0.031 0.023 0.026 84 K 0.902 0.002 0.002 0.034 0.021 0.039 85 V 0.933 0.002 0.001 0.025 0.014 0.026 86 F 0.876 0.002 0.001 0.029 0.035 0.057 87 D 0.806 0.011 0.002 0.024 0.060 0.097 88 V 0.539 0.008 0.006 0.038 0.194 0.215 89 N 0.206 0.010 0.022 0.077 0.377 0.309 90 E 0.209 0.019 0.043 0.099 0.377 0.252 91 P 0.193 0.018 0.055 0.217 0.256 0.262 92 L 0.158 0.008 0.088 0.350 0.198 0.197 93 S 0.207 0.013 0.085 0.354 0.180 0.160 94 Q 0.158 0.009 0.084 0.495 0.149 0.105 95 I 0.103 0.006 0.045 0.592 0.139 0.116 96 N 0.057 0.012 0.032 0.659 0.118 0.123 97 Q 0.019 0.003 0.034 0.762 0.080 0.101 98 A 0.008 0.003 0.024 0.822 0.042 0.101 99 K 0.005 0.002 0.031 0.869 0.024 0.070 100 L 0.002 0.001 0.023 0.949 0.008 0.017 101 A 0.001 0.001 0.013 0.979 0.003 0.004 102 M 0.001 0.001 0.011 0.981 0.004 0.003 103 A 0.001 0.001 0.006 0.982 0.007 0.004 104 T 0.001 0.001 0.005 0.967 0.010 0.017 105 L 0.001 0.001 0.004 0.987 0.004 0.004 106 L 0.001 0.001 0.005 0.981 0.008 0.006 107 Q 0.001 0.001 0.007 0.972 0.013 0.007 108 L 0.001 0.001 0.004 0.979 0.009 0.008 109 H 0.001 0.001 0.015 0.923 0.026 0.036 110 F 0.001 0.002 0.090 0.839 0.049 0.019 111 A 0.001 0.001 0.127 0.796 0.060 0.016 112 F 0.001 0.001 0.103 0.784 0.075 0.035 113 N 0.002 0.002 0.034 0.646 0.112 0.203 114 G 0.003 0.006 0.006 0.190 0.136 0.660 115 P 0.006 0.016 0.006 0.121 0.274 0.577 116 F 0.003 0.006 0.076 0.604 0.187 0.124 117 G 0.003 0.003 0.055 0.863 0.051 0.025 118 D 0.002 0.001 0.043 0.922 0.027 0.005 119 A 0.003 0.002 0.015 0.962 0.011 0.007 120 M 0.007 0.002 0.007 0.968 0.011 0.005 121 A 0.004 0.001 0.006 0.963 0.018 0.008 122 E 0.003 0.001 0.005 0.928 0.040 0.024 123 Q 0.002 0.002 0.006 0.868 0.061 0.062 124 L 0.005 0.005 0.008 0.789 0.079 0.114 125 K 0.008 0.003 0.030 0.549 0.254 0.155 126 P 0.007 0.004 0.061 0.582 0.233 0.112 127 L 0.010 0.009 0.087 0.546 0.221 0.126 128 A 0.010 0.005 0.174 0.370 0.277 0.164 129 E 0.028 0.016 0.102 0.396 0.217 0.240 130 S 0.036 0.014 0.056 0.294 0.332 0.268 131 I 0.038 0.016 0.033 0.226 0.460 0.227 132 N 0.035 0.012 0.020 0.077 0.497 0.360 133 Q 0.024 0.020 0.011 0.060 0.511 0.375 134 E 0.028 0.016 0.009 0.040 0.311 0.595 135 P 0.077 0.018 0.024 0.051 0.247 0.583 136 G 0.157 0.013 0.122 0.031 0.351 0.326 137 F 0.296 0.014 0.137 0.017 0.292 0.245 138 L 0.530 0.010 0.092 0.023 0.186 0.159 139 W 0.805 0.031 0.019 0.009 0.060 0.075 140 K 0.785 0.006 0.005 0.012 0.057 0.135 141 V 0.728 0.009 0.004 0.020 0.072 0.167 142 W 0.455 0.017 0.002 0.021 0.128 0.377 143 T 0.357 0.028 0.003 0.058 0.153 0.401 144 E 0.113 0.006 0.044 0.301 0.240 0.298 145 S 0.073 0.007 0.030 0.295 0.305 0.289 146 E 0.050 0.006 0.032 0.386 0.384 0.142 147 K 0.021 0.005 0.013 0.373 0.382 0.206 148 N 0.016 0.009 0.013 0.566 0.278 0.118 149 H 0.014 0.004 0.022 0.640 0.228 0.092 150 E 0.017 0.005 0.019 0.770 0.128 0.062 151 A 0.029 0.010 0.039 0.584 0.199 0.140 152 G 0.025 0.001 0.005 0.021 0.310 0.638 153 G 0.099 0.005 0.005 0.005 0.235 0.651 154 I 0.651 0.013 0.003 0.003 0.110 0.220 155 Y 0.900 0.006 0.001 0.002 0.024 0.066 156 L 0.917 0.004 0.001 0.002 0.020 0.056 157 F 0.816 0.018 0.002 0.003 0.040 0.121 158 T 0.340 0.020 0.001 0.002 0.059 0.579 159 D 0.075 0.007 0.001 0.015 0.093 0.811 160 E 0.001 0.001 0.005 0.944 0.024 0.026 161 K 0.001 0.001 0.002 0.986 0.009 0.003 162 S 0.001 0.001 0.002 0.992 0.004 0.002 163 A 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 164 L 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 165 A 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 166 Y 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 167 L 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 168 E 0.001 0.001 0.001 0.993 0.003 0.004 169 K 0.001 0.001 0.001 0.972 0.006 0.021 170 H 0.001 0.001 0.001 0.990 0.002 0.006 171 T 0.001 0.001 0.001 0.989 0.004 0.006 172 A 0.001 0.001 0.001 0.992 0.004 0.003 173 R 0.001 0.001 0.001 0.987 0.009 0.002 174 L 0.001 0.001 0.002 0.975 0.019 0.003 175 K 0.001 0.001 0.005 0.954 0.033 0.008 176 N 0.001 0.001 0.005 0.919 0.054 0.021 177 L 0.001 0.002 0.007 0.803 0.075 0.111 178 G 0.002 0.005 0.003 0.112 0.076 0.803 179 V 0.009 0.006 0.011 0.606 0.086 0.283 180 E 0.087 0.006 0.020 0.581 0.154 0.152 181 E 0.284 0.008 0.020 0.477 0.118 0.093 182 V 0.515 0.008 0.023 0.307 0.095 0.052 183 V 0.359 0.005 0.021 0.441 0.109 0.065 184 A 0.351 0.002 0.017 0.377 0.131 0.123 185 K 0.421 0.004 0.007 0.300 0.111 0.156 186 V 0.571 0.029 0.011 0.174 0.098 0.117 187 F 0.437 0.012 0.006 0.083 0.176 0.287 188 D 0.309 0.022 0.019 0.044 0.321 0.285 189 V 0.193 0.009 0.020 0.031 0.378 0.369 190 N 0.077 0.009 0.038 0.049 0.543 0.284 191 E 0.161 0.028 0.035 0.073 0.423 0.280 192 P 0.204 0.022 0.030 0.084 0.309 0.350 193 L 0.106 0.016 0.120 0.270 0.263 0.224 194 S 0.156 0.011 0.101 0.239 0.223 0.270 195 Q 0.156 0.007 0.075 0.363 0.192 0.207 196 I 0.120 0.014 0.051 0.432 0.175 0.209 197 N 0.119 0.019 0.036 0.536 0.128 0.163 198 Q 0.130 0.004 0.050 0.548 0.140 0.127 199 A 0.069 0.006 0.042 0.619 0.119 0.145 200 K 0.048 0.015 0.041 0.412 0.147 0.337 201 L 0.018 0.005 0.016 0.294 0.086 0.581 202 A 0.001 0.001 0.002 0.028 0.031 0.937