# TARGET T0243 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0243.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.031 0.003 0.006 0.064 0.143 0.753 2 K 0.103 0.022 0.016 0.164 0.126 0.570 3 I 0.131 0.014 0.024 0.251 0.141 0.440 4 R 0.151 0.008 0.048 0.309 0.162 0.322 5 K 0.166 0.009 0.049 0.341 0.173 0.262 6 Y 0.193 0.014 0.056 0.345 0.186 0.207 7 M 0.229 0.010 0.036 0.364 0.163 0.198 8 R 0.327 0.008 0.019 0.313 0.143 0.190 9 I 0.279 0.010 0.018 0.458 0.107 0.129 10 N 0.315 0.007 0.017 0.388 0.115 0.159 11 Y 0.376 0.005 0.025 0.472 0.062 0.061 12 Y 0.601 0.006 0.015 0.318 0.029 0.031 13 I 0.774 0.003 0.007 0.179 0.015 0.022 14 I 0.855 0.002 0.004 0.112 0.009 0.018 15 L 0.819 0.002 0.007 0.141 0.012 0.020 16 K 0.824 0.001 0.008 0.133 0.015 0.019 17 V 0.854 0.002 0.007 0.100 0.017 0.021 18 L 0.889 0.002 0.004 0.064 0.021 0.020 19 V 0.851 0.007 0.004 0.073 0.038 0.028 20 I 0.717 0.009 0.005 0.089 0.093 0.086 21 N 0.241 0.007 0.007 0.103 0.400 0.242 22 G 0.054 0.005 0.028 0.151 0.533 0.230 23 S 0.101 0.016 0.044 0.287 0.354 0.197 24 R 0.087 0.015 0.060 0.443 0.237 0.157 25 L 0.044 0.007 0.038 0.497 0.163 0.251 26 E 0.047 0.008 0.040 0.558 0.140 0.206 27 K 0.041 0.003 0.052 0.621 0.137 0.145 28 K 0.044 0.004 0.041 0.518 0.173 0.221 29 R 0.038 0.009 0.049 0.570 0.148 0.186 30 L 0.055 0.009 0.036 0.593 0.122 0.185 31 R 0.041 0.005 0.037 0.707 0.098 0.113 32 S 0.030 0.003 0.042 0.741 0.087 0.097 33 E 0.034 0.003 0.047 0.742 0.090 0.084 34 I 0.036 0.005 0.049 0.756 0.085 0.068 35 L 0.044 0.004 0.078 0.709 0.093 0.072 36 K 0.070 0.003 0.074 0.622 0.119 0.111 37 R 0.100 0.005 0.072 0.520 0.129 0.173 38 F 0.184 0.012 0.037 0.308 0.157 0.302 39 D 0.260 0.019 0.028 0.121 0.172 0.401 40 I 0.305 0.032 0.024 0.093 0.178 0.368 41 D 0.271 0.029 0.031 0.066 0.328 0.275 42 I 0.136 0.016 0.068 0.085 0.529 0.166 43 S 0.057 0.007 0.059 0.064 0.709 0.103 44 D 0.042 0.005 0.065 0.125 0.686 0.078 45 G 0.065 0.007 0.036 0.182 0.530 0.180 46 V 0.192 0.047 0.034 0.290 0.280 0.157 47 L 0.253 0.029 0.033 0.357 0.132 0.197 48 Y 0.235 0.011 0.055 0.420 0.107 0.172 49 P 0.133 0.008 0.101 0.520 0.110 0.129 50 L 0.082 0.007 0.124 0.625 0.080 0.083 51 I 0.071 0.006 0.137 0.662 0.069 0.056 52 D 0.063 0.005 0.160 0.634 0.081 0.057 53 S 0.040 0.003 0.123 0.664 0.099 0.070 54 L 0.045 0.007 0.056 0.656 0.135 0.101 55 I 0.046 0.007 0.042 0.627 0.159 0.119 56 D 0.034 0.005 0.032 0.532 0.214 0.184 57 D 0.033 0.005 0.056 0.520 0.214 0.171 58 K 0.072 0.008 0.063 0.516 0.199 0.142 59 I 0.124 0.014 0.066 0.471 0.178 0.146 60 L 0.131 0.012 0.071 0.465 0.157 0.164 61 R 0.120 0.009 0.075 0.427 0.169 0.200 62 E 0.118 0.007 0.080 0.386 0.193 0.216 63 E 0.117 0.017 0.069 0.293 0.235 0.269 64 E 0.123 0.029 0.043 0.166 0.270 0.368 65 A 0.054 0.014 0.036 0.095 0.576 0.224 66 P 0.019 0.005 0.039 0.070 0.707 0.159 67 D 0.025 0.004 0.036 0.037 0.754 0.144 68 G 0.071 0.006 0.017 0.016 0.694 0.196 69 K 0.331 0.012 0.009 0.013 0.228 0.407 70 V 0.816 0.015 0.003 0.007 0.044 0.116 71 L 0.910 0.004 0.003 0.007 0.024 0.052 72 F 0.893 0.009 0.004 0.009 0.031 0.055 73 L 0.768 0.011 0.006 0.017 0.068 0.129 74 T 0.397 0.006 0.016 0.051 0.226 0.305 75 E 0.095 0.004 0.066 0.217 0.449 0.168 76 K 0.037 0.006 0.084 0.226 0.510 0.139 77 G 0.035 0.007 0.062 0.305 0.420 0.172 78 M 0.046 0.005 0.043 0.489 0.267 0.150 79 K 0.048 0.008 0.035 0.628 0.156 0.126 80 E 0.044 0.008 0.035 0.732 0.089 0.092 81 F 0.034 0.003 0.035 0.783 0.066 0.078 82 E 0.025 0.002 0.033 0.806 0.056 0.078 83 E 0.010 0.002 0.032 0.879 0.032 0.045 84 L 0.007 0.001 0.015 0.916 0.021 0.040 85 H 0.009 0.001 0.017 0.888 0.033 0.051 86 E 0.004 0.001 0.015 0.903 0.034 0.043 87 F 0.004 0.001 0.020 0.924 0.027 0.024 88 F 0.006 0.002 0.033 0.872 0.053 0.034 89 K 0.010 0.002 0.049 0.820 0.068 0.051 90 K 0.013 0.002 0.049 0.749 0.085 0.103 91 I 0.027 0.008 0.027 0.612 0.081 0.246 92 V 0.037 0.021 0.009 0.260 0.055 0.617 93 C 0.001 0.001 0.001 0.008 0.011 0.979