(c) 1992-2000 Regents of the University of California, Santa Cruz
Sequence Alignment and Modeling Software System
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Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)

Sequence numbers correspond to the following labels:

    • T0229 TM0919, Thermotoga maritima
    • gi|48425839|pdb|1USP|B_7:137 Chain B, Organic Hydroperoxide Resistance Protein From Deinococcus Radiodurans [Taxonomy]
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 207 ..G..N..L..I.T.TDA.P...I.D.H....CG..K...G....E....N...F.SPTDLLATS
 208 ..G..K..Dk.V.R.IYF.S...Q.D.R....--..K...D....E....R...H.APTELLLLA
 209 ..G..N..T..V.I.TDA.P...T.D.N....NG..R...G....E....A...Y.SPTDLVSAA
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 211 ..G..A..L..N.EkISI.P...K.T.M....DG..P...G....V....G...T.NPDEMLLGA
 212 ..K..A..D..I.Q.ATS.D...P.A.F....RG..D...K....T....K...H.NPEDLFLSS
 213 ..K..P..V..I.P.GSS.D...P.S.F....LG..D...A....A....R...W.NPEDLLVAS
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 286 ..G..A..Le.I.V.TGV.-...-.-.-....--..S...E....P....G...F.NPIDLLYSS
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 289 ..L..A..P..M.L.VGE.P...P.A.L....LG..D...D....S....A...P.NPSETALAA
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 291 ..T..F..L..S.K.TSI.G...-.E.I....TA..G...E....K....G...L.NPMELLLVS
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 299 ..G..Q..T..L.R.TDA.P...V.D.H....AG..K...G....E....N...F.APTDLLATA
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 301 ..G..E..L..D.I.VTS.P...-.-.-....--..S...Q....P....G...F.GPLDLLYAS
 302 ..G..-..-..-.-.ASL.D...I.A.G....YA..S...E....S....G...M.TPVEMMDAA
 303 ..-..-..-..-.-.---.-...-.-.-....TGv.S...E....P....G...F.NPIDLLYSS
 304 ..-..T..E..F.T.IG-.-...-.-.L....LG..S...D....Y....-...P.TPEEVLLAS
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 310 ..-..-..-..-.-.-DE.P...P.A.L....LG..D...D....T....A...P.NPTEALLAA
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 314 ..K..F..E..L.Q.TKT.A...R.W.V....LA..K...E....E....G...Y.SPVQMLVSA
 315 ..G..A..H..L.E.LEF.-...-.-.-....--..D...T....T....Q...T.SPKELFLAG
 316 ..K..N..K..F.M.ADE.S...A.S.-....-G..K...N....V....A...P.NPVEYLAGA
 317 ..G..V..Q..I.D.VYP.E...R.E.A....GG..P...E....R....G...L.TPLGLLAAS
 318 ..G..T..E..I.K.VG-.-...-.-.L....LG..S...D....-....N...P.TPEEFCLAS
 319 ..K..H..K..F.M.ADE.S...A.S.-....-G..K...N....V....A...P.NPVEYLAGA
 320 ..T..T..LapV.L.TDE.P...P.P.L....-G..D...G....R....G...P.NPIRLLAAA
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 331 ..-..H..T..V.I.SDS.G...P.A.L....GG..Y...D....L....G...P.NAPELLLAA
 332 ..G..A..T..L.T.IGM.E...-.-.-....-G..A...D....G....S...F.SPVELLQAA
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 334 ..Gt.H..S..F.T.TDR.E...K.A.L....GG..K...N....L....G...V.SPTSLLISA
 335 ..S..F..Vp.L.L.TDE.P...E.P.I....GG..-...E....T....G...P.SPEQVLIAA
 336 ..G..D..S..V.T.L--.-...-.-.F....GK..T...D....Q....G...E.TPMSLLVIA
 337 ..K..F..I..L.G.ADE.P...G.I.L....GG..Q...G....V....H...A.TPLNYLMMG
 338 ..G..H..V..L.T.VDQ.P...L.A.D....GG..K...D....T....A...P.TPVELFVAA
 339 ..G..D..S..V.T.L--.-...-.-.F....GK..T...D....Q....G...E.TPMSLLVIA
 340 ..G..A..E..L.K.VSA.P...-.-.-....-G..V...P....G....T...F.SPGELLQAA
 341 ..G..D..S..V.T.L--.-...-.-.F....GK..T...D....Q....G...E.TPMSLLVIA
 342 ..G..A..L..-.Q.LDV.H...E.A.T....AG..-...G....S....G...T.NPEELMAAA
 343 ..K..E..G..I.T.KKL.V...S.A.L....EP..S...N....K....Q...S.GPVDLFCLS
 344 ..P..H..R..F.R.ADT.L...P.A.F....GG..A...D....A....E...P.SPLSYALGA
 345 ..G..D..S..V.T.L--.-...-.-.F....RK..T...D....Q....G...E.TPMSLLVIA
 346 ..G..R..Ls.V.V.LDT.P...K.E.L....GGq.G...G....E....G...T.NPEQLFASG
 347 ..G..A..H..I.K.---.-...-.-.-....FG..K...D....R....Gq..F.TPGDLMKVA
 348 ..-..-..-..-.-.---.-...-.-.-....--..-...-....-....-...M.NPLEAFYAS
 349 ..-..-..-..-.-.---.-...-.-.-....--..-...-....-....L...E.APLYAFLIS


          50            60               70                      80    
          |             |                |                       |    
   1 LMGC.TGMDVVS.I..L.RK.MKV.I.D.Q..MKD.F..RIE..I..EY.ER.....T..E...E
   2 LGGC.SNYDVVS.I..L.KK.SRQ.-.-.P..IES.C..EAF..L..EA.ER.....A..D...E
   3 LMGC.TGMDVVS.I..L.RK.MKV.I.D.Q..MKD.F..RIE..I..EY.ER.....T..E...E
   4 LGGC.SNFDVVS.I..L.KK.SRQ.-.-.P..VES.C..EAF..L..EA.ER.....A..D...E
   5 LGGC.TAFDVVH.I..L.RK.GRQ.-.-.V..ITG.C..QVE..M..DA.QR.....A..T...E
   6 LGGC.TNFDVVS.I..L.KK.ARQ.-.-.P..VES.C..EAF..L..EA.ER.....A..D...E
   7 LGGC.SSFDVVS.I..L.KK.SRQ.-.-.A..VES.C..EAF..L..EA.ER.....A..G...E
   8 TAGC.TSYDVIT.I..L.KK.SRQ.-.-.D..VRD.C..WVD..I..QA.DR.....A..D...A
   9 LGGC.SSFDVVS.I..L.KK.SRQ.-.-.A..VES.C..EAF..L..EA.ER.....A..S...E
  10 TGGC.TAYDVVL.I..L.KR.GRQ.-.-.D..VQG.C..SVK..L..LA.ER.....A..E...T
  11 LGGC.TNFDVVS.I..L.KK.ARQ.-.-.P..VES.C..EAF..L..EA.ER.....A..D...E
  12 TGGC.TAYDVVL.I..L.KR.GRQ.-.-.E..VTG.C..DVR..L..EA.ER.....A..G...E
  13 TGGC.TAYDVVM.I..L.KK.SRQ.-.-.E..IAG.C..SVT..L..KA.ER.....A..S...E
  14 VGGC.SNFDVVS.I..L.KK.SRQ.-.-.A..VES.C..EAF..L..EA.ER.....A..T...E
  15 LGGC.ASFDVIS.I..L.EK.TRQ.-.-.K..VSD.C..RVE..L..SA.ER.....A..E...G
  16 AGGC.SAIDVVS.I..L.QK.GRQ.-.-.N..VTN.C..EVK..L..TS.ER.....R..E...D
  17 AGGC.SAIDVVS.I..L.QK.GRQ.-.-.N..VTN.C..EVK..L..TS.ER.....R..E...D
  18 TGGC.TAYDVVL.I..L.KR.GRQ.-.-.D..VRG.C..SVK..L..EA.ER.....A..E...T
  19 AGGC.SAIDVVS.I..L.QK.GRN.-.-.N..VRD.C..EVK..L..TS.ER.....R..E...E
  20 AGGC.SAIDVVS.I..L.QK.GRY.-.-.D..VAD.C..EVR..L..TS.ER.....R..E...E
  21 VAGC.TGIDIVS.I..L.EK.MRL.-.-.T..LTS.F..EMD..I..EG.ER.....A..D...D
  22 AGGC.SAIDVVS.I..L.QK.GRQ.-.-.D..VVD.C..EVK..L..TS.ER.....R..E...E
  23 YSAC.FIGAMRH.V..A.AQ.QKI.V.L.P..-AD.T..SIE..G..SV.GI.....G..P...-
  24 TGGC.TAYDVVL.I..L.KK.SRQ.-.-.E..VTG.C..SVT..L..KA.ER.....A..S...E
  25 VAGC.SSIDVVM.I..A.EK.QRQ.-.-.K..VTD.C..RAT..V..TA.KR.....A..D...D
  26 YSAC.FLGAMKF.V..A.GR.DKL.P.I.P..-KD.V..SVT..G..SV.GI.....G..P...-
  27 AGGC.SAIDVVS.I..L.QK.GRQ.-.-.D..VVD.C..EVK..L..TS.ER.....R..E...A
  28 MGGC.SSIDVLS.I..L.KK.GRH.-.-.Q..VTD.C..VAE..I..TA.ER.....A..D...S
  29 YSAC.FLSAMKF.V..A.GQ.NKQ.T.L.P..-AD.T..QVT..A..EV.GI.....G..P...N
  30 TGGC.TAYDVVL.I..L.KK.SRQ.-.-.E..VSG.C..SVT..L..KA.ER.....A..S...E
  31 YGAC.FNSALEL.V..L.GK.AGI.-.-.E..AKStV..TAT..V..SL.YS.....D..P...E
  32 YGAC.FNSALEL.V..L.GK.AGI.-.-.E..AKStV..TAT..V..SL.YS.....D..P...E
  33 YSAC.FLGAMKF.V..A.GQ.KKQ.T.L.P..-AD.T..TVT..G..KV.GI.....-..G...G
  34 TGGC.SAYDVVH.I..L.EK.GRE.-.-.A..VED.C..VVE..L..DA.DR.....A..E...T
  35 AGGC.STIDVVS.I..L.HK.GRY.-.-.D..IRD.C..EVK..L..TS.RR.....R..E...E
  36 YSAC.FLGAMKF.V..A.TR.DKF.N.I.P..-KD.A..YVE..G..DV.GI.....G..P...-
  37 TGGC.SAFDVVH.I..L.EK.GRE.-.-.A..VED.C..VVE..M..DA.DR.....A..D...Q
  38 YSAC.FIGAMKF.V..A.GQ.RKQ.T.L.P..-AD.A..SIT..G..KV.GI.....-..G...Q
  39 YAAC.FHSAMHS.V..A.RS.RKI.-.-.T..LED.T..AVG..A..RV.SI.....G..P...N
  40 YAAC.FHSAMHS.V..A.RS.RKI.-.-.T..LED.T..AVG..A..RV.SI.....G..P...N
  41 YSAC.FIGAMKA.V..A.AQ.DKL.K.L.P..GE-.I..SID..G..SV.GI.....-..G...Q
  42 YAAC.FIGAMKA.V..A.AQ.DKL.K.L.P..GE-.V..SID..S..SV.GI.....-..G...Q
  43 YSAC.FIGALKF.V..A.GQ.RKQ.T.L.P..-AD.A..SIT..G..KV.GI.....-..G...Q
  44 AGGC.SSVDVVD.G..L.KS.AGQ.-.-.K..VVS.V..NAK..L..TT.ER.....R..E...I
  45 YSAC.FIGALKF.V..A.GQ.RKQ.T.L.P..-AD.A..SIT..G..KV.GI.....-..G...Q
  46 MGAC.TSFDVVT.I..L.KK.SRQ.-.-.P..VTD.C..VAE..I..SA.ER.....A..N...D
  47 YSAC.FIGAMKF.V..A.AR.DKI.A.I.P..-AD.A..AIE..G..SV.GI.....-..G...A
  48 YSAC.FLGAMKF.V..A.AR.DKL.R.L.P..-AD.T..SVQ..G..SV.GI.....-..G...A
  49 YSAC.FLSAMKF.V..A.GQ.DKK.A.L.P..-AD.T..QVT..A..EV.GI.....G..P...N
  50 YSAC.FLGAIRF.V..A.GQ.QKI.A.I.S..-PD.A..KIE..G..AV.GI.....-..G...Q
  51 TGAC.AAYDVVL.I..L.KR.GRH.-.-.D..IRG.C..EVK..L..NA.ER.....A..T...A
  52 YSAC.FIGALKF.V..A.GQ.RKQ.T.L.P..-AD.A..SIT..G..KV.GI.....-..G...Q
  53 YSAC.FLSAMKF.V..A.GQ.HKQ.T.L.P..-AD.T..QVT..A..EV.GI.....G..P...N
  54 LASC.LLTTFLE.F..R.ER.MGI.D.L.K..EWK.S..EAT..A..EL.GP.....S..P...E
  55 LASC.LLTTFLE.F..R.ER.MGI.D.L.K..EWK.S..EAT..A..EL.GP.....S..P...E
  56 AGGC.SSVDVVD.G..L.KT.AGQ.-.-.K..VSS.V..NAK..L..TT.ER.....R..E...T
  57 HAGC.FTMALSA.Q..L.TE.AGF.P.P.A..SLD.T..RAD..V..DL.SM.....-..E...G
  58 YSAC.FVGAMKF.V..A.AR.DRI.A.I.P..-AD.V..SVE..G..SV.GI.....-..G...A
  59 YSAC.FIGALKF.V..A.SQ.GKR.Q.I.P..-AD.T..SIT..G..KV.GI.....-..G...Q
  60 YAAC.FDSALQL.V..I.RT.KRV.K.V.E..STE.V..TAH..V..SI.GK.....D..T...D
  61 AGGC.SSVDVVD.G..L.KT.AGQ.-.-.K..VSS.V..NAK..L..TT.ER.....R..E...T
  62 YSAC.FIGAMKF.V..A.AR.DKI.A.M.P..-AD.A..AIE..G..SV.GI.....-..G...A
  63 YAAC.FGSALGV.V..G.RA.AKV.-.-.D..VSD.A..AVT..A..EV.GI.....G..K...Q
  64 LGAC.TSITLKM.Y..A.QR.KGW.-.-.P..LAD.V..RVT..L..SL.ET.....G..E...A
  65 HAGC.FTMALSA.Q..L.TE.AGF.P.P.T..SLD.T..RAD..V..DL.SM.....-..E...G
  66 LAGC.IGIDVTM.I..L.RP.H--.L.D.K..ITK.I..EIE..T..DG.TR.....K..E...E
  67 HAGC.FSMALSM.I..L.GD.AGL.K.A.D..SID.T..SAE..V..SL.DQ.....V..E...G
  68 WSAC.FIGAMGK.A..A.SV.LKV.K.L.P..-AD.V..AVD..A..EV.DL.....G..T...T
  69 YSAC.FIGALKF.V..A.GQ.SKR.S.I.P..-AD.T..SIT..A..HV.GI.....-..G...Q
  70 AGGC.SSVDVVD.G..M.KK.AGQ.-.-.K..IHG.C..TAQ..L..SA.ER.....R..D...T
  71 YSAC.FIGALKF.V..A.SQ.TKR.K.I.P..-DD.A..SIT..A..HV.GI.....-..G...Q
  72 HAGC.FTMALSF.Q..L.SG.ANF.T.P.T..KLA.T..EAS..I..TM.-V.....Q..E...N
  73 YSAC.FIGALKF.V..A.NK.EKV.D.L.P..AEP.-..RVE..G..RV.GI.....-..G...E
  74 YSAC.FIGALKF.V..A.NK.EKV.D.L.P..AEP.-..RVE..G..RV.GI.....-..G...E
  75 YSAC.FIGALKF.V..A.NK.EKV.D.L.P..AEP.-..RVE..G..RV.GI.....-..G...E
  76 HAAC.FSMALSL.M..L.GE.AGF.T.P.T..SID.T..TAD..V..SL.DK.....V..D...A
  77 HAAC.FSMALSL.M..L.GE.AGF.T.P.T..SID.T..TAD..V..SL.DK.....V..D...A
  78 TGGC.TAYDVVL.I..L.KR.GRH.-.-.A..VTG.C..SVK..L..QA.ER.....A..D...A
  79 WSAC.FIGAMKA.V..A.GQ.QKI.S.L.P..-AD.L..AVD..A..EV.DL.....G..T...N
  80 YSAC.FIGALKF.V..A.GQ.EKK.A.L.P..-AD.T..SIT..A..KV.GI.....-..G...Q
  81 YAAC.FQSAMGH.V..A.RT.QKI.-.-.A..LAG.S..TVT..G..QV.SL.....A..T...A
  82 WSAC.FIGAMQL.A..A.RA.AKV.T.L.P..-AD.L..AVD..A..EV.DL.....G..T...A
  83 AGGC.SSVDVVD.G..L.KS.AGQ.-.-.K..ITA.C..EAQ..I..DA.ER.....R..E...Q
  84 HAAC.FSMALSL.M..L.GE.AGF.T.P.T..SID.T..TAD..V..SL.DK.....V..D...A
  85 YSAC.FIGALKF.V..A.GQ.SKR.S.I.P..-AD.A..SIT..A..HV.GI.....-..G...Q
  86 YAAC.FASALGL.V..G.RQ.AKV.-.-.D..VSD.A..AVT..A..EV.GI.....G..K...Q
  87 YSAC.FNSALSL.I..L.SQ.NKI.S.D.A..NPE.V..EIT..I..EL.LK.....D..D...T
  88 YAAC.FLGALKF.A..A.AK.EKI.S.I.P..AES.-..TVT..A..TV.GI.....G..Pr..E
  89 YAAC.FLGALKF.A..A.AK.EKI.S.I.P..AES.-..TVT..A..TV.GI.....G..Pr..E
  90 LGGC.ASYDVVA.I..L.QK.SRQ.-.-.E..VTD.V..RCE..L..TA.QR.....A..E...T
  91 HAGC.FSMALSM.I..L.GG.AGL.T.A.E..SID.T..QAE..V..SL.DQ.....V..E...G
  92 LAGC.SAMDVIS.I..L.RK.KRQ.-.-.P..VTG.L..EVK..A..QG.VR.....G..D...E
  93 WSAC.FIGAMGK.A..A.AA.QKI.R.L.P..-AD.V..AVE..T..EI.DL.....G..K...T
  94 LASC.LLTTFLE.F..K.DR.MGI.N.L.K..SWN.S..HVT..A..EL.GP.....S..P...E
  95 HAAC.FTMALSL.I..L.GE.AKL.T.A.E..QME.T..KAD..V..TL.EK.....Q..G...D
  96 HAAC.FSMALSL.M..L.GE.AGF.T.P.T..SID.T..TAD..V..SL.DK.....V..E...A
  97 YAAC.FESALRH.V..A.RG.RKL.-.-.A..LAS.T..TVT..A..EV.GI.....G..P...R
  98 HAAC.FSMALSL.M..L.GE.AGF.T.P.T..SID.T..TAD..V..SL.DK.....V..D...A
  99 HAGC.FSMAFSM.I..L.GD.AGL.K.A.D..SID.T..QAE..V..TL.DQ.....V..D...G
 100 LAAC.TSATLKM.Y..A.DH.KGW.-.-.D..LAE.A..HIE..V..EL.GR.....N..E...D
 101 HAGC.FSMALSM.M..L.GE.AGL.T.A.E..RID.T..AAE..V..TL.DK.....Q..A...D
 102 LGAC.TAITVAM.Y..A.QR.KEW.-.-.P..LEG.I..DVQ..L..NI.VE.....E..R...T
 103 YAAC.FGGALEH.V..A.KE.QNI.-.-.E..I-D.S..EIE..G..QVsLM.....K..D...E
 104 YAAC.FSNAILH.V..A.RE.GKI.-.-.A..IKQ.A..PVT..A..TV.GI.....G..P...N
 105 LGAC.TAITVAM.Y..A.QR.KEW.-.-.P..LEG.I..DVQ..L..NI.VE.....E..R...T
 106 YAAC.FIGAMKF.V..A.SQ.GGP.K.V.P..-AD.A..AVT..S..TV.GI.....G..P...R
 107 HAGC.FSMALSM.M..L.GE.AGL.T.A.E..RIE.T..RAE..V..TL.DK.....Q..S...D
 108 HAGC.FSMALSM.M..L.GE.AGL.T.A.E..RIE.T..RAE..V..TL.DK.....Q..S...D
 109 YSAC.FSNAILH.V..A.RE.AKV.-.-.A..LKS.A..PVT..A..EV.GI.....G..P...N
 110 WSAC.FIGALGL.A..A.SK.HKL.T.L.P..-AE.T..AVD..A..EV.DL.....A..K...S
 111 LGAC.TAITVAM.Y..A.QR.KEW.-.-.P..LEG.I..DVQ..L..NI.VE.....E..R...T
 112 HAAC.FSXALSL.X..L.GE.AGF.T.P.T..SID.T..TAD..V..SL.DK.....V..D...A
 113 HAGC.FSMALSA.E..L.GK.AGI.T.P.E..RIG.T..TAT..V..TL.DK.....D..G...G
 114 HAGC.FSMALAA.S..L.ER.EGF.P.P.K..RVS.T..EAR..V..HL.EV.....V..D...G
 115 YAAC.FESAIRF.V..A.RK.QKL.-.-.P..LTD.A..GVT..S..TV.SL.....L..P...N
 116 YASC.FNGAFDL.I..L.KQ.NKV.R.D.A..EPE.V..TLT..V..RL.ED.....D..P...D
 117 YSAC.FSNAILF.V..A.QS.KKL.-.-.K..LAE.A..PTT..A..TV.GI.....S..P...N
 118 HAGC.FTMALSA.K..L.TE.AGH.P.P.A..SLD.T..RAE..V..DL.SM.....-..-...E
 119 YAAC.FSNAILH.V..A.RE.AKV.-.-.A..LKE.A..PVT..A..TV.GI.....G..P...N
 120 LGGC.MSICAAA.F..A.PA.CHV.-.-.E..LKD.F..RVE..L..EG.DL.....D..P...D
 121 YSAC.FHNALVL.V..G.RR.EGY.-.-.D..LSG.S..TVA..A..KV.GI.....G..P...N
 122 HAGC.FTMQLSA.L..L.AE.HGH.-.-.E..IKA.L..DTD..A..TC.EM.....V..K...D
 123 YSAC.FLGALKA.V..A.GK.HKV.K.I.P..-ED.T..TVT..A..TV.GI.....G..Pr..E
 124 YSAC.FQGALGV.V..A.RQ.EGA.-.-.D..ISG.S..TVT..A..KV.GI.....G..K...N
 125 YSAC.FIGALKV.A..A.QQ.AGV.R.L.P..-AE.V..SVT..G..KV.SI.....G..P...-
 126 YAAC.FSNAILH.V..A.KI.AKV.-.-.A..ITE.A..PVS..A..VV.GI.....G..A...N
 127 LGGC.SGIDVLS.I..L.RK.QKI.-.-.E..PEA.F..QIK..L..HA.DR.....E..K...D
 128 VSAC.HKLWYLH.L..C.AD.AGI.-.-.A..VLA.Y..VDQ..A..EG.TM.....T..Dr..A
 129 YAAC.FDSALQM.V..A.GQ.AKK.-.-.K..ITS.-..EVT..A..EV.SI.....-..E...K
 130 YAAC.FQGALGV.V..S.RR.QKI.D.V.P..-AD.S..TIT..A..RV.GL.....Q..K...A
 131 WSAC.FLGSLRH.A..C.NA.RKI.V.F.Pa.MAG.V..DAQ..I..DL.IH.....G..E...H
 132 LGSC.QTIVASA.F..A.KA.KGI.-.-.D..LQD.F..WVE..L..EG.DL.....D..T...D
 133 YAAC.FENAVIH.V..A.RA.KSV.K.V.A..DAD.I..EVV..A..EV.GL.....A..P...N
 134 YAAC.FQGALGV.V..S.RR.NKI.D.V.P..-AD.S..TIT..A..RV.GL.....Q..K...A
 135 LGAC.TAITLKM.Y..A.QR.KGW.-.-.P..LAE.V..HVK..L..AH.EA.....G..S...A
 136 LGAC.QTIVAFA.F..A.EQ.NGI.-.-.D..LED.F..WVD..L..EG.DF.....D..A...D
 137 IAGC.SAIVFRT.I..L.EK.KRI.-.-.P..YDT.F..TIE..T..EI.GR.....S..E...A
 138 HAAC.FSMALSL.M..L.GE.AGF.T.P.T..SID.T..TAD..V..SL.DK.....V..D...A
 139 YAAC.FQGALGV.V..S.RR.QKI.D.V.P..-AD.S..TIT..A..RV.GL.....Q..K...A
 140 YSAC.FLGALKF.V..A.GK.EKV.K.L.A..-ED.T..TVT..G..TV.GI.....G..Prd.D
 141 IAGC.SAIVFRT.I..L.EK.KRI.-.-.P..YDT.F..TIE..T..EI.GR.....S..E...A
 142 MAGC.TALDVLT.I..L.QK.KRL.-.-.S..LTS.F..AID..V..EA.DR.....A..T...T
 143 YAAC.FLGSLKF.V..A.AK.RKT.T.L.S..-AD.A..SVS..C..GV.GI.....-..G...T
 144 HSGC.FAMALSG.A..L.AK.KGF.N.A.E..SLD.V..SAT..V..TL.EK.....S..G...D
 145 LSAC.HKLWYLH.F..C.SV.NGI.I.VeD..YVD.-..NAE..G..TL.VM.....E..K...D
 146 LSAC.HKLWYLH.F..C.SV.NGI.I.VeD..YVD.-..NAE..G..TL.VM.....E..K...D
 147 ASSC.YIISLAA.T..L.ER.AKF.TdI.S..IEQ.Q..SI-..G..TA.CL.....-..N...N
 148 ASSC.YIISLAA.T..L.ER.AKF.TdI.S..IEQ.Q..SI-..G..TA.CL.....-..N...N
 149 YSAC.YDGALNH.V..A.SE.KGK.K.I.S..SE-.T..TAD..V..HF.MK.....D..P...S
 150 YAAC.FGSACDF.V..A.KSvLKL.N.P.G..SIE.I..LCD..V..GI.GT.....R..P...E
 151 YAAC.FLGAVKL.V..A.RT.RKV.A.-.P..SAE.P..SVT..A..KV.AM.....G..P...-
 152 ASSC.YIISLAA.T..L.ER.AKF.TdI.S..IEQ.Q..SI-..G..TA.CL.....-..N...N
 153 LGAC.TAITLKM.Y..A.QR.KGW.-.-.P..LTE.V..HVK..L..AH.ES.....G..S...A
 154 IAGC.SAIVFRT.I..L.EK.KRI.-.-.T..YDT.F..TIE..T..EI.GR.....S..E...A
 155 IAGC.SAIVFRT.I..L.EK.KRI.-.-.T..YDT.F..TIE..T..EI.GR.....S..E...A
 156 IAGC.SAIVFRT.I..L.EK.KRI.-.-.T..YDT.F..TIE..T..EI.GR.....S..E...A
 157 HAGC.FSMALSN.I..L.GE.AGL.K.A.D..SIE.T..TAE..V..TL.DK.....T..D...D
 158 YASC.FNGAVQH.M..I.KE.AGM.T.A.E..ST-.V..KAR..V..SL.YN.....L..D...D
 159 LGAC.KCIVAKA.F..A.KL.HKI.-.-.N..LID.I..HVD..L..EG.EL.....D..T...D
 160 LAAC.TTMTLRL.Y..A.NQ.KGW.-.-.D..ISG.L..HVE..VfsSF.DK.....E..T...T
 161 HAGC.FSMALAA.L..L.EN.EGM.T.P.D..RLE.T..HVT..V..TL.DK.....V..D...N
 162 YASC.FNGAFDL.I..L.KQ.NKV.R.D.A..HPE.V..TLT..V..RL.ED.....D..S...D
 163 YASC.FNGAFDL.I..L.KQ.NKV.R.D.A..HPE.V..TLT..V..RL.ED.....D..P...D
 164 YAAC.FHSALKG.V..A.RM.RKV.-.-.D..VSD.S..AVS..V..TV.AV.....T..G...G
 165 HAGC.FSMALAK.L..L.GD.AGL.T.P.E..RLE.T..RAD..V..TL.EK.....Q..G...E
 166 LGAC.TAYDVVD.I..M.RK.KKQ.-.-.P..LAR.Y..RVE..V..EG.ER.....A..E...T
 167 HAGC.FTMALAF.G..L.QL.AGF.T.P.D..ELS.T..EAA..V..TL.EP.....E..G...K
 168 YSSC.FNGALQA.V..M.AK.NKV.-.-.S..FK-.T..NVT..A..KV.AL.....H..N...N
 169 YASC.FNGAFDL.I..L.KQ.NKV.R.D.A..HPE.V..TLT..V..RL.ED.....D..S...D
 170 ASSC.YIISLAA.T..L.EK.SGF.TnV.K..INQ.Q..SI-..G..TA.SF.....-..E...N
 171 HAGC.FSMALSN.V..L.GE.AGM.T.A.E..RIE.T..TAT..V..SL.EK.....Q..G...D
 172 LGAC.KCINAWI.F..A.DQ.FGI.-.-.N..LKD.I..VFE..M..EG.DIga6kvD..N...C
 173 ICGC.TGMDVIS.I..L.QK.MRV.-.-.G..LQS.C..SVD..A..DT.DT.....T..A...G
 174 YAAC.FDSAMNH.V..A.PA.LGL.K.P.T..KSS.T..TVG..V..GI.GQ.....K..P...D
 175 YAAC.FDGAFNL.M..A.RQ.DKK.R.V.E..-TR.T..NSE..V..SL.LE.....D..E...E
 176 LGAC.TSMTMRL.Y..A.ER.KAL.-.-.P..LDR.V..TVT..L..SH.AKih7caE..C...E
 177 YAAC.FDSALQL.V..A.RT.ERV.K.V.E..-TE.V..TAN..V..SL.LK.....D..E...A
 178 WSAC.FEGAMEI.A..A.RK.RKI.T.L.P..RK-.C..AID..A..EI.DL.....L..L...D
 179 VCSC.HFLTFLA.I..A.SKsRHI.V.S.S..YED.N..AI-..A..TL.EK.....N..E...E
 180 YAAC.FHSALQS.V..A.RA.EKK.-.-.D..LGD.S..SVG..A..RV.SI.....G..K...Q
 181 YSAC.FDSALNL.V..A.RK.QGI.-.-.K..HDG.S..EVT..A..HV.TL.....N..E...A
 182 VCSC.HFLTFLA.I..A.SKsRHI.V.S.S..YED.N..AI-..A..TL.EK.....N..E...E
 183 ISAC.HKLWYLH.L..C.AV.NNVnV.L.E..YVD.Y..PVG..R..ML.EG.....D..G...Q
 184 MGSC.TSDDVLN.I..L.KK.MRQ.-.-.N..VKN.Y..RCE..I..EG.EK.....R..D...E
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 186 HASC.FAMALSF.V..L.GE.GGN.-.-.P..PER.L..EVS..A..TS.TF.....E..Ea..D
 187 LSAC.HMLWYLH.L..A.AE.SGI.V.VrG..YVD.D..AI-..G..SM.-F.....T..D...A
 188 ASAC.HQLWYLH.L..C.AD.AGI.V.V.T..AYR.D..NAE..G..TM.LD.....D..P...E
 189 LSSC.HMLVFLS.I..A.AK.RRY.V.I.Ds.YVD.-..AAE..G..EL.TV.....G..E...N
 190 HAAC.FTMAFSF.A..C.DK.AGF.A.T.T..AVD.T..RAA..V..RL.AK.....Q..G...E
 191 ASAC.HKLWYLH.L..C.SD.AGI.-.-.R..VLA.Y..VDN..A..EG.TM.....V..D...S
 192 HAAC.FSMAFSM.V..L.GQ.KGL.V.A.T..SID.T..TAD..V..TF.EA.....T..A...D
 193 HAGC.FSMALSA.I..L.GT.AHH.I.P.A..SIS.T..VAK..V..DL.GA.....T..V...A
 194 HASC.FSMALSH.A..L.AQ.NGT.-.-.P..AES.L..EAK..A..EV.EL.....Q..P...K
 195 LATC.TAYDVVE.I..M.KK.RRT.-.-.P..LAS.Y..RIE..V..EG.ER.....A..D...T
 196 LGGC.KALTLMV.Y..A.QR.KGL.-.-.P..LQA.V..DVD..V..VR.DA.....S..E...E
 197 LGAC.TAITVSM.V..A.AR.KQW.-.-.P..LAA.V..HVH..L..HY.TQ.....R..G...A
 198 LGGC.KALTLMV.Y..A.QR.KGL.-.-.P..LQA.V..DVD..V..VR.DA.....S..E...E
 199 VAGC.SSIDVVM.I..A.EK.QRQ.-.-.K..VTD.C..RAT..V..TA.KR.....A..D...D
 200 AATC.YIITLAA.M..M.ER.SGL.-.-.E..KED.L..QME..S..EG.IV.....Nv.T...K
 201 LGAC.KCVTSKV.I..A.KK.KGL.-.-.K..LDY.L..AVE..C..IG.FF.....R..P...-
 202 LASC.HMLTFLG.I..A.AK.QRY.V.IdE..YID.D..AVG..I..-M.EE.....N..E...Q
 203 HAAC.FTMAFSF.A..C.DK.AGL.A.T.T..HVD.T..TAS..V..AL.AK.....Q..G...E
 204 LGAC.TSMTLRL.Y..A.GH.KQL.-.-.K..LGR.I..GVD..V..SH.TKih9ecT..E...T
 205 LSSC.HMLTFLA.I..A.HL.KRL.-.-.P..VTS.YvdEAS..A..EL.GK.....N..E...A
 206 LAGC.INIVATL.V..A.KD.MGI.-.-.N..IED.L..TVE..V..EG.VFnp7ygK..G...N
 207 LGSC.LLTIMSI.K..A.RS.NGW.-.-.E..LKN.I..YLD..I..EK.IM.....T..K...N
 208 IGSC.TSDDVLS.I..L.KK.MRQ.-.-.E..FTS.Y..RCE..I..SG.EK.....R..D...E
 209 LCSC.MMTIMGI.V..A.AR.ENI.-.-.V..FEG.I..TAT..I..EK.IM.....T..K...E
 210 YSAC.FNGALEL.V..M.DQ.EKV.-.-.E..GKStV..TAR..V..SL.FQ.....G..E...D
 211 ASTC.YSITLAA.M..L.ER.NDI.-.-.L..LEH.L..KVD..A..KG.IV.....Dv.T...K
 212 LSSC.HMLWYLH.L..C.SS.AGI.V.VvA..YED.T..PIG..I..-M.EE.....S..D...N
 213 AAAC.HKLWYLH.L..C.AN.AGI.-.-.V..VLA.Y..VDD..A..EG.TM.....I..E...A
 214 LSSC.HMLTFLG.I..A.AK.QRY.V.IdE..YID.D..AVG..I..-M.EE.....N..E...Q
 215 LGAC.KALTLKL.Y..A.KK.KDI.-.-.P..LTG.V..GVE..V..KR.DN.....S..Q...E
 216 IGSC.TSDDVLS.I..L.KK.MRQ.-.-.E..FTS.Y..RCE..I..SG.EK.....R..D...E
 217 LGAC.TSMTLRM.Y..A.ER.KGL.-.-.A..LTK.I..SVT..L..SH.EK.....V..E...V
 218 FAAC.FHGALSL.L..A.RQ.EAL.D.P.A..AIS.V..VAT..V..AF.GR.....D..P...E
 219 IGGC.TSDDVLS.I..L.HK.MRQ.-.-.D..VKS.Y..RCV..V..EG.EK.....R..S...E
 220 IAAC.FDGALGA.VkgA.EK.AKF.-.-.D..ST-.T..EVS..V..DL.LK.....G..E...D
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                              |                 |                     
   1 .HP.....RI.F.T.K...V.....H.....LKYIFKF.D.G.E..PP..K..DK...VE...KA
   2 .DP.....KV.F.T.K...I.....H.....LHFVVKG.R.G.-..LK..E..AQ...VK...RA
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