# TARGET T0220 # Using neural net t04-2621-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0220.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 82.6363 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.087 0.053 0.050 0.097 0.088 0.107 0.157 0.131 0.115 0.077 0.040 2 E 0.169 0.182 0.112 0.245 0.154 0.075 0.042 0.011 0.006 0.003 0.002 3 T 0.003 0.003 0.003 0.008 0.010 0.016 0.064 0.131 0.247 0.268 0.247 4 L 0.031 0.066 0.046 0.167 0.196 0.186 0.176 0.066 0.034 0.020 0.011 5 I 0.011 0.025 0.039 0.062 0.075 0.100 0.234 0.156 0.155 0.094 0.048 6 L 0.001 0.001 0.002 0.007 0.019 0.038 0.117 0.164 0.207 0.231 0.214 7 T 0.016 0.563 0.165 0.159 0.056 0.020 0.012 0.004 0.002 0.001 0.001 8 Q 0.077 0.073 0.050 0.235 0.298 0.163 0.078 0.016 0.006 0.002 0.001 9 E 0.980 0.015 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 10 E 0.002 0.013 0.025 0.170 0.180 0.264 0.258 0.056 0.023 0.007 0.003 11 V 0.001 0.001 0.004 0.003 0.005 0.017 0.098 0.187 0.258 0.243 0.183 12 E 0.004 0.014 0.305 0.218 0.218 0.161 0.061 0.011 0.004 0.002 0.001 13 S 0.010 0.033 0.750 0.131 0.046 0.020 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 14 L 0.001 0.001 0.004 0.010 0.020 0.069 0.293 0.186 0.194 0.132 0.089 15 I 0.001 0.001 0.003 0.003 0.006 0.017 0.115 0.192 0.256 0.239 0.168 16 S 0.011 0.291 0.344 0.202 0.090 0.037 0.014 0.005 0.003 0.002 0.001 17 M 0.006 0.017 0.035 0.068 0.142 0.265 0.274 0.103 0.057 0.025 0.009 18 D 0.760 0.143 0.033 0.031 0.018 0.007 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 19 E 0.036 0.078 0.097 0.371 0.196 0.122 0.074 0.018 0.006 0.002 0.001 20 A 0.001 0.001 0.004 0.003 0.004 0.008 0.040 0.086 0.205 0.315 0.333 21 M 0.001 0.001 0.012 0.021 0.046 0.170 0.418 0.185 0.089 0.038 0.018 22 N 0.005 0.024 0.622 0.245 0.073 0.021 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 23 A 0.001 0.001 0.006 0.016 0.044 0.153 0.387 0.196 0.102 0.063 0.034 24 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.018 0.068 0.235 0.338 0.338 25 E 0.001 0.001 0.038 0.064 0.163 0.303 0.325 0.069 0.025 0.010 0.003 26 E 0.001 0.014 0.451 0.299 0.144 0.063 0.021 0.004 0.001 0.001 0.001 27 A 0.001 0.001 0.004 0.003 0.007 0.028 0.196 0.211 0.245 0.194 0.111 28 F 0.001 0.001 0.005 0.003 0.003 0.005 0.049 0.124 0.240 0.302 0.268 29 R 0.001 0.005 0.281 0.215 0.237 0.142 0.078 0.026 0.010 0.004 0.002 30 L 0.003 0.017 0.241 0.131 0.148 0.204 0.157 0.050 0.029 0.014 0.005 31 Y 0.003 0.003 0.007 0.011 0.021 0.052 0.219 0.218 0.235 0.161 0.070 32 A 0.029 0.025 0.031 0.033 0.033 0.060 0.173 0.176 0.180 0.150 0.111 33 L 0.039 0.092 0.237 0.200 0.159 0.101 0.085 0.042 0.026 0.014 0.006 34 G 0.308 0.175 0.187 0.127 0.075 0.053 0.038 0.017 0.011 0.006 0.003 35 K 0.205 0.188 0.116 0.155 0.108 0.074 0.076 0.034 0.024 0.013 0.006 36 A 0.119 0.041 0.030 0.047 0.047 0.063 0.128 0.126 0.157 0.137 0.106 37 Q 0.159 0.186 0.093 0.180 0.132 0.095 0.079 0.038 0.023 0.011 0.005 38 M 0.172 0.152 0.070 0.110 0.097 0.085 0.100 0.075 0.066 0.045 0.029 39 P 0.093 0.071 0.027 0.080 0.090 0.095 0.143 0.125 0.121 0.095 0.060 40 P 0.381 0.085 0.030 0.100 0.091 0.077 0.090 0.055 0.047 0.030 0.015 41 K 0.101 0.091 0.053 0.170 0.148 0.124 0.132 0.076 0.056 0.032 0.017 42 V 0.039 0.033 0.031 0.065 0.064 0.089 0.150 0.156 0.160 0.134 0.079 43 Y 0.021 0.036 0.040 0.141 0.154 0.156 0.184 0.124 0.077 0.044 0.024 44 L 0.026 0.039 0.057 0.063 0.073 0.092 0.169 0.152 0.154 0.115 0.060 45 E 0.078 0.141 0.096 0.295 0.190 0.097 0.062 0.022 0.011 0.005 0.003 46 F 0.015 0.013 0.007 0.024 0.036 0.053 0.134 0.162 0.213 0.194 0.150 47 E 0.331 0.265 0.121 0.163 0.068 0.030 0.014 0.004 0.003 0.001 0.001 48 K 0.447 0.227 0.071 0.147 0.060 0.027 0.015 0.004 0.002 0.001 0.001 49 G 0.192 0.107 0.040 0.105 0.103 0.110 0.118 0.084 0.067 0.047 0.027 50 D 0.057 0.183 0.076 0.238 0.183 0.117 0.081 0.030 0.019 0.009 0.006 51 L 0.010 0.008 0.006 0.020 0.028 0.044 0.120 0.156 0.228 0.211 0.168 52 R 0.049 0.056 0.055 0.190 0.196 0.160 0.144 0.068 0.045 0.023 0.015 53 A 0.028 0.034 0.027 0.075 0.067 0.078 0.133 0.138 0.160 0.137 0.124 54 M 0.021 0.023 0.017 0.065 0.081 0.131 0.174 0.153 0.154 0.110 0.071 55 P 0.035 0.034 0.023 0.061 0.066 0.085 0.161 0.158 0.159 0.130 0.088 56 A 0.036 0.024 0.026 0.038 0.037 0.046 0.093 0.112 0.173 0.193 0.222 57 H 0.036 0.050 0.041 0.125 0.129 0.128 0.160 0.103 0.099 0.070 0.060 58 L 0.036 0.036 0.026 0.057 0.052 0.064 0.104 0.115 0.155 0.169 0.188 59 M 0.113 0.089 0.070 0.125 0.114 0.116 0.130 0.088 0.074 0.050 0.032 60 G 0.196 0.089 0.050 0.120 0.105 0.098 0.123 0.077 0.065 0.047 0.031 61 Y 0.011 0.018 0.013 0.040 0.051 0.072 0.140 0.152 0.169 0.170 0.164 62 A 0.006 0.008 0.007 0.024 0.033 0.049 0.125 0.152 0.204 0.198 0.195 63 G 0.005 0.005 0.005 0.016 0.023 0.043 0.121 0.154 0.212 0.204 0.213 64 L 0.003 0.003 0.003 0.009 0.011 0.019 0.062 0.130 0.223 0.274 0.264 65 K 0.002 0.003 0.002 0.011 0.019 0.039 0.121 0.195 0.253 0.204 0.151 66 W 0.003 0.005 0.005 0.019 0.023 0.043 0.117 0.163 0.215 0.220 0.188 67 V 0.001 0.002 0.003 0.010 0.015 0.028 0.095 0.164 0.249 0.256 0.176 68 N 0.007 0.014 0.009 0.050 0.065 0.091 0.174 0.191 0.181 0.132 0.088 69 S 0.019 0.034 0.018 0.067 0.077 0.083 0.145 0.161 0.166 0.143 0.088 70 H 0.018 0.032 0.016 0.089 0.121 0.141 0.209 0.158 0.114 0.067 0.036 71 P 0.149 0.119 0.042 0.148 0.134 0.110 0.114 0.074 0.056 0.035 0.020 72 G 0.331 0.155 0.047 0.147 0.111 0.071 0.060 0.032 0.023 0.015 0.008 73 N 0.099 0.130 0.035 0.114 0.097 0.098 0.132 0.095 0.086 0.066 0.048 74 P 0.155 0.114 0.044 0.128 0.129 0.122 0.120 0.073 0.054 0.036 0.025 75 D 0.552 0.195 0.055 0.092 0.046 0.025 0.018 0.008 0.005 0.003 0.002 76 K 0.186 0.117 0.058 0.166 0.135 0.107 0.115 0.054 0.034 0.019 0.009 77 G 0.398 0.192 0.045 0.127 0.085 0.058 0.040 0.020 0.016 0.011 0.009 78 L 0.016 0.037 0.017 0.070 0.093 0.112 0.170 0.150 0.142 0.114 0.080 79 P 0.082 0.082 0.040 0.119 0.134 0.150 0.162 0.089 0.069 0.046 0.028 80 T 0.047 0.055 0.027 0.110 0.139 0.138 0.187 0.112 0.091 0.055 0.038 81 V 0.010 0.009 0.006 0.034 0.047 0.066 0.162 0.175 0.190 0.177 0.123 82 M 0.004 0.009 0.014 0.062 0.101 0.132 0.178 0.148 0.152 0.114 0.087 83 A 0.002 0.002 0.004 0.008 0.010 0.020 0.095 0.164 0.233 0.252 0.210 84 L 0.002 0.002 0.005 0.014 0.019 0.043 0.145 0.200 0.210 0.206 0.156 85 M 0.001 0.001 0.005 0.006 0.005 0.010 0.053 0.122 0.235 0.292 0.269 86 I 0.001 0.001 0.005 0.010 0.014 0.026 0.085 0.144 0.223 0.247 0.244 87 L 0.001 0.001 0.003 0.005 0.006 0.013 0.060 0.111 0.231 0.282 0.288 88 N 0.002 0.004 0.006 0.030 0.049 0.077 0.173 0.212 0.231 0.143 0.073 89 S 0.017 0.046 0.021 0.084 0.108 0.155 0.224 0.153 0.106 0.057 0.030 90 P 0.069 0.052 0.039 0.113 0.113 0.118 0.145 0.125 0.101 0.075 0.049 91 E 0.401 0.186 0.064 0.135 0.081 0.052 0.039 0.018 0.012 0.007 0.005 92 T 0.101 0.105 0.040 0.125 0.105 0.096 0.131 0.094 0.087 0.067 0.050 93 G 0.120 0.100 0.026 0.110 0.111 0.106 0.121 0.092 0.088 0.069 0.057 94 F 0.029 0.076 0.033 0.126 0.174 0.171 0.182 0.089 0.063 0.035 0.022 95 P 0.016 0.013 0.011 0.042 0.067 0.099 0.182 0.159 0.157 0.137 0.115 96 L 0.008 0.009 0.006 0.044 0.074 0.112 0.191 0.165 0.162 0.125 0.104 97 A 0.008 0.007 0.009 0.019 0.021 0.032 0.100 0.149 0.219 0.228 0.209 98 V 0.011 0.009 0.015 0.033 0.034 0.051 0.108 0.136 0.179 0.203 0.219 99 M 0.007 0.009 0.017 0.026 0.029 0.042 0.112 0.144 0.205 0.211 0.197 100 D 0.014 0.030 0.035 0.076 0.089 0.101 0.191 0.151 0.133 0.101 0.078 101 A 0.017 0.014 0.018 0.030 0.034 0.041 0.106 0.125 0.195 0.216 0.205 102 T 0.060 0.055 0.043 0.105 0.140 0.154 0.191 0.097 0.079 0.046 0.030 103 Y 0.040 0.032 0.039 0.082 0.104 0.139 0.230 0.118 0.099 0.069 0.049 104 T 0.030 0.016 0.024 0.035 0.045 0.069 0.170 0.137 0.176 0.162 0.137 105 T 0.019 0.016 0.031 0.047 0.048 0.067 0.177 0.147 0.184 0.152 0.110 106 S 0.013 0.009 0.037 0.031 0.039 0.059 0.163 0.155 0.182 0.176 0.135 107 L 0.012 0.009 0.074 0.035 0.042 0.068 0.185 0.141 0.166 0.152 0.116 108 R 0.006 0.009 0.126 0.039 0.034 0.043 0.148 0.136 0.172 0.165 0.121 109 T 0.002 0.004 0.050 0.016 0.014 0.021 0.097 0.122 0.199 0.250 0.226 110 G 0.003 0.003 0.052 0.010 0.011 0.020 0.108 0.134 0.228 0.238 0.192 111 A 0.003 0.003 0.125 0.021 0.021 0.032 0.129 0.130 0.190 0.191 0.155 112 A 0.001 0.001 0.071 0.012 0.013 0.024 0.119 0.133 0.215 0.225 0.186 113 G 0.001 0.001 0.009 0.002 0.003 0.007 0.064 0.104 0.227 0.296 0.289 114 G 0.001 0.001 0.042 0.010 0.012 0.028 0.120 0.117 0.193 0.224 0.252 115 I 0.001 0.002 0.056 0.015 0.016 0.026 0.126 0.139 0.203 0.214 0.203 116 A 0.001 0.001 0.012 0.008 0.009 0.014 0.073 0.132 0.222 0.264 0.266 117 A 0.001 0.001 0.006 0.002 0.003 0.005 0.032 0.061 0.197 0.296 0.396 118 K 0.001 0.002 0.049 0.060 0.099 0.177 0.324 0.131 0.094 0.042 0.022 119 Y 0.001 0.003 0.048 0.051 0.079 0.177 0.330 0.134 0.103 0.050 0.022 120 L 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.011 0.058 0.105 0.204 0.299 0.314 121 A 0.005 0.006 0.006 0.018 0.022 0.054 0.166 0.189 0.203 0.178 0.153 122 R 0.038 0.056 0.105 0.169 0.169 0.167 0.155 0.074 0.041 0.019 0.010 123 K 0.202 0.126 0.099 0.135 0.106 0.113 0.115 0.047 0.029 0.017 0.011 124 N 0.238 0.199 0.081 0.192 0.099 0.070 0.058 0.023 0.020 0.013 0.008 125 S 0.019 0.012 0.007 0.020 0.028 0.042 0.102 0.119 0.202 0.219 0.229 126 S 0.075 0.128 0.105 0.227 0.199 0.124 0.095 0.029 0.012 0.004 0.002 127 V 0.005 0.016 0.024 0.089 0.154 0.205 0.251 0.126 0.073 0.038 0.020 128 F 0.001 0.001 0.001 0.003 0.006 0.012 0.058 0.138 0.228 0.266 0.287 129 G 0.002 0.001 0.002 0.005 0.009 0.022 0.110 0.185 0.248 0.221 0.196 130 F 0.001 0.001 0.004 0.004 0.004 0.010 0.049 0.106 0.220 0.291 0.310 131 I 0.001 0.001 0.003 0.005 0.006 0.014 0.066 0.139 0.240 0.270 0.255 132 G 0.001 0.002 0.003 0.006 0.010 0.022 0.105 0.174 0.248 0.234 0.195 133 C 0.001 0.004 0.005 0.012 0.018 0.032 0.111 0.169 0.253 0.234 0.162 134 G 0.012 0.015 0.017 0.064 0.118 0.163 0.237 0.155 0.124 0.061 0.034 135 T 0.016 0.021 0.028 0.074 0.119 0.163 0.243 0.154 0.099 0.053 0.030 136 Q 0.001 0.002 0.008 0.013 0.015 0.022 0.074 0.140 0.247 0.243 0.236 137 A 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.008 0.051 0.111 0.221 0.286 0.316 138 Y 0.002 0.004 0.033 0.088 0.170 0.216 0.217 0.109 0.085 0.049 0.027 139 F 0.001 0.002 0.022 0.029 0.043 0.073 0.223 0.215 0.189 0.121 0.082 140 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.025 0.073 0.196 0.305 0.397 141 L 0.001 0.001 0.005 0.004 0.006 0.017 0.108 0.122 0.205 0.262 0.271 142 E 0.001 0.002 0.046 0.179 0.242 0.224 0.186 0.074 0.031 0.012 0.005 143 A 0.001 0.001 0.005 0.005 0.008 0.024 0.140 0.176 0.246 0.222 0.174 144 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.020 0.067 0.186 0.328 0.396 145 R 0.001 0.001 0.033 0.077 0.128 0.204 0.264 0.145 0.089 0.042 0.017 146 R 0.001 0.003 0.043 0.063 0.124 0.254 0.301 0.115 0.056 0.027 0.013 147 V 0.001 0.002 0.003 0.006 0.008 0.022 0.126 0.179 0.248 0.229 0.177 148 F 0.006 0.006 0.006 0.023 0.030 0.070 0.181 0.214 0.188 0.175 0.100 149 D 0.146 0.279 0.241 0.222 0.074 0.024 0.009 0.002 0.001 0.001 0.001 150 I 0.003 0.004 0.005 0.014 0.021 0.037 0.110 0.160 0.228 0.224 0.196 151 G 0.220 0.225 0.072 0.219 0.115 0.070 0.051 0.016 0.007 0.003 0.002 152 E 0.023 0.120 0.064 0.359 0.242 0.124 0.051 0.011 0.004 0.001 0.001 153 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.029 0.098 0.258 0.316 0.290 154 K 0.008 0.053 0.048 0.371 0.338 0.132 0.040 0.007 0.003 0.001 0.001 155 A 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.005 0.027 0.076 0.223 0.332 0.328 156 Y 0.005 0.015 0.016 0.144 0.216 0.234 0.243 0.077 0.036 0.010 0.004 157 D 0.071 0.096 0.045 0.074 0.067 0.084 0.225 0.153 0.113 0.054 0.018 158 V 0.012 0.027 0.018 0.075 0.097 0.108 0.128 0.136 0.133 0.156 0.111 159 R 0.016 0.682 0.075 0.110 0.055 0.030 0.018 0.007 0.004 0.002 0.001 160 E 0.383 0.114 0.056 0.219 0.165 0.045 0.015 0.003 0.001 0.001 0.001 161 K 0.972 0.021 0.004 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 162 A 0.001 0.003 0.010 0.061 0.085 0.240 0.374 0.137 0.065 0.020 0.006 163 A 0.001 0.001 0.003 0.002 0.005 0.024 0.165 0.232 0.244 0.203 0.122 164 K 0.001 0.005 0.723 0.145 0.070 0.041 0.012 0.002 0.001 0.001 0.001 165 K 0.002 0.014 0.452 0.267 0.172 0.068 0.019 0.004 0.001 0.001 0.001 166 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.063 0.109 0.246 0.295 0.280 167 V 0.001 0.001 0.004 0.012 0.044 0.115 0.370 0.216 0.155 0.063 0.020 168 S 0.009 0.027 0.842 0.087 0.026 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 169 Y 0.001 0.005 0.020 0.059 0.132 0.302 0.359 0.083 0.027 0.009 0.003 170 C 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.016 0.061 0.203 0.332 0.383 171 E 0.012 0.029 0.065 0.192 0.249 0.227 0.152 0.045 0.017 0.008 0.006 172 D 0.053 0.083 0.662 0.130 0.048 0.016 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 173 R 0.010 0.013 0.006 0.052 0.106 0.219 0.348 0.141 0.059 0.031 0.013 174 G 0.562 0.220 0.046 0.088 0.038 0.020 0.015 0.006 0.003 0.001 0.001 175 I 0.002 0.004 0.003 0.012 0.025 0.054 0.140 0.159 0.213 0.200 0.187 176 S 0.251 0.324 0.113 0.197 0.074 0.027 0.011 0.002 0.001 0.001 0.001 177 A 0.002 0.001 0.001 0.003 0.007 0.015 0.075 0.126 0.256 0.261 0.254 178 S 0.109 0.169 0.094 0.253 0.147 0.096 0.080 0.026 0.014 0.007 0.005 179 V 0.010 0.013 0.006 0.029 0.060 0.101 0.234 0.186 0.172 0.120 0.070 180 Q 0.341 0.333 0.072 0.117 0.053 0.033 0.022 0.010 0.007 0.006 0.005 181 P 0.138 0.129 0.035 0.127 0.141 0.132 0.133 0.070 0.049 0.032 0.014 182 A 0.267 0.107 0.044 0.149 0.144 0.105 0.090 0.040 0.031 0.015 0.008 183 E 0.378 0.188 0.148 0.165 0.065 0.028 0.015 0.005 0.004 0.002 0.002 184 E 0.017 0.044 0.059 0.198 0.170 0.197 0.177 0.077 0.037 0.016 0.009 185 A 0.012 0.006 0.009 0.012 0.021 0.044 0.107 0.150 0.184 0.198 0.256 186 S 0.057 0.117 0.253 0.282 0.134 0.078 0.054 0.014 0.007 0.003 0.002 187 R 0.212 0.226 0.225 0.220 0.077 0.027 0.010 0.002 0.001 0.001 0.001 188 C 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.006 0.038 0.107 0.224 0.292 0.328 189 D 0.005 0.037 0.042 0.188 0.253 0.256 0.155 0.039 0.015 0.005 0.004 190 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.007 0.056 0.147 0.285 0.264 0.236 191 L 0.001 0.001 0.001 0.003 0.006 0.023 0.099 0.183 0.212 0.230 0.243 192 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.032 0.094 0.240 0.290 0.336 193 T 0.001 0.001 0.001 0.006 0.008 0.017 0.073 0.136 0.228 0.269 0.261 194 T 0.001 0.001 0.001 0.005 0.008 0.019 0.076 0.153 0.237 0.260 0.239 195 T 0.003 0.009 0.006 0.048 0.085 0.109 0.197 0.205 0.175 0.104 0.060 196 P 0.072 0.099 0.029 0.164 0.179 0.142 0.141 0.081 0.053 0.026 0.016 197 S 0.080 0.063 0.029 0.122 0.146 0.132 0.166 0.112 0.081 0.046 0.022 198 R 0.380 0.175 0.049 0.163 0.108 0.058 0.036 0.015 0.009 0.004 0.003 199 K 0.071 0.134 0.055 0.215 0.185 0.152 0.103 0.044 0.025 0.012 0.005 200 P 0.009 0.012 0.006 0.030 0.048 0.089 0.176 0.176 0.188 0.166 0.098 201 V 0.014 0.018 0.017 0.056 0.084 0.116 0.241 0.177 0.139 0.088 0.050 202 V 0.001 0.002 0.002 0.007 0.016 0.032 0.101 0.143 0.215 0.251 0.229 203 K 0.046 0.264 0.127 0.319 0.143 0.051 0.027 0.011 0.007 0.004 0.002 204 A 0.182 0.045 0.029 0.123 0.162 0.145 0.150 0.071 0.054 0.027 0.013 205 E 0.503 0.172 0.101 0.128 0.051 0.021 0.014 0.005 0.003 0.001 0.002 206 W 0.005 0.018 0.017 0.064 0.081 0.155 0.290 0.153 0.119 0.063 0.033 207 V 0.002 0.003 0.004 0.010 0.017 0.037 0.093 0.120 0.161 0.206 0.347 208 E 0.126 0.235 0.390 0.131 0.064 0.030 0.017 0.004 0.002 0.001 0.001 209 E 0.341 0.172 0.104 0.218 0.091 0.043 0.022 0.005 0.002 0.001 0.001 210 G 0.385 0.133 0.034 0.125 0.099 0.067 0.053 0.034 0.028 0.022 0.020 211 T 0.001 0.008 0.008 0.039 0.090 0.183 0.283 0.181 0.122 0.053 0.032 212 H 0.001 0.002 0.003 0.014 0.032 0.071 0.182 0.192 0.192 0.160 0.151 213 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.040 0.112 0.205 0.283 0.350 214 N 0.001 0.001 0.001 0.006 0.009 0.019 0.094 0.186 0.257 0.224 0.202 215 A 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.005 0.024 0.062 0.162 0.277 0.466 216 I 0.001 0.001 0.001 0.007 0.009 0.020 0.073 0.154 0.232 0.269 0.233 217 G 0.002 0.004 0.004 0.016 0.027 0.050 0.152 0.212 0.217 0.173 0.143 218 A 0.006 0.008 0.009 0.020 0.022 0.031 0.074 0.124 0.195 0.240 0.270 219 D 0.031 0.040 0.018 0.099 0.123 0.131 0.161 0.136 0.122 0.079 0.058 220 G 0.036 0.039 0.015 0.060 0.083 0.101 0.146 0.140 0.151 0.125 0.103 221 P 0.228 0.135 0.049 0.125 0.118 0.093 0.100 0.061 0.047 0.029 0.014 222 G 0.438 0.119 0.044 0.101 0.082 0.064 0.061 0.030 0.028 0.017 0.014 223 K 0.086 0.077 0.041 0.114 0.105 0.112 0.143 0.106 0.092 0.076 0.049 224 Q 0.067 0.084 0.036 0.117 0.120 0.147 0.163 0.096 0.081 0.054 0.035 225 E 0.062 0.038 0.034 0.052 0.065 0.089 0.183 0.164 0.135 0.104 0.075 226 L 0.018 0.021 0.011 0.026 0.039 0.061 0.135 0.143 0.170 0.211 0.165 227 D 0.031 0.151 0.066 0.143 0.140 0.103 0.129 0.078 0.073 0.051 0.037 228 V 0.246 0.097 0.095 0.233 0.155 0.091 0.049 0.016 0.010 0.005 0.002 229 E 0.343 0.134 0.184 0.164 0.091 0.046 0.027 0.006 0.003 0.001 0.001 230 I 0.001 0.003 0.010 0.028 0.027 0.053 0.189 0.212 0.217 0.160 0.099 231 L 0.001 0.002 0.013 0.024 0.056 0.118 0.228 0.180 0.180 0.128 0.071 232 K 0.028 0.036 0.676 0.153 0.060 0.029 0.014 0.003 0.001 0.001 0.001 233 K 0.005 0.029 0.155 0.197 0.201 0.188 0.153 0.043 0.018 0.008 0.003 234 A 0.001 0.001 0.002 0.003 0.004 0.009 0.068 0.150 0.260 0.285 0.215 235 K 0.160 0.193 0.204 0.268 0.114 0.047 0.011 0.002 0.001 0.001 0.001 236 I 0.001 0.001 0.006 0.004 0.005 0.013 0.072 0.139 0.280 0.301 0.180 237 V 0.003 0.011 0.014 0.057 0.074 0.105 0.253 0.184 0.138 0.089 0.070 238 V 0.001 0.003 0.004 0.004 0.005 0.013 0.097 0.127 0.236 0.253 0.259 239 D 0.011 0.022 0.034 0.122 0.166 0.166 0.160 0.111 0.088 0.068 0.051 240 D 0.041 0.315 0.071 0.188 0.133 0.088 0.076 0.043 0.026 0.013 0.006 241 L 0.072 0.037 0.034 0.159 0.245 0.182 0.152 0.062 0.039 0.013 0.005 242 E 0.743 0.114 0.054 0.055 0.017 0.008 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 243 Q 0.008 0.023 0.026 0.102 0.126 0.184 0.277 0.135 0.078 0.031 0.011 244 A 0.023 0.010 0.017 0.018 0.019 0.039 0.098 0.138 0.191 0.219 0.228 245 K 0.042 0.082 0.173 0.201 0.195 0.138 0.095 0.038 0.020 0.010 0.006 246 H 0.072 0.141 0.284 0.198 0.125 0.083 0.051 0.021 0.014 0.008 0.003 247 G 0.037 0.032 0.016 0.049 0.072 0.102 0.199 0.150 0.133 0.127 0.084 248 G 0.267 0.111 0.050 0.107 0.095 0.095 0.113 0.069 0.049 0.029 0.016 249 E 0.031 0.079 0.051 0.116 0.125 0.132 0.158 0.102 0.088 0.072 0.046 250 I 0.006 0.006 0.006 0.018 0.023 0.041 0.110 0.132 0.206 0.230 0.224 251 N 0.036 0.030 0.035 0.087 0.096 0.134 0.183 0.127 0.129 0.083 0.058 252 V 0.019 0.046 0.090 0.170 0.142 0.131 0.149 0.099 0.079 0.049 0.028 253 A 0.007 0.007 0.015 0.023 0.027 0.043 0.107 0.143 0.186 0.216 0.226 254 V 0.003 0.005 0.012 0.040 0.066 0.100 0.188 0.167 0.177 0.142 0.101 255 S 0.020 0.051 0.199 0.199 0.169 0.129 0.123 0.053 0.034 0.015 0.008 256 K 0.141 0.137 0.159 0.226 0.128 0.102 0.070 0.022 0.010 0.005 0.002 257 G 0.442 0.140 0.058 0.108 0.070 0.056 0.052 0.028 0.022 0.016 0.008 258 V 0.057 0.111 0.041 0.131 0.114 0.113 0.159 0.097 0.082 0.054 0.041 259 I 0.012 0.016 0.009 0.024 0.042 0.061 0.129 0.146 0.206 0.188 0.166 260 G 0.145 0.356 0.082 0.186 0.105 0.056 0.037 0.014 0.009 0.005 0.003 261 V 0.160 0.073 0.037 0.126 0.146 0.138 0.140 0.080 0.054 0.030 0.017 262 E 0.407 0.152 0.068 0.148 0.099 0.058 0.035 0.014 0.010 0.005 0.004 263 D 0.051 0.109 0.059 0.231 0.197 0.149 0.111 0.047 0.027 0.013 0.007 264 V 0.006 0.005 0.003 0.010 0.017 0.031 0.099 0.160 0.213 0.247 0.211 265 H 0.036 0.059 0.041 0.150 0.164 0.168 0.185 0.084 0.056 0.033 0.023 266 A 0.013 0.018 0.027 0.050 0.055 0.069 0.150 0.142 0.180 0.160 0.136 267 T 0.034 0.087 0.040 0.194 0.181 0.153 0.149 0.067 0.043 0.029 0.024 268 I 0.005 0.007 0.006 0.017 0.021 0.028 0.080 0.134 0.219 0.245 0.237 269 G 0.053 0.047 0.042 0.123 0.163 0.167 0.173 0.096 0.071 0.039 0.026 270 E 0.040 0.082 0.105 0.240 0.169 0.153 0.111 0.048 0.027 0.015 0.009 271 V 0.001 0.003 0.005 0.012 0.022 0.039 0.127 0.182 0.217 0.217 0.176 272 I 0.002 0.003 0.006 0.013 0.018 0.034 0.105 0.135 0.209 0.227 0.250 273 A 0.017 0.047 0.092 0.151 0.146 0.127 0.181 0.094 0.072 0.046 0.026 274 G 0.138 0.138 0.086 0.205 0.148 0.109 0.090 0.040 0.024 0.014 0.008 275 L 0.045 0.048 0.028 0.081 0.091 0.111 0.195 0.147 0.110 0.084 0.061 276 K 0.279 0.194 0.080 0.146 0.107 0.072 0.065 0.025 0.017 0.009 0.006 277 D 0.420 0.195 0.055 0.111 0.077 0.051 0.047 0.019 0.013 0.008 0.004 278 G 0.261 0.137 0.044 0.105 0.082 0.071 0.098 0.056 0.057 0.050 0.039 279 R 0.027 0.038 0.025 0.087 0.102 0.136 0.207 0.129 0.107 0.076 0.064 280 E 0.170 0.243 0.107 0.156 0.114 0.089 0.065 0.026 0.016 0.009 0.006 281 S 0.274 0.251 0.104 0.151 0.084 0.056 0.041 0.018 0.010 0.006 0.004 282 D 0.721 0.134 0.029 0.056 0.033 0.014 0.008 0.003 0.001 0.001 0.001 283 E 0.265 0.206 0.106 0.192 0.121 0.062 0.034 0.009 0.004 0.002 0.001 284 E 0.026 0.084 0.051 0.268 0.214 0.158 0.126 0.043 0.018 0.009 0.004 285 I 0.001 0.002 0.003 0.020 0.058 0.149 0.247 0.205 0.158 0.106 0.052 286 T 0.003 0.008 0.010 0.034 0.062 0.100 0.219 0.202 0.166 0.119 0.076 287 I 0.001 0.003 0.004 0.021 0.030 0.050 0.159 0.196 0.202 0.192 0.141 288 F 0.002 0.003 0.003 0.014 0.023 0.037 0.125 0.186 0.235 0.212 0.162 289 D 0.062 0.071 0.044 0.227 0.191 0.127 0.117 0.070 0.048 0.026 0.018 290 S 0.011 0.013 0.010 0.031 0.039 0.061 0.163 0.187 0.215 0.175 0.095 291 T 0.015 0.030 0.023 0.078 0.090 0.097 0.194 0.163 0.154 0.096 0.059 292 G 0.040 0.037 0.022 0.056 0.069 0.115 0.225 0.136 0.123 0.097 0.079 293 L 0.013 0.018 0.015 0.065 0.093 0.111 0.211 0.169 0.143 0.101 0.062 294 A 0.014 0.012 0.011 0.030 0.041 0.064 0.153 0.164 0.222 0.176 0.111 295 I 0.023 0.008 0.023 0.032 0.034 0.049 0.123 0.138 0.196 0.207 0.167 296 Q 0.002 0.006 0.026 0.035 0.049 0.076 0.176 0.189 0.203 0.144 0.093 297 D 0.001 0.006 0.025 0.016 0.016 0.031 0.119 0.173 0.228 0.228 0.160 298 V 0.004 0.006 0.033 0.028 0.033 0.042 0.119 0.145 0.202 0.212 0.176 299 A 0.007 0.008 0.065 0.035 0.037 0.058 0.178 0.160 0.189 0.143 0.118 300 V 0.001 0.001 0.021 0.014 0.013 0.017 0.088 0.142 0.237 0.252 0.216 301 A 0.001 0.001 0.003 0.002 0.003 0.009 0.069 0.109 0.218 0.289 0.298 302 K 0.002 0.004 0.137 0.114 0.140 0.186 0.236 0.081 0.056 0.029 0.014 303 V 0.001 0.001 0.030 0.038 0.069 0.110 0.285 0.202 0.146 0.079 0.040 304 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.019 0.056 0.177 0.323 0.421 305 Y 0.001 0.001 0.003 0.008 0.021 0.057 0.247 0.219 0.226 0.143 0.076 306 E 0.008 0.024 0.421 0.274 0.140 0.081 0.035 0.010 0.004 0.002 0.001 307 N 0.001 0.003 0.010 0.026 0.058 0.173 0.439 0.166 0.082 0.032 0.011 308 A 0.001 0.001 0.002 0.002 0.001 0.002 0.017 0.065 0.197 0.319 0.393 309 L 0.003 0.009 0.050 0.101 0.164 0.240 0.255 0.094 0.046 0.024 0.013 310 S 0.018 0.049 0.564 0.141 0.097 0.063 0.041 0.014 0.008 0.003 0.002 311 K 0.034 0.044 0.032 0.109 0.148 0.207 0.264 0.095 0.038 0.020 0.009 312 N 0.505 0.202 0.061 0.085 0.049 0.034 0.028 0.014 0.010 0.007 0.005 313 V 0.022 0.063 0.038 0.105 0.123 0.126 0.170 0.125 0.102 0.075 0.052 314 G 0.335 0.133 0.056 0.120 0.115 0.086 0.076 0.034 0.023 0.012 0.009 315 S 0.050 0.081 0.058 0.116 0.126 0.132 0.185 0.101 0.074 0.045 0.032 316 K 0.121 0.192 0.098 0.260 0.152 0.087 0.054 0.018 0.010 0.006 0.004 317 I 0.005 0.003 0.003 0.007 0.011 0.022 0.071 0.119 0.224 0.257 0.278 318 K 0.170 0.232 0.146 0.262 0.108 0.045 0.023 0.007 0.004 0.002 0.001 319 F 0.030 0.052 0.046 0.119 0.124 0.142 0.199 0.122 0.086 0.053 0.028 320 F 0.020 0.017 0.017 0.040 0.044 0.061 0.122 0.130 0.178 0.184 0.188 321 R 0.062 0.122 0.087 0.226 0.181 0.122 0.107 0.043 0.029 0.014 0.007 322 I 0.081 0.081 0.062 0.109 0.094 0.085 0.118 0.108 0.112 0.093 0.057