# TARGET T0220 # Using neural net t04-2621-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-str2-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 13 (1 str2 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0220.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 864 # Pos AA A B C E G H M P Q S T Y Z 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.006 0.017 0.669 0.014 0.009 0.014 0.002 0.001 0.017 0.115 0.024 0.042 0.072 2 E 0.011 0.014 0.525 0.032 0.011 0.015 0.008 0.001 0.080 0.077 0.017 0.059 0.153 3 T 0.032 0.016 0.270 0.033 0.010 0.017 0.022 0.003 0.188 0.072 0.009 0.143 0.187 4 L 0.037 0.010 0.115 0.009 0.008 0.014 0.031 0.005 0.401 0.038 0.009 0.135 0.187 5 I 0.024 0.026 0.176 0.009 0.003 0.012 0.034 0.010 0.381 0.016 0.010 0.065 0.235 6 L 0.012 0.076 0.410 0.003 0.001 0.006 0.011 0.005 0.154 0.052 0.013 0.190 0.066 7 T 0.001 0.006 0.839 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.020 0.040 0.003 0.003 0.083 8 Q 0.001 0.001 0.004 0.001 0.037 0.936 0.001 0.001 0.001 0.003 0.018 0.001 0.001 9 E 0.001 0.001 0.002 0.001 0.065 0.920 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 0.001 0.001 10 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.122 0.868 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 11 V 0.001 0.001 0.008 0.001 0.028 0.955 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 12 E 0.001 0.001 0.004 0.001 0.072 0.897 0.001 0.001 0.001 0.002 0.021 0.001 0.001 13 S 0.001 0.001 0.004 0.001 0.039 0.863 0.001 0.001 0.001 0.005 0.085 0.001 0.001 14 L 0.001 0.001 0.020 0.001 0.054 0.724 0.001 0.001 0.001 0.015 0.182 0.001 0.002 15 I 0.001 0.026 0.149 0.001 0.029 0.369 0.001 0.001 0.005 0.316 0.101 0.003 0.002 16 S 0.001 0.008 0.484 0.001 0.053 0.169 0.001 0.001 0.003 0.125 0.152 0.002 0.003 17 M 0.001 0.004 0.106 0.001 0.139 0.582 0.001 0.001 0.003 0.040 0.124 0.001 0.002 18 D 0.001 0.001 0.038 0.001 0.191 0.640 0.001 0.001 0.001 0.022 0.107 0.001 0.001 19 E 0.001 0.003 0.051 0.001 0.211 0.592 0.001 0.001 0.001 0.033 0.108 0.001 0.001 20 A 0.001 0.004 0.061 0.001 0.128 0.638 0.001 0.001 0.004 0.022 0.141 0.001 0.001 21 M 0.001 0.003 0.085 0.001 0.044 0.754 0.001 0.001 0.003 0.055 0.053 0.001 0.001 22 N 0.001 0.001 0.026 0.001 0.022 0.899 0.001 0.001 0.001 0.012 0.038 0.001 0.001 23 A 0.001 0.001 0.013 0.001 0.009 0.952 0.001 0.001 0.001 0.005 0.019 0.001 0.001 24 V 0.001 0.001 0.008 0.001 0.004 0.975 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 0.001 0.001 25 E 0.001 0.001 0.006 0.001 0.004 0.980 0.001 0.001 0.001 0.004 0.006 0.001 0.001 26 E 0.001 0.001 0.003 0.001 0.003 0.982 0.001 0.001 0.001 0.002 0.010 0.001 0.001 27 A 0.001 0.001 0.002 0.001 0.002 0.979 0.001 0.001 0.001 0.001 0.014 0.001 0.001 28 F 0.001 0.001 0.007 0.001 0.003 0.973 0.001 0.001 0.001 0.003 0.012 0.001 0.001 29 R 0.001 0.001 0.013 0.001 0.009 0.937 0.001 0.001 0.001 0.008 0.026 0.003 0.001 30 L 0.002 0.001 0.013 0.001 0.013 0.902 0.001 0.001 0.002 0.010 0.047 0.003 0.005 31 Y 0.004 0.003 0.056 0.001 0.018 0.784 0.001 0.001 0.004 0.023 0.090 0.005 0.011 32 A 0.003 0.016 0.102 0.002 0.024 0.531 0.001 0.001 0.005 0.042 0.247 0.013 0.014 33 L 0.001 0.004 0.067 0.004 0.018 0.150 0.001 0.001 0.001 0.077 0.671 0.003 0.004 34 G 0.001 0.003 0.168 0.006 0.020 0.026 0.001 0.001 0.001 0.140 0.624 0.006 0.004 35 K 0.004 0.015 0.613 0.002 0.029 0.024 0.001 0.001 0.009 0.103 0.100 0.030 0.069 36 A 0.015 0.050 0.351 0.005 0.033 0.023 0.009 0.002 0.037 0.101 0.062 0.043 0.271 37 Q 0.015 0.021 0.485 0.023 0.015 0.012 0.010 0.002 0.034 0.118 0.042 0.145 0.076 38 M 0.005 0.027 0.619 0.003 0.002 0.006 0.003 0.001 0.015 0.152 0.009 0.081 0.077 39 P 0.001 0.011 0.887 0.003 0.001 0.003 0.001 0.001 0.005 0.029 0.004 0.008 0.048 40 P 0.005 0.009 0.324 0.036 0.182 0.137 0.002 0.001 0.011 0.088 0.133 0.018 0.055 41 K 0.024 0.006 0.128 0.047 0.267 0.147 0.007 0.002 0.018 0.119 0.117 0.067 0.052 42 V 0.041 0.016 0.094 0.007 0.207 0.204 0.019 0.008 0.079 0.040 0.041 0.096 0.149 43 Y 0.055 0.047 0.149 0.023 0.030 0.170 0.021 0.013 0.131 0.030 0.025 0.065 0.241 44 L 0.048 0.039 0.237 0.055 0.018 0.101 0.016 0.014 0.107 0.048 0.040 0.176 0.100 45 E 0.021 0.030 0.290 0.020 0.021 0.080 0.008 0.016 0.093 0.101 0.073 0.047 0.200 46 F 0.012 0.021 0.341 0.022 0.063 0.083 0.003 0.004 0.017 0.141 0.178 0.045 0.068 47 E 0.007 0.017 0.222 0.008 0.097 0.108 0.002 0.003 0.013 0.122 0.342 0.031 0.029 48 K 0.002 0.007 0.131 0.009 0.107 0.085 0.001 0.001 0.004 0.137 0.499 0.006 0.011 49 G 0.003 0.009 0.250 0.008 0.062 0.072 0.001 0.002 0.009 0.227 0.330 0.016 0.012 50 D 0.015 0.035 0.388 0.007 0.066 0.102 0.007 0.010 0.029 0.117 0.118 0.030 0.077 51 L 0.081 0.053 0.192 0.007 0.062 0.139 0.036 0.041 0.076 0.038 0.053 0.070 0.154 52 R 0.096 0.029 0.123 0.043 0.058 0.138 0.041 0.054 0.076 0.061 0.107 0.120 0.054 53 A 0.064 0.027 0.192 0.010 0.043 0.127 0.030 0.028 0.066 0.121 0.094 0.048 0.149 54 M 0.011 0.015 0.463 0.019 0.020 0.071 0.004 0.006 0.041 0.175 0.043 0.089 0.045 55 P 0.007 0.012 0.299 0.019 0.130 0.191 0.002 0.002 0.017 0.088 0.154 0.016 0.064 56 A 0.014 0.009 0.150 0.010 0.235 0.237 0.002 0.001 0.006 0.102 0.172 0.032 0.029 57 H 0.024 0.019 0.158 0.010 0.204 0.271 0.004 0.003 0.012 0.071 0.146 0.024 0.057 58 L 0.019 0.017 0.184 0.017 0.161 0.274 0.004 0.002 0.015 0.074 0.128 0.042 0.061 59 M 0.014 0.005 0.096 0.012 0.115 0.260 0.002 0.002 0.005 0.082 0.346 0.032 0.028 60 G 0.044 0.008 0.112 0.012 0.106 0.159 0.004 0.004 0.012 0.090 0.352 0.032 0.065 61 Y 0.102 0.014 0.172 0.012 0.069 0.146 0.013 0.004 0.041 0.061 0.064 0.072 0.230 62 A 0.128 0.011 0.145 0.124 0.030 0.072 0.035 0.012 0.062 0.088 0.097 0.086 0.111 63 G 0.156 0.007 0.074 0.015 0.015 0.038 0.056 0.036 0.129 0.047 0.057 0.279 0.093 64 L 0.215 0.007 0.094 0.007 0.004 0.019 0.062 0.042 0.111 0.017 0.008 0.035 0.379 65 K 0.132 0.005 0.068 0.028 0.003 0.019 0.049 0.031 0.136 0.037 0.007 0.455 0.030 66 W 0.105 0.008 0.114 0.015 0.005 0.017 0.047 0.048 0.174 0.021 0.013 0.029 0.405 67 V 0.113 0.026 0.234 0.041 0.014 0.022 0.066 0.041 0.115 0.029 0.052 0.105 0.141 68 N 0.099 0.033 0.267 0.027 0.017 0.015 0.039 0.017 0.069 0.088 0.074 0.129 0.126 69 S 0.020 0.035 0.456 0.010 0.020 0.013 0.006 0.005 0.042 0.188 0.067 0.043 0.094 70 H 0.001 0.017 0.695 0.003 0.014 0.006 0.001 0.001 0.009 0.160 0.049 0.026 0.019 71 P 0.001 0.013 0.203 0.004 0.026 0.006 0.001 0.001 0.002 0.159 0.566 0.004 0.017 72 G 0.001 0.025 0.196 0.002 0.022 0.007 0.001 0.001 0.002 0.230 0.500 0.006 0.008 73 N 0.001 0.030 0.568 0.001 0.009 0.003 0.001 0.001 0.001 0.342 0.021 0.017 0.007 74 P 0.001 0.014 0.281 0.002 0.054 0.017 0.001 0.001 0.001 0.145 0.468 0.002 0.016 75 D 0.001 0.017 0.196 0.002 0.101 0.017 0.001 0.001 0.001 0.166 0.482 0.008 0.008 76 K 0.002 0.033 0.384 0.002 0.070 0.018 0.001 0.001 0.002 0.242 0.216 0.014 0.016 77 G 0.003 0.029 0.534 0.004 0.031 0.028 0.001 0.001 0.003 0.167 0.159 0.005 0.036 78 L 0.003 0.018 0.536 0.002 0.013 0.050 0.001 0.001 0.003 0.268 0.037 0.058 0.012 79 P 0.004 0.018 0.460 0.005 0.033 0.223 0.002 0.001 0.005 0.076 0.109 0.009 0.055 80 T 0.016 0.032 0.305 0.013 0.040 0.327 0.008 0.005 0.016 0.069 0.087 0.041 0.041 81 V 0.057 0.025 0.090 0.010 0.046 0.514 0.015 0.005 0.028 0.037 0.052 0.049 0.073 82 M 0.059 0.010 0.081 0.030 0.034 0.545 0.014 0.006 0.035 0.028 0.036 0.034 0.088 83 A 0.100 0.003 0.051 0.056 0.020 0.525 0.015 0.007 0.024 0.038 0.029 0.072 0.059 84 L 0.155 0.006 0.034 0.008 0.013 0.467 0.029 0.011 0.032 0.017 0.016 0.073 0.140 85 M 0.226 0.007 0.027 0.004 0.008 0.450 0.039 0.013 0.016 0.007 0.011 0.101 0.092 86 I 0.279 0.005 0.048 0.013 0.010 0.379 0.024 0.007 0.009 0.013 0.027 0.088 0.099 87 L 0.195 0.013 0.076 0.009 0.018 0.331 0.013 0.003 0.005 0.028 0.104 0.063 0.142 88 N 0.030 0.012 0.268 0.016 0.019 0.205 0.002 0.001 0.002 0.139 0.228 0.032 0.045 89 S 0.001 0.010 0.611 0.003 0.012 0.040 0.001 0.001 0.002 0.226 0.060 0.011 0.023 90 P 0.001 0.005 0.396 0.002 0.111 0.072 0.001 0.001 0.001 0.119 0.275 0.006 0.012 91 E 0.002 0.017 0.200 0.002 0.163 0.078 0.001 0.001 0.002 0.128 0.378 0.014 0.015 92 T 0.002 0.014 0.158 0.005 0.094 0.062 0.001 0.001 0.005 0.130 0.497 0.013 0.018 93 G 0.003 0.013 0.489 0.029 0.011 0.006 0.001 0.001 0.005 0.256 0.146 0.008 0.032 94 F 0.001 0.008 0.775 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.016 0.073 0.004 0.103 0.016 95 P 0.001 0.031 0.556 0.003 0.001 0.001 0.002 0.001 0.047 0.017 0.002 0.003 0.336 96 L 0.003 0.015 0.528 0.048 0.003 0.003 0.005 0.001 0.113 0.042 0.002 0.220 0.016 97 A 0.006 0.017 0.380 0.009 0.007 0.007 0.015 0.006 0.279 0.052 0.007 0.039 0.176 98 V 0.016 0.033 0.321 0.016 0.021 0.015 0.043 0.037 0.255 0.021 0.019 0.051 0.153 99 M 0.019 0.031 0.279 0.039 0.019 0.020 0.038 0.043 0.175 0.069 0.052 0.132 0.084 100 D 0.007 0.011 0.486 0.025 0.016 0.014 0.005 0.012 0.079 0.144 0.074 0.057 0.070 101 A 0.005 0.011 0.296 0.016 0.062 0.058 0.002 0.005 0.031 0.242 0.193 0.026 0.052 102 T 0.010 0.017 0.245 0.025 0.087 0.073 0.003 0.003 0.027 0.203 0.209 0.051 0.047 103 Y 0.021 0.029 0.239 0.015 0.119 0.150 0.007 0.005 0.033 0.125 0.117 0.039 0.103 104 T 0.039 0.026 0.211 0.021 0.062 0.278 0.018 0.018 0.044 0.072 0.089 0.035 0.088 105 T 0.049 0.021 0.137 0.013 0.046 0.344 0.015 0.016 0.028 0.096 0.081 0.103 0.053 106 S 0.045 0.014 0.110 0.005 0.041 0.478 0.012 0.010 0.024 0.051 0.095 0.023 0.092 107 L 0.037 0.013 0.139 0.016 0.031 0.442 0.008 0.007 0.020 0.085 0.090 0.067 0.045 108 R 0.019 0.011 0.169 0.006 0.021 0.513 0.004 0.002 0.014 0.092 0.065 0.020 0.064 109 T 0.005 0.004 0.089 0.003 0.011 0.748 0.002 0.001 0.007 0.052 0.047 0.016 0.014 110 G 0.005 0.004 0.038 0.001 0.007 0.886 0.001 0.001 0.002 0.014 0.028 0.004 0.008 111 A 0.004 0.002 0.013 0.001 0.006 0.951 0.001 0.001 0.001 0.004 0.010 0.002 0.004 112 A 0.004 0.001 0.009 0.001 0.005 0.961 0.001 0.001 0.001 0.004 0.008 0.002 0.003 113 G 0.003 0.001 0.005 0.001 0.003 0.974 0.001 0.001 0.001 0.004 0.007 0.001 0.002 114 G 0.002 0.001 0.002 0.001 0.001 0.984 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 115 I 0.002 0.001 0.003 0.001 0.001 0.983 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 116 A 0.002 0.001 0.006 0.001 0.002 0.973 0.001 0.001 0.001 0.002 0.011 0.001 0.002 117 A 0.002 0.001 0.009 0.001 0.012 0.941 0.001 0.001 0.001 0.007 0.024 0.002 0.002 118 K 0.003 0.001 0.013 0.001 0.023 0.874 0.001 0.001 0.001 0.009 0.070 0.003 0.004 119 Y 0.003 0.002 0.018 0.001 0.035 0.808 0.001 0.001 0.001 0.009 0.117 0.002 0.005 120 L 0.004 0.006 0.087 0.002 0.045 0.655 0.001 0.001 0.001 0.035 0.145 0.007 0.013 121 A 0.005 0.021 0.199 0.007 0.088 0.309 0.001 0.001 0.002 0.096 0.216 0.029 0.028 122 R 0.002 0.008 0.540 0.003 0.059 0.130 0.001 0.001 0.002 0.095 0.122 0.007 0.033 123 K 0.001 0.010 0.380 0.003 0.080 0.083 0.001 0.001 0.002 0.155 0.267 0.009 0.011 124 N 0.001 0.002 0.080 0.009 0.046 0.013 0.001 0.001 0.001 0.137 0.708 0.001 0.002 125 S 0.001 0.002 0.254 0.019 0.024 0.001 0.001 0.001 0.008 0.397 0.286 0.004 0.004 126 S 0.004 0.003 0.630 0.004 0.001 0.001 0.010 0.008 0.174 0.106 0.003 0.025 0.033 127 V 0.016 0.004 0.047 0.003 0.001 0.001 0.070 0.171 0.595 0.012 0.001 0.016 0.066 128 F 0.020 0.001 0.003 0.005 0.001 0.001 0.065 0.800 0.098 0.001 0.001 0.007 0.002 129 G 0.031 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.097 0.831 0.036 0.001 0.001 0.002 0.002 130 F 0.060 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.177 0.705 0.046 0.001 0.001 0.003 0.005 131 I 0.038 0.001 0.051 0.007 0.001 0.001 0.097 0.571 0.194 0.004 0.002 0.021 0.014 132 G 0.013 0.004 0.476 0.037 0.003 0.002 0.010 0.032 0.178 0.135 0.042 0.027 0.041 133 C 0.002 0.008 0.481 0.007 0.014 0.019 0.001 0.003 0.060 0.270 0.099 0.007 0.029 134 G 0.001 0.007 0.160 0.005 0.032 0.211 0.001 0.001 0.014 0.367 0.192 0.004 0.006 135 T 0.001 0.006 0.052 0.001 0.015 0.826 0.001 0.001 0.003 0.056 0.037 0.001 0.002 136 Q 0.001 0.003 0.017 0.001 0.006 0.951 0.001 0.001 0.001 0.008 0.010 0.001 0.002 137 A 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 138 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 139 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 140 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 141 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 142 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 143 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 144 L 0.001 0.001 0.002 0.001 0.002 0.985 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.001 0.001 145 R 0.001 0.001 0.002 0.001 0.022 0.896 0.001 0.001 0.001 0.002 0.077 0.001 0.001 146 R 0.001 0.001 0.008 0.001 0.050 0.699 0.001 0.001 0.001 0.009 0.233 0.001 0.001 147 V 0.001 0.003 0.148 0.001 0.113 0.386 0.001 0.001 0.002 0.083 0.261 0.001 0.002 148 F 0.001 0.015 0.344 0.002 0.063 0.067 0.001 0.001 0.005 0.306 0.191 0.003 0.005 149 D 0.001 0.017 0.643 0.010 0.051 0.008 0.001 0.001 0.007 0.098 0.157 0.004 0.005 150 I 0.001 0.007 0.407 0.005 0.335 0.011 0.001 0.004 0.057 0.076 0.068 0.003 0.025 151 G 0.002 0.002 0.152 0.188 0.171 0.004 0.005 0.009 0.100 0.271 0.071 0.014 0.010 152 E 0.010 0.002 0.040 0.031 0.072 0.003 0.033 0.181 0.502 0.040 0.012 0.038 0.036 153 V 0.007 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.030 0.627 0.306 0.001 0.001 0.003 0.016 154 K 0.015 0.001 0.004 0.003 0.001 0.001 0.069 0.557 0.327 0.001 0.001 0.021 0.002 155 A 0.009 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.053 0.606 0.306 0.001 0.001 0.001 0.014 156 Y 0.024 0.002 0.068 0.047 0.001 0.002 0.062 0.283 0.444 0.016 0.013 0.016 0.021 157 D 0.008 0.008 0.415 0.017 0.004 0.002 0.009 0.012 0.212 0.209 0.033 0.031 0.041 158 V 0.001 0.017 0.296 0.001 0.006 0.004 0.001 0.001 0.067 0.546 0.031 0.014 0.016 159 R 0.001 0.011 0.600 0.001 0.005 0.021 0.001 0.001 0.009 0.319 0.023 0.001 0.010 160 E 0.001 0.001 0.006 0.001 0.024 0.934 0.001 0.001 0.001 0.007 0.028 0.001 0.001 161 K 0.001 0.001 0.006 0.001 0.023 0.954 0.001 0.001 0.001 0.002 0.014 0.001 0.001 162 A 0.001 0.001 0.004 0.001 0.034 0.951 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.001 163 A 0.001 0.001 0.006 0.001 0.005 0.985 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.001 0.001 164 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 165 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 166 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.988 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 167 V 0.001 0.001 0.002 0.001 0.014 0.963 0.001 0.001 0.001 0.003 0.018 0.001 0.001 168 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.957 0.001 0.001 0.001 0.001 0.032 0.001 0.001 169 Y 0.001 0.001 0.002 0.001 0.009 0.944 0.001 0.001 0.001 0.001 0.043 0.001 0.001 170 C 0.001 0.002 0.296 0.001 0.013 0.499 0.001 0.001 0.001 0.170 0.019 0.001 0.001 171 E 0.001 0.003 0.050 0.001 0.170 0.127 0.001 0.001 0.001 0.037 0.611 0.001 0.001 172 D 0.001 0.001 0.023 0.001 0.065 0.031 0.001 0.001 0.001 0.025 0.855 0.001 0.001 173 R 0.001 0.014 0.223 0.001 0.040 0.032 0.001 0.003 0.028 0.324 0.328 0.002 0.003 174 G 0.001 0.010 0.312 0.061 0.004 0.002 0.001 0.001 0.074 0.225 0.299 0.004 0.006 175 I 0.001 0.009 0.520 0.003 0.001 0.001 0.006 0.007 0.378 0.043 0.002 0.012 0.019 176 S 0.001 0.011 0.048 0.003 0.001 0.001 0.009 0.012 0.888 0.007 0.001 0.012 0.007 177 A 0.001 0.006 0.048 0.002 0.001 0.001 0.027 0.030 0.838 0.003 0.002 0.005 0.037 178 S 0.001 0.013 0.103 0.017 0.001 0.001 0.017 0.028 0.772 0.017 0.004 0.009 0.017 179 V 0.001 0.014 0.236 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.443 0.210 0.002 0.078 0.009 180 Q 0.001 0.016 0.789 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.055 0.092 0.001 0.001 0.045 181 P 0.001 0.008 0.079 0.001 0.128 0.639 0.001 0.001 0.002 0.019 0.124 0.001 0.001 182 A 0.001 0.001 0.007 0.001 0.156 0.748 0.001 0.001 0.001 0.004 0.082 0.001 0.001 183 E 0.001 0.001 0.017 0.001 0.293 0.642 0.001 0.001 0.001 0.009 0.037 0.001 0.001 184 E 0.001 0.003 0.046 0.001 0.237 0.660 0.001 0.001 0.001 0.005 0.048 0.001 0.001 185 A 0.001 0.007 0.039 0.001 0.238 0.599 0.001 0.001 0.001 0.029 0.085 0.001 0.001 186 S 0.001 0.004 0.018 0.001 0.182 0.407 0.001 0.002 0.001 0.020 0.366 0.001 0.001 187 R 0.001 0.005 0.119 0.001 0.095 0.134 0.001 0.001 0.002 0.050 0.591 0.001 0.001 188 C 0.001 0.002 0.781 0.001 0.004 0.004 0.001 0.001 0.024 0.161 0.020 0.001 0.001 189 D 0.001 0.001 0.226 0.029 0.005 0.001 0.001 0.004 0.017 0.679 0.038 0.001 0.001 190 V 0.003 0.001 0.015 0.002 0.001 0.001 0.019 0.728 0.218 0.007 0.001 0.004 0.003 191 L 0.008 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.065 0.875 0.046 0.001 0.001 0.001 0.001 192 V 0.004 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.062 0.861 0.067 0.001 0.001 0.001 0.001 193 T 0.006 0.001 0.037 0.003 0.001 0.001 0.026 0.548 0.366 0.002 0.001 0.008 0.003 194 T 0.004 0.011 0.451 0.003 0.002 0.001 0.013 0.072 0.336 0.061 0.006 0.004 0.036 195 T 0.001 0.018 0.588 0.011 0.009 0.003 0.001 0.003 0.087 0.219 0.027 0.017 0.014 196 P 0.001 0.007 0.362 0.005 0.046 0.005 0.001 0.001 0.009 0.294 0.265 0.001 0.006 197 S 0.001 0.007 0.283 0.001 0.059 0.006 0.001 0.001 0.003 0.261 0.373 0.002 0.003 198 R 0.001 0.010 0.323 0.001 0.047 0.007 0.001 0.001 0.003 0.475 0.126 0.003 0.004 199 K 0.001 0.013 0.535 0.001 0.021 0.007 0.001 0.001 0.004 0.353 0.049 0.010 0.008 200 P 0.002 0.045 0.579 0.006 0.043 0.010 0.002 0.001 0.011 0.112 0.111 0.006 0.072 201 V 0.011 0.094 0.495 0.007 0.047 0.011 0.005 0.001 0.019 0.084 0.102 0.060 0.065 202 V 0.010 0.091 0.592 0.004 0.018 0.010 0.003 0.001 0.015 0.102 0.027 0.066 0.061 203 K 0.001 0.020 0.847 0.001 0.007 0.006 0.001 0.001 0.004 0.028 0.005 0.014 0.067 204 A 0.001 0.001 0.020 0.001 0.658 0.216 0.001 0.001 0.001 0.009 0.086 0.002 0.006 205 E 0.001 0.003 0.024 0.008 0.679 0.142 0.001 0.001 0.001 0.026 0.111 0.003 0.003 206 W 0.001 0.003 0.027 0.002 0.654 0.149 0.001 0.001 0.003 0.018 0.138 0.002 0.003 207 V 0.001 0.059 0.376 0.009 0.061 0.230 0.001 0.007 0.022 0.156 0.061 0.004 0.014 208 E 0.001 0.013 0.799 0.005 0.024 0.049 0.001 0.001 0.004 0.075 0.024 0.005 0.001 209 E 0.001 0.001 0.021 0.001 0.025 0.015 0.001 0.001 0.001 0.043 0.891 0.001 0.001 210 G 0.001 0.001 0.011 0.002 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 0.970 0.001 0.001 211 T 0.001 0.008 0.711 0.002 0.002 0.001 0.003 0.016 0.173 0.052 0.008 0.008 0.014 212 H 0.006 0.010 0.059 0.002 0.001 0.001 0.029 0.214 0.630 0.008 0.001 0.024 0.016 213 I 0.005 0.002 0.004 0.001 0.001 0.001 0.044 0.726 0.209 0.001 0.001 0.003 0.006 214 N 0.004 0.002 0.007 0.009 0.001 0.002 0.030 0.812 0.124 0.001 0.002 0.005 0.002 215 A 0.004 0.003 0.075 0.010 0.008 0.005 0.031 0.496 0.313 0.018 0.013 0.010 0.015 216 I 0.006 0.016 0.275 0.007 0.028 0.017 0.008 0.198 0.291 0.052 0.052 0.014 0.036 217 G 0.003 0.038 0.387 0.016 0.087 0.036 0.003 0.009 0.067 0.158 0.163 0.011 0.023 218 A 0.001 0.016 0.362 0.011 0.067 0.020 0.001 0.002 0.017 0.302 0.184 0.007 0.012 219 D 0.001 0.031 0.376 0.004 0.055 0.026 0.001 0.002 0.008 0.310 0.174 0.004 0.010 220 G 0.001 0.012 0.411 0.001 0.003 0.004 0.001 0.001 0.002 0.551 0.010 0.005 0.001 221 P 0.001 0.011 0.355 0.002 0.033 0.031 0.001 0.001 0.001 0.146 0.415 0.001 0.005 222 G 0.001 0.021 0.211 0.002 0.053 0.044 0.001 0.001 0.003 0.170 0.488 0.004 0.003 223 K 0.001 0.024 0.429 0.003 0.086 0.083 0.001 0.001 0.005 0.233 0.114 0.003 0.018 224 Q 0.004 0.025 0.341 0.005 0.068 0.188 0.002 0.001 0.012 0.202 0.109 0.026 0.018 225 E 0.004 0.035 0.412 0.002 0.047 0.227 0.002 0.001 0.014 0.109 0.086 0.015 0.046 226 L 0.005 0.057 0.470 0.001 0.023 0.197 0.002 0.001 0.013 0.116 0.056 0.025 0.035 227 D 0.003 0.012 0.619 0.001 0.007 0.233 0.001 0.001 0.004 0.053 0.014 0.013 0.041 228 V 0.001 0.001 0.007 0.001 0.021 0.958 0.001 0.001 0.001 0.003 0.008 0.001 0.001 229 E 0.001 0.001 0.005 0.001 0.031 0.946 0.001 0.001 0.001 0.002 0.010 0.002 0.001 230 I 0.002 0.001 0.006 0.001 0.065 0.897 0.001 0.001 0.001 0.003 0.019 0.001 0.004 231 L 0.002 0.002 0.040 0.001 0.037 0.859 0.001 0.001 0.001 0.009 0.040 0.002 0.005 232 K 0.002 0.004 0.041 0.006 0.045 0.532 0.001 0.001 0.003 0.019 0.337 0.006 0.003 233 K 0.001 0.001 0.040 0.003 0.023 0.123 0.001 0.001 0.003 0.046 0.757 0.001 0.003 234 A 0.002 0.003 0.534 0.005 0.016 0.046 0.002 0.001 0.033 0.195 0.139 0.009 0.015 235 K 0.003 0.010 0.321 0.006 0.007 0.023 0.010 0.008 0.402 0.125 0.011 0.035 0.039 236 I 0.008 0.008 0.068 0.002 0.002 0.015 0.037 0.086 0.668 0.012 0.002 0.028 0.064 237 V 0.031 0.004 0.029 0.012 0.001 0.015 0.092 0.327 0.428 0.003 0.004 0.032 0.021 238 V 0.022 0.011 0.107 0.005 0.002 0.024 0.079 0.269 0.370 0.014 0.013 0.024 0.061 239 D 0.012 0.013 0.363 0.015 0.006 0.026 0.015 0.069 0.208 0.121 0.043 0.077 0.032 240 D 0.003 0.010 0.448 0.007 0.014 0.066 0.001 0.006 0.048 0.273 0.079 0.008 0.038 241 L 0.001 0.005 0.124 0.004 0.060 0.633 0.001 0.001 0.004 0.085 0.073 0.003 0.008 242 E 0.001 0.003 0.045 0.001 0.063 0.804 0.001 0.001 0.002 0.029 0.044 0.005 0.003 243 Q 0.003 0.003 0.039 0.001 0.064 0.843 0.001 0.001 0.002 0.011 0.022 0.002 0.009 244 A 0.010 0.005 0.046 0.002 0.050 0.814 0.002 0.001 0.003 0.018 0.026 0.008 0.013 245 K 0.009 0.005 0.046 0.003 0.033 0.786 0.001 0.001 0.002 0.024 0.069 0.011 0.012 246 H 0.004 0.004 0.045 0.001 0.015 0.747 0.001 0.001 0.002 0.021 0.145 0.006 0.010 247 G 0.001 0.003 0.085 0.001 0.008 0.671 0.001 0.001 0.001 0.037 0.188 0.002 0.003 248 G 0.001 0.002 0.111 0.001 0.014 0.631 0.001 0.001 0.001 0.054 0.184 0.002 0.002 249 E 0.001 0.005 0.119 0.001 0.012 0.777 0.001 0.001 0.003 0.033 0.034 0.004 0.010 250 I 0.002 0.005 0.035 0.001 0.008 0.896 0.001 0.001 0.004 0.017 0.017 0.004 0.009 251 N 0.003 0.001 0.028 0.001 0.004 0.934 0.001 0.001 0.003 0.007 0.008 0.004 0.006 252 V 0.004 0.001 0.018 0.001 0.004 0.945 0.001 0.001 0.002 0.005 0.005 0.007 0.006 253 A 0.006 0.001 0.017 0.001 0.010 0.934 0.001 0.001 0.002 0.005 0.009 0.004 0.010 254 V 0.006 0.002 0.021 0.001 0.015 0.908 0.001 0.001 0.002 0.008 0.024 0.005 0.008 255 S 0.007 0.002 0.026 0.001 0.016 0.814 0.001 0.001 0.002 0.012 0.100 0.011 0.007 256 K 0.003 0.002 0.026 0.001 0.028 0.355 0.001 0.001 0.001 0.022 0.553 0.003 0.006 257 G 0.002 0.003 0.094 0.001 0.031 0.189 0.001 0.001 0.001 0.062 0.605 0.007 0.005 258 V 0.002 0.014 0.421 0.002 0.034 0.107 0.001 0.001 0.007 0.156 0.225 0.003 0.028 259 I 0.001 0.022 0.483 0.001 0.007 0.041 0.001 0.001 0.009 0.344 0.034 0.057 0.003 260 G 0.001 0.013 0.881 0.001 0.005 0.030 0.001 0.001 0.003 0.031 0.012 0.001 0.023 261 V 0.001 0.003 0.071 0.001 0.115 0.763 0.001 0.001 0.001 0.008 0.037 0.001 0.001 262 E 0.001 0.001 0.009 0.001 0.063 0.903 0.001 0.001 0.001 0.007 0.017 0.001 0.001 263 D 0.001 0.001 0.004 0.001 0.058 0.927 0.001 0.001 0.001 0.003 0.006 0.001 0.001 264 V 0.001 0.001 0.006 0.001 0.016 0.969 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.001 0.001 265 H 0.001 0.001 0.006 0.001 0.007 0.969 0.001 0.001 0.002 0.003 0.010 0.001 0.001 266 A 0.001 0.001 0.005 0.001 0.005 0.957 0.001 0.001 0.001 0.006 0.024 0.001 0.001 267 T 0.001 0.001 0.012 0.001 0.003 0.947 0.001 0.001 0.001 0.006 0.029 0.001 0.001 268 I 0.001 0.001 0.008 0.001 0.002 0.978 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 0.001 0.001 269 G 0.001 0.001 0.003 0.001 0.002 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 270 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 271 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 272 I 0.001 0.001 0.002 0.001 0.002 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 273 A 0.001 0.001 0.002 0.001 0.004 0.883 0.001 0.001 0.001 0.002 0.104 0.001 0.001 274 G 0.001 0.001 0.021 0.001 0.008 0.621 0.001 0.001 0.001 0.025 0.320 0.001 0.001 275 L 0.001 0.012 0.302 0.001 0.029 0.446 0.001 0.001 0.006 0.098 0.095 0.002 0.008 276 K 0.001 0.026 0.325 0.002 0.067 0.273 0.001 0.001 0.010 0.165 0.107 0.012 0.012 277 D 0.001 0.011 0.239 0.006 0.095 0.153 0.001 0.001 0.008 0.121 0.338 0.011 0.016 278 G 0.002 0.013 0.215 0.007 0.117 0.089 0.001 0.001 0.006 0.146 0.380 0.007 0.017 279 R 0.003 0.026 0.445 0.003 0.057 0.043 0.001 0.001 0.008 0.236 0.129 0.025 0.022 280 E 0.001 0.027 0.567 0.003 0.042 0.037 0.001 0.001 0.006 0.147 0.127 0.013 0.030 281 S 0.001 0.024 0.580 0.005 0.041 0.041 0.001 0.001 0.006 0.133 0.142 0.007 0.019 282 D 0.001 0.008 0.485 0.005 0.115 0.086 0.001 0.001 0.003 0.154 0.126 0.004 0.011 283 E 0.002 0.005 0.203 0.005 0.206 0.173 0.001 0.001 0.005 0.212 0.165 0.015 0.009 284 E 0.009 0.014 0.214 0.011 0.186 0.247 0.004 0.004 0.027 0.073 0.106 0.025 0.080 285 I 0.040 0.022 0.200 0.019 0.083 0.254 0.015 0.019 0.071 0.044 0.029 0.060 0.144 286 T 0.074 0.018 0.145 0.021 0.020 0.185 0.026 0.032 0.105 0.037 0.024 0.238 0.074 287 I 0.089 0.022 0.089 0.005 0.033 0.256 0.031 0.047 0.098 0.016 0.029 0.035 0.249 288 F 0.040 0.011 0.112 0.052 0.034 0.457 0.015 0.046 0.055 0.024 0.052 0.054 0.047 289 D 0.023 0.005 0.110 0.028 0.066 0.418 0.005 0.005 0.019 0.110 0.106 0.057 0.048 290 S 0.010 0.003 0.075 0.005 0.064 0.561 0.003 0.003 0.016 0.055 0.152 0.011 0.041 291 T 0.022 0.012 0.090 0.009 0.049 0.494 0.006 0.006 0.027 0.073 0.134 0.051 0.025 292 G 0.021 0.014 0.114 0.008 0.022 0.538 0.009 0.009 0.050 0.047 0.050 0.014 0.103 293 L 0.008 0.006 0.108 0.007 0.014 0.629 0.004 0.004 0.030 0.071 0.036 0.073 0.011 294 A 0.003 0.007 0.079 0.001 0.006 0.804 0.002 0.003 0.023 0.018 0.015 0.004 0.035 295 I 0.001 0.001 0.005 0.001 0.003 0.979 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.001 0.002 296 Q 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.990 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 297 D 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 298 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 299 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 300 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 301 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 302 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 303 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 304 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 305 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 306 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 307 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.972 0.001 0.001 0.001 0.001 0.024 0.001 0.001 308 A 0.001 0.001 0.006 0.001 0.007 0.910 0.001 0.001 0.001 0.003 0.074 0.001 0.001 309 L 0.001 0.001 0.014 0.001 0.030 0.753 0.001 0.001 0.001 0.009 0.192 0.001 0.001 310 S 0.001 0.001 0.038 0.001 0.052 0.548 0.001 0.001 0.001 0.019 0.342 0.001 0.001 311 K 0.001 0.002 0.066 0.001 0.041 0.298 0.001 0.001 0.001 0.093 0.498 0.001 0.001 312 N 0.001 0.006 0.438 0.001 0.020 0.085 0.001 0.001 0.002 0.206 0.241 0.001 0.002 313 V 0.001 0.019 0.450 0.005 0.052 0.104 0.001 0.001 0.007 0.160 0.190 0.004 0.009 314 G 0.002 0.016 0.251 0.028 0.103 0.083 0.001 0.001 0.013 0.175 0.299 0.012 0.016 315 S 0.011 0.024 0.291 0.007 0.102 0.123 0.007 0.008 0.091 0.134 0.054 0.077 0.070 316 K 0.017 0.044 0.287 0.014 0.032 0.155 0.014 0.025 0.150 0.031 0.025 0.042 0.164 317 I 0.041 0.033 0.191 0.019 0.080 0.215 0.021 0.032 0.100 0.028 0.031 0.082 0.126 318 K 0.050 0.011 0.142 0.060 0.103 0.216 0.012 0.014 0.034 0.064 0.119 0.110 0.067 319 F 0.037 0.011 0.192 0.019 0.143 0.155 0.010 0.006 0.021 0.071 0.168 0.039 0.130 320 F 0.009 0.018 0.538 0.011 0.024 0.048 0.004 0.003 0.014 0.136 0.081 0.059 0.055 321 R 0.002 0.011 0.804 0.003 0.005 0.011 0.001 0.001 0.005 0.061 0.039 0.024 0.033 322 I 0.001 0.006 0.904 0.001 0.003 0.007 0.001 0.001 0.002 0.047 0.007 0.004 0.017