# TARGET T0220 # Using neural net t04-2621-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0220.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 864 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.211 0.101 0.065 0.115 0.090 0.090 0.103 0.078 0.070 0.048 0.029 2 E 0.283 0.139 0.080 0.149 0.116 0.081 0.075 0.035 0.023 0.012 0.007 3 T 0.099 0.114 0.072 0.163 0.152 0.113 0.124 0.075 0.050 0.026 0.011 4 L 0.053 0.055 0.031 0.093 0.119 0.139 0.190 0.127 0.092 0.069 0.033 5 I 0.024 0.023 0.035 0.068 0.088 0.111 0.219 0.146 0.141 0.091 0.054 6 L 0.005 0.011 0.014 0.032 0.062 0.085 0.196 0.192 0.173 0.144 0.087 7 T 0.026 0.511 0.127 0.173 0.071 0.037 0.027 0.012 0.008 0.005 0.003 8 Q 0.060 0.054 0.034 0.152 0.266 0.225 0.140 0.041 0.020 0.006 0.002 9 E 0.942 0.039 0.012 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 10 E 0.004 0.031 0.037 0.251 0.222 0.212 0.176 0.042 0.017 0.005 0.002 11 V 0.001 0.001 0.002 0.002 0.004 0.013 0.078 0.165 0.261 0.263 0.210 12 E 0.006 0.016 0.183 0.254 0.257 0.189 0.072 0.014 0.006 0.002 0.001 13 S 0.010 0.044 0.685 0.170 0.055 0.024 0.009 0.002 0.001 0.001 0.001 14 L 0.001 0.001 0.002 0.007 0.015 0.056 0.248 0.211 0.210 0.155 0.094 15 I 0.001 0.001 0.002 0.003 0.006 0.018 0.109 0.182 0.240 0.249 0.190 16 S 0.021 0.176 0.421 0.210 0.106 0.041 0.016 0.005 0.003 0.002 0.001 17 M 0.018 0.044 0.057 0.100 0.134 0.211 0.230 0.100 0.061 0.033 0.012 18 D 0.508 0.153 0.048 0.088 0.069 0.045 0.044 0.021 0.014 0.007 0.003 19 E 0.208 0.117 0.103 0.188 0.118 0.097 0.081 0.037 0.024 0.014 0.012 20 A 0.009 0.020 0.016 0.032 0.038 0.063 0.150 0.150 0.198 0.190 0.135 21 M 0.005 0.006 0.009 0.021 0.041 0.124 0.263 0.194 0.166 0.105 0.064 22 N 0.135 0.128 0.424 0.178 0.071 0.031 0.018 0.007 0.005 0.003 0.001 23 A 0.006 0.026 0.043 0.123 0.163 0.196 0.217 0.101 0.063 0.039 0.023 24 V 0.001 0.001 0.003 0.003 0.004 0.008 0.041 0.090 0.235 0.309 0.306 25 E 0.003 0.004 0.019 0.085 0.172 0.266 0.276 0.093 0.054 0.021 0.008 26 E 0.014 0.049 0.590 0.213 0.075 0.035 0.016 0.005 0.002 0.001 0.001 27 A 0.001 0.002 0.007 0.017 0.030 0.091 0.270 0.204 0.185 0.126 0.067 28 F 0.001 0.001 0.003 0.003 0.004 0.009 0.056 0.136 0.244 0.298 0.246 29 R 0.003 0.017 0.255 0.227 0.212 0.150 0.086 0.028 0.014 0.006 0.002 30 L 0.003 0.014 0.133 0.092 0.106 0.167 0.200 0.106 0.092 0.059 0.028 31 Y 0.003 0.004 0.005 0.020 0.039 0.080 0.227 0.215 0.197 0.144 0.067 32 A 0.046 0.060 0.046 0.075 0.079 0.110 0.198 0.150 0.122 0.074 0.040 33 L 0.049 0.095 0.139 0.189 0.158 0.121 0.109 0.061 0.042 0.025 0.011 34 G 0.319 0.151 0.083 0.133 0.094 0.075 0.065 0.035 0.025 0.015 0.007 35 K 0.240 0.212 0.093 0.175 0.103 0.062 0.056 0.027 0.018 0.010 0.005 36 A 0.070 0.025 0.018 0.035 0.037 0.054 0.128 0.143 0.193 0.168 0.129 37 Q 0.142 0.133 0.069 0.167 0.124 0.113 0.111 0.062 0.043 0.024 0.012 38 M 0.057 0.109 0.059 0.117 0.115 0.114 0.132 0.104 0.094 0.063 0.036 39 P 0.048 0.052 0.022 0.065 0.073 0.088 0.142 0.140 0.154 0.129 0.087 40 P 0.187 0.039 0.018 0.068 0.076 0.085 0.140 0.117 0.124 0.096 0.049 41 K 0.085 0.076 0.047 0.162 0.149 0.131 0.142 0.084 0.066 0.037 0.021 42 V 0.027 0.035 0.043 0.096 0.087 0.121 0.165 0.147 0.133 0.094 0.050 43 Y 0.012 0.019 0.024 0.075 0.090 0.124 0.192 0.175 0.138 0.097 0.055 44 L 0.015 0.026 0.049 0.057 0.071 0.092 0.165 0.162 0.170 0.127 0.065 45 E 0.058 0.109 0.069 0.218 0.178 0.121 0.116 0.061 0.038 0.021 0.010 46 F 0.035 0.030 0.018 0.060 0.076 0.095 0.169 0.153 0.156 0.127 0.081 47 E 0.272 0.185 0.090 0.167 0.105 0.070 0.051 0.025 0.018 0.011 0.007 48 K 0.284 0.200 0.076 0.187 0.103 0.062 0.046 0.020 0.012 0.007 0.003 49 G 0.258 0.100 0.041 0.088 0.078 0.083 0.101 0.084 0.076 0.058 0.034 50 D 0.088 0.147 0.056 0.159 0.139 0.115 0.129 0.068 0.051 0.029 0.018 51 L 0.021 0.015 0.012 0.028 0.031 0.047 0.108 0.141 0.206 0.213 0.177 52 R 0.042 0.056 0.053 0.187 0.178 0.144 0.144 0.080 0.060 0.034 0.021 53 A 0.065 0.061 0.062 0.089 0.079 0.083 0.119 0.116 0.131 0.106 0.090 54 M 0.049 0.050 0.031 0.090 0.093 0.121 0.154 0.129 0.126 0.097 0.059 55 P 0.076 0.057 0.037 0.097 0.104 0.124 0.163 0.121 0.108 0.074 0.039 56 A 0.140 0.082 0.075 0.094 0.081 0.076 0.110 0.089 0.100 0.084 0.069 57 H 0.081 0.062 0.050 0.117 0.106 0.105 0.143 0.097 0.103 0.076 0.061 58 L 0.037 0.025 0.020 0.046 0.044 0.069 0.118 0.124 0.166 0.174 0.176 59 M 0.088 0.081 0.083 0.124 0.111 0.117 0.137 0.095 0.080 0.052 0.030 60 G 0.122 0.092 0.088 0.143 0.115 0.106 0.115 0.077 0.066 0.045 0.030 61 Y 0.025 0.025 0.019 0.044 0.049 0.064 0.121 0.133 0.173 0.178 0.168 62 A 0.024 0.024 0.019 0.063 0.074 0.096 0.157 0.138 0.158 0.135 0.110 63 G 0.029 0.024 0.023 0.053 0.065 0.090 0.173 0.163 0.172 0.127 0.080 64 L 0.011 0.017 0.018 0.052 0.060 0.081 0.134 0.153 0.181 0.164 0.129 65 K 0.005 0.006 0.005 0.015 0.021 0.040 0.105 0.167 0.234 0.232 0.170 66 W 0.005 0.013 0.013 0.056 0.084 0.127 0.216 0.177 0.149 0.098 0.063 67 V 0.004 0.005 0.008 0.012 0.014 0.022 0.083 0.139 0.221 0.268 0.224 68 N 0.018 0.029 0.022 0.110 0.125 0.129 0.180 0.143 0.121 0.078 0.044 69 S 0.035 0.057 0.031 0.090 0.090 0.096 0.151 0.141 0.136 0.109 0.065 70 H 0.043 0.068 0.034 0.127 0.135 0.133 0.179 0.117 0.084 0.056 0.026 71 P 0.154 0.077 0.036 0.097 0.100 0.101 0.145 0.106 0.088 0.059 0.038 72 G 0.390 0.192 0.050 0.130 0.084 0.050 0.044 0.024 0.018 0.012 0.006 73 N 0.234 0.223 0.057 0.134 0.093 0.073 0.070 0.042 0.034 0.024 0.015 74 P 0.229 0.123 0.045 0.129 0.114 0.096 0.098 0.061 0.049 0.034 0.021 75 D 0.491 0.166 0.058 0.102 0.063 0.041 0.037 0.018 0.012 0.007 0.004 76 K 0.122 0.114 0.067 0.185 0.155 0.111 0.114 0.061 0.040 0.021 0.010 77 G 0.187 0.157 0.046 0.121 0.104 0.096 0.094 0.064 0.054 0.042 0.033 78 L 0.041 0.069 0.032 0.102 0.121 0.123 0.159 0.127 0.105 0.076 0.044 79 P 0.189 0.109 0.047 0.109 0.116 0.114 0.123 0.074 0.060 0.038 0.021 80 T 0.102 0.110 0.055 0.171 0.147 0.111 0.118 0.074 0.057 0.034 0.022 81 V 0.018 0.024 0.015 0.055 0.070 0.097 0.180 0.162 0.162 0.132 0.084 82 M 0.007 0.010 0.011 0.036 0.053 0.082 0.149 0.148 0.192 0.170 0.141 83 A 0.021 0.022 0.039 0.079 0.079 0.121 0.193 0.141 0.135 0.103 0.067 84 L 0.009 0.015 0.033 0.085 0.088 0.132 0.216 0.156 0.129 0.089 0.048 85 M 0.004 0.006 0.018 0.020 0.021 0.029 0.097 0.155 0.223 0.230 0.197 86 I 0.003 0.005 0.020 0.038 0.044 0.064 0.137 0.151 0.194 0.191 0.153 87 L 0.004 0.013 0.076 0.096 0.116 0.132 0.189 0.128 0.128 0.077 0.041 88 N 0.013 0.033 0.078 0.120 0.134 0.168 0.202 0.111 0.083 0.041 0.016 89 S 0.050 0.058 0.030 0.067 0.072 0.104 0.187 0.158 0.137 0.096 0.042 90 P 0.308 0.131 0.062 0.132 0.087 0.075 0.072 0.048 0.038 0.028 0.017 91 E 0.295 0.177 0.075 0.115 0.091 0.074 0.075 0.041 0.029 0.017 0.011 92 T 0.128 0.109 0.045 0.120 0.104 0.088 0.114 0.095 0.088 0.065 0.044 93 G 0.367 0.142 0.036 0.097 0.082 0.067 0.065 0.046 0.040 0.031 0.026 94 F 0.067 0.108 0.053 0.133 0.139 0.129 0.145 0.092 0.069 0.043 0.022 95 P 0.123 0.059 0.037 0.096 0.104 0.115 0.139 0.103 0.094 0.075 0.056 96 L 0.016 0.017 0.011 0.044 0.057 0.074 0.139 0.156 0.184 0.165 0.138 97 A 0.028 0.034 0.035 0.066 0.069 0.088 0.151 0.139 0.151 0.128 0.110 98 V 0.026 0.023 0.024 0.054 0.051 0.069 0.127 0.139 0.158 0.166 0.163 99 M 0.021 0.022 0.018 0.045 0.059 0.088 0.156 0.153 0.163 0.148 0.128 100 D 0.095 0.111 0.070 0.140 0.112 0.091 0.115 0.084 0.076 0.060 0.045 101 A 0.114 0.045 0.035 0.070 0.070 0.077 0.119 0.100 0.121 0.128 0.121 102 T 0.229 0.159 0.075 0.158 0.109 0.082 0.076 0.039 0.032 0.023 0.017 103 Y 0.040 0.042 0.028 0.092 0.099 0.122 0.158 0.119 0.121 0.099 0.080 104 T 0.039 0.035 0.020 0.049 0.054 0.069 0.124 0.122 0.157 0.152 0.178 105 T 0.065 0.040 0.038 0.079 0.080 0.094 0.144 0.119 0.134 0.114 0.094 106 S 0.055 0.046 0.031 0.093 0.118 0.130 0.159 0.115 0.106 0.080 0.066 107 L 0.043 0.037 0.038 0.070 0.068 0.079 0.121 0.123 0.150 0.144 0.128 108 R 0.038 0.037 0.040 0.085 0.105 0.125 0.172 0.117 0.122 0.089 0.070 109 T 0.027 0.026 0.030 0.044 0.037 0.046 0.098 0.118 0.188 0.197 0.190 110 G 0.032 0.023 0.025 0.048 0.068 0.107 0.164 0.144 0.161 0.127 0.101 111 A 0.032 0.017 0.034 0.035 0.033 0.048 0.105 0.112 0.166 0.188 0.230 112 A 0.012 0.015 0.028 0.038 0.044 0.071 0.141 0.140 0.188 0.175 0.148 113 G 0.012 0.018 0.034 0.043 0.040 0.058 0.125 0.127 0.187 0.182 0.177 114 G 0.021 0.015 0.047 0.033 0.033 0.047 0.092 0.101 0.166 0.206 0.240 115 I 0.008 0.010 0.032 0.036 0.042 0.063 0.133 0.132 0.182 0.184 0.179 116 A 0.004 0.006 0.025 0.024 0.022 0.033 0.091 0.119 0.213 0.240 0.225 117 A 0.006 0.007 0.043 0.055 0.080 0.137 0.227 0.136 0.144 0.098 0.067 118 K 0.036 0.040 0.216 0.136 0.100 0.111 0.137 0.079 0.069 0.044 0.032 119 Y 0.006 0.011 0.029 0.041 0.057 0.110 0.227 0.160 0.163 0.122 0.074 120 L 0.005 0.006 0.012 0.018 0.018 0.032 0.099 0.131 0.200 0.251 0.227 121 A 0.040 0.062 0.081 0.115 0.124 0.132 0.180 0.100 0.081 0.049 0.035 122 R 0.106 0.102 0.105 0.167 0.114 0.115 0.117 0.066 0.051 0.032 0.025 123 K 0.168 0.098 0.048 0.091 0.087 0.105 0.134 0.081 0.074 0.062 0.052 124 N 0.356 0.219 0.075 0.145 0.071 0.053 0.040 0.016 0.013 0.007 0.004 125 S 0.432 0.147 0.059 0.126 0.095 0.049 0.040 0.020 0.015 0.009 0.007 126 S 0.011 0.048 0.040 0.165 0.190 0.155 0.198 0.104 0.055 0.024 0.011 127 V 0.002 0.016 0.021 0.124 0.246 0.271 0.199 0.071 0.031 0.013 0.007 128 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.039 0.130 0.234 0.271 0.318 129 G 0.001 0.001 0.001 0.005 0.012 0.036 0.182 0.255 0.237 0.158 0.113 130 F 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.004 0.029 0.082 0.208 0.306 0.367 131 I 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.008 0.043 0.103 0.204 0.293 0.343 132 G 0.001 0.002 0.002 0.006 0.011 0.021 0.092 0.180 0.254 0.239 0.194 133 C 0.001 0.004 0.004 0.015 0.022 0.035 0.116 0.182 0.235 0.224 0.163 134 G 0.008 0.012 0.008 0.057 0.125 0.172 0.227 0.165 0.131 0.064 0.032 135 T 0.019 0.029 0.026 0.083 0.143 0.191 0.230 0.135 0.085 0.040 0.019 136 Q 0.001 0.002 0.005 0.010 0.013 0.020 0.066 0.134 0.246 0.251 0.252 137 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.041 0.094 0.211 0.290 0.353 138 Y 0.001 0.003 0.020 0.079 0.148 0.201 0.234 0.128 0.093 0.057 0.035 139 F 0.001 0.002 0.023 0.024 0.032 0.048 0.159 0.199 0.221 0.162 0.129 140 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.028 0.077 0.197 0.306 0.388 141 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.008 0.053 0.081 0.189 0.286 0.378 142 E 0.001 0.001 0.035 0.121 0.192 0.262 0.243 0.084 0.039 0.015 0.007 143 A 0.001 0.001 0.002 0.006 0.016 0.066 0.313 0.248 0.188 0.108 0.052 144 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.046 0.148 0.341 0.452 145 R 0.001 0.001 0.010 0.053 0.121 0.186 0.284 0.186 0.106 0.040 0.013 146 R 0.006 0.026 0.245 0.212 0.166 0.166 0.102 0.039 0.021 0.010 0.006 147 V 0.002 0.004 0.004 0.017 0.033 0.094 0.341 0.224 0.147 0.089 0.044 148 F 0.037 0.021 0.007 0.038 0.035 0.072 0.168 0.207 0.186 0.151 0.081 149 D 0.342 0.290 0.098 0.159 0.067 0.027 0.010 0.003 0.002 0.001 0.001 150 I 0.005 0.004 0.003 0.013 0.015 0.022 0.073 0.141 0.230 0.248 0.246 151 G 0.171 0.246 0.063 0.230 0.137 0.082 0.048 0.014 0.006 0.002 0.001 152 E 0.051 0.165 0.068 0.370 0.215 0.089 0.032 0.007 0.002 0.001 0.001 153 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.027 0.098 0.252 0.320 0.295 154 K 0.003 0.037 0.041 0.307 0.352 0.180 0.064 0.012 0.004 0.001 0.001 155 A 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.005 0.030 0.090 0.229 0.316 0.321 156 Y 0.004 0.007 0.008 0.074 0.139 0.213 0.311 0.134 0.072 0.026 0.012 157 D 0.117 0.166 0.081 0.137 0.096 0.080 0.145 0.084 0.059 0.026 0.010 158 V 0.002 0.004 0.003 0.018 0.029 0.044 0.086 0.131 0.185 0.264 0.234 159 R 0.010 0.641 0.086 0.131 0.063 0.033 0.020 0.008 0.004 0.002 0.001 160 E 0.292 0.105 0.052 0.244 0.213 0.064 0.023 0.005 0.002 0.001 0.001 161 K 0.974 0.020 0.004 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 162 A 0.001 0.002 0.007 0.053 0.080 0.237 0.377 0.140 0.073 0.024 0.007 163 A 0.001 0.001 0.003 0.001 0.003 0.015 0.119 0.195 0.251 0.242 0.171 164 K 0.001 0.004 0.698 0.166 0.078 0.039 0.011 0.003 0.001 0.001 0.001 165 K 0.002 0.017 0.520 0.226 0.154 0.061 0.015 0.003 0.001 0.001 0.001 166 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.010 0.090 0.128 0.258 0.280 0.231 167 V 0.001 0.001 0.006 0.016 0.059 0.138 0.409 0.202 0.123 0.037 0.008 168 S 0.014 0.034 0.854 0.073 0.019 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 169 Y 0.002 0.012 0.037 0.076 0.145 0.283 0.329 0.075 0.028 0.010 0.003 170 C 0.001 0.001 0.002 0.001 0.002 0.005 0.032 0.090 0.224 0.316 0.326 171 E 0.059 0.095 0.145 0.234 0.210 0.140 0.079 0.022 0.009 0.004 0.003 172 D 0.151 0.127 0.478 0.159 0.057 0.019 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 173 R 0.011 0.016 0.005 0.046 0.102 0.203 0.333 0.158 0.071 0.039 0.016 174 G 0.384 0.231 0.071 0.127 0.066 0.048 0.037 0.016 0.011 0.005 0.004 175 I 0.004 0.004 0.005 0.011 0.022 0.047 0.128 0.149 0.216 0.223 0.193 176 S 0.210 0.326 0.114 0.207 0.083 0.033 0.018 0.005 0.003 0.001 0.001 177 A 0.009 0.008 0.004 0.014 0.029 0.046 0.138 0.165 0.240 0.197 0.150 178 S 0.114 0.104 0.060 0.201 0.141 0.120 0.127 0.056 0.036 0.023 0.017 179 V 0.040 0.032 0.016 0.062 0.096 0.116 0.213 0.147 0.136 0.094 0.047 180 Q 0.275 0.289 0.081 0.145 0.070 0.048 0.038 0.021 0.015 0.012 0.007 181 P 0.188 0.137 0.038 0.104 0.106 0.106 0.119 0.073 0.059 0.046 0.024 182 A 0.325 0.126 0.058 0.146 0.115 0.084 0.068 0.031 0.026 0.013 0.007 183 E 0.345 0.183 0.139 0.168 0.076 0.038 0.025 0.010 0.008 0.004 0.004 184 E 0.024 0.050 0.064 0.191 0.151 0.180 0.177 0.083 0.045 0.020 0.014 185 A 0.024 0.013 0.017 0.024 0.037 0.067 0.133 0.161 0.170 0.167 0.187 186 S 0.064 0.125 0.270 0.278 0.127 0.068 0.045 0.012 0.006 0.003 0.001 187 R 0.251 0.215 0.226 0.202 0.071 0.024 0.009 0.002 0.001 0.001 0.001 188 C 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.007 0.049 0.129 0.244 0.287 0.278 189 D 0.001 0.016 0.023 0.135 0.231 0.289 0.196 0.064 0.027 0.011 0.008 190 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.050 0.153 0.300 0.265 0.224 191 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.013 0.075 0.161 0.206 0.247 0.292 192 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.018 0.069 0.215 0.316 0.379 193 T 0.001 0.001 0.001 0.007 0.010 0.024 0.095 0.162 0.245 0.240 0.215 194 T 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.014 0.063 0.140 0.221 0.282 0.270 195 T 0.002 0.006 0.004 0.039 0.074 0.098 0.186 0.215 0.184 0.117 0.075 196 P 0.045 0.066 0.021 0.115 0.145 0.144 0.176 0.119 0.087 0.049 0.032 197 S 0.140 0.096 0.045 0.152 0.156 0.119 0.129 0.074 0.048 0.028 0.012 198 R 0.425 0.164 0.047 0.150 0.097 0.052 0.033 0.015 0.009 0.005 0.003 199 K 0.043 0.103 0.043 0.177 0.184 0.176 0.140 0.065 0.041 0.022 0.008 200 P 0.013 0.023 0.011 0.048 0.071 0.118 0.193 0.163 0.161 0.129 0.071 201 V 0.013 0.009 0.008 0.027 0.043 0.072 0.195 0.192 0.188 0.151 0.103 202 V 0.001 0.003 0.003 0.011 0.026 0.051 0.133 0.162 0.216 0.217 0.176 203 K 0.053 0.296 0.137 0.286 0.122 0.046 0.028 0.014 0.009 0.005 0.003 204 A 0.244 0.048 0.037 0.137 0.167 0.134 0.119 0.053 0.036 0.018 0.008 205 E 0.491 0.158 0.100 0.116 0.055 0.028 0.024 0.010 0.008 0.005 0.005 206 W 0.007 0.022 0.021 0.077 0.089 0.165 0.284 0.142 0.107 0.057 0.029 207 V 0.003 0.005 0.006 0.013 0.020 0.044 0.105 0.132 0.163 0.205 0.304 208 E 0.115 0.216 0.340 0.132 0.086 0.049 0.036 0.011 0.007 0.004 0.003 209 E 0.387 0.173 0.098 0.188 0.082 0.039 0.022 0.006 0.003 0.002 0.001 210 G 0.414 0.142 0.037 0.131 0.098 0.062 0.044 0.023 0.018 0.015 0.015 211 T 0.002 0.009 0.009 0.041 0.082 0.152 0.247 0.191 0.145 0.073 0.047 212 H 0.002 0.006 0.008 0.030 0.061 0.116 0.238 0.190 0.161 0.107 0.083 213 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.034 0.096 0.193 0.279 0.388 214 N 0.002 0.001 0.001 0.007 0.010 0.024 0.099 0.166 0.233 0.227 0.229 215 A 0.001 0.001 0.002 0.004 0.004 0.010 0.041 0.098 0.216 0.289 0.334 216 I 0.001 0.002 0.002 0.008 0.010 0.021 0.075 0.142 0.216 0.251 0.272 217 G 0.008 0.009 0.010 0.028 0.036 0.056 0.135 0.177 0.201 0.188 0.153 218 A 0.018 0.028 0.022 0.087 0.108 0.122 0.175 0.147 0.132 0.096 0.065 219 D 0.060 0.056 0.031 0.101 0.112 0.109 0.135 0.124 0.126 0.088 0.059 220 G 0.141 0.084 0.026 0.083 0.095 0.103 0.132 0.103 0.102 0.080 0.051 221 P 0.164 0.092 0.032 0.083 0.090 0.092 0.139 0.104 0.094 0.071 0.040 222 G 0.284 0.142 0.036 0.085 0.082 0.076 0.087 0.062 0.059 0.049 0.037 223 K 0.173 0.145 0.068 0.153 0.126 0.096 0.089 0.055 0.044 0.033 0.018 224 Q 0.162 0.114 0.057 0.142 0.120 0.108 0.114 0.066 0.059 0.038 0.021 225 E 0.333 0.097 0.074 0.099 0.078 0.072 0.096 0.065 0.044 0.028 0.014 226 L 0.025 0.022 0.016 0.036 0.057 0.088 0.164 0.149 0.164 0.162 0.117 227 D 0.031 0.162 0.073 0.124 0.099 0.095 0.132 0.094 0.089 0.062 0.037 228 V 0.085 0.040 0.076 0.182 0.184 0.157 0.130 0.058 0.048 0.027 0.013 229 E 0.315 0.127 0.303 0.133 0.059 0.027 0.020 0.007 0.004 0.002 0.002 230 I 0.002 0.006 0.021 0.055 0.061 0.128 0.271 0.191 0.144 0.080 0.041 231 L 0.002 0.003 0.015 0.016 0.027 0.058 0.151 0.181 0.220 0.198 0.129 232 K 0.020 0.048 0.595 0.176 0.087 0.044 0.020 0.005 0.002 0.001 0.001 233 K 0.067 0.111 0.344 0.243 0.125 0.065 0.031 0.008 0.004 0.002 0.001 234 A 0.007 0.005 0.005 0.014 0.022 0.050 0.162 0.175 0.214 0.204 0.143 235 K 0.098 0.167 0.128 0.276 0.166 0.103 0.046 0.010 0.004 0.001 0.001 236 I 0.002 0.004 0.014 0.013 0.020 0.032 0.092 0.137 0.232 0.248 0.206 237 V 0.011 0.036 0.029 0.129 0.152 0.174 0.229 0.106 0.068 0.040 0.025 238 V 0.003 0.004 0.004 0.009 0.014 0.028 0.114 0.161 0.253 0.224 0.185 239 D 0.046 0.068 0.072 0.192 0.181 0.158 0.123 0.065 0.046 0.029 0.021 240 D 0.064 0.190 0.063 0.165 0.126 0.101 0.119 0.070 0.052 0.033 0.016 241 L 0.018 0.014 0.011 0.049 0.079 0.109 0.177 0.146 0.174 0.129 0.093 242 E 0.441 0.197 0.114 0.134 0.055 0.027 0.017 0.006 0.004 0.002 0.002 243 Q 0.013 0.036 0.037 0.128 0.152 0.166 0.228 0.120 0.072 0.034 0.014 244 A 0.017 0.010 0.012 0.019 0.020 0.034 0.093 0.129 0.192 0.235 0.239 245 K 0.043 0.057 0.066 0.175 0.207 0.173 0.152 0.065 0.037 0.017 0.007 246 H 0.061 0.124 0.229 0.180 0.126 0.104 0.081 0.041 0.028 0.017 0.009 247 G 0.087 0.113 0.038 0.110 0.112 0.112 0.157 0.101 0.078 0.062 0.029 248 G 0.509 0.092 0.032 0.070 0.057 0.054 0.067 0.044 0.038 0.025 0.012 249 E 0.281 0.202 0.079 0.135 0.096 0.070 0.060 0.031 0.024 0.015 0.009 250 I 0.013 0.017 0.012 0.039 0.046 0.087 0.171 0.161 0.202 0.155 0.097 251 N 0.056 0.052 0.066 0.139 0.123 0.137 0.161 0.101 0.088 0.051 0.025 252 V 0.075 0.070 0.296 0.193 0.115 0.087 0.072 0.037 0.031 0.016 0.009 253 A 0.023 0.023 0.078 0.088 0.083 0.117 0.177 0.142 0.125 0.085 0.059 254 V 0.003 0.004 0.018 0.027 0.036 0.080 0.182 0.183 0.199 0.163 0.105 255 S 0.012 0.026 0.261 0.142 0.136 0.137 0.147 0.066 0.043 0.020 0.010 256 K 0.031 0.069 0.326 0.208 0.142 0.101 0.068 0.026 0.017 0.009 0.004 257 G 0.151 0.092 0.076 0.113 0.108 0.118 0.137 0.074 0.065 0.045 0.021 258 V 0.030 0.033 0.029 0.067 0.064 0.086 0.179 0.145 0.152 0.123 0.092 259 I 0.020 0.037 0.047 0.069 0.114 0.142 0.207 0.139 0.113 0.073 0.040 260 G 0.127 0.305 0.117 0.190 0.110 0.063 0.042 0.019 0.013 0.008 0.006 261 V 0.046 0.025 0.013 0.040 0.064 0.095 0.182 0.152 0.164 0.129 0.089 262 E 0.448 0.157 0.082 0.128 0.079 0.046 0.030 0.012 0.010 0.005 0.003 263 D 0.138 0.161 0.107 0.251 0.152 0.090 0.058 0.021 0.012 0.005 0.003 264 V 0.005 0.006 0.004 0.011 0.015 0.031 0.096 0.144 0.209 0.242 0.237 265 H 0.012 0.017 0.019 0.058 0.099 0.158 0.253 0.150 0.117 0.073 0.044 266 A 0.095 0.108 0.327 0.199 0.104 0.064 0.051 0.021 0.016 0.009 0.007 267 T 0.021 0.053 0.058 0.166 0.172 0.187 0.179 0.075 0.043 0.026 0.018 268 I 0.004 0.006 0.008 0.014 0.016 0.023 0.075 0.130 0.235 0.260 0.228 269 G 0.020 0.017 0.030 0.082 0.127 0.185 0.231 0.121 0.097 0.056 0.033 270 E 0.053 0.084 0.400 0.238 0.109 0.063 0.032 0.010 0.006 0.003 0.002 271 V 0.002 0.006 0.011 0.028 0.050 0.109 0.266 0.196 0.157 0.112 0.063 272 I 0.002 0.002 0.004 0.008 0.009 0.019 0.073 0.127 0.218 0.266 0.271 273 A 0.017 0.040 0.141 0.153 0.154 0.141 0.159 0.079 0.061 0.036 0.019 274 G 0.086 0.117 0.195 0.197 0.139 0.106 0.084 0.036 0.023 0.012 0.006 275 L 0.018 0.020 0.017 0.045 0.054 0.087 0.197 0.171 0.165 0.135 0.092 276 K 0.144 0.118 0.079 0.145 0.125 0.112 0.126 0.062 0.048 0.026 0.014 277 D 0.319 0.214 0.126 0.140 0.082 0.049 0.037 0.015 0.010 0.005 0.002 278 G 0.252 0.107 0.048 0.100 0.079 0.078 0.111 0.072 0.067 0.054 0.032 279 R 0.065 0.062 0.033 0.092 0.105 0.126 0.192 0.122 0.097 0.065 0.040 280 E 0.173 0.224 0.119 0.162 0.119 0.081 0.062 0.028 0.018 0.009 0.005 281 S 0.110 0.133 0.070 0.142 0.122 0.115 0.123 0.075 0.052 0.036 0.023 282 D 0.254 0.147 0.056 0.151 0.146 0.095 0.079 0.036 0.021 0.010 0.005 283 E 0.414 0.170 0.104 0.149 0.080 0.041 0.026 0.009 0.005 0.002 0.001 284 E 0.059 0.104 0.073 0.258 0.185 0.142 0.113 0.038 0.018 0.008 0.003 285 I 0.002 0.003 0.004 0.010 0.021 0.052 0.140 0.183 0.232 0.208 0.144 286 T 0.040 0.101 0.134 0.251 0.177 0.119 0.093 0.041 0.023 0.013 0.008 287 I 0.008 0.022 0.045 0.085 0.098 0.125 0.208 0.146 0.122 0.089 0.052 288 F 0.007 0.011 0.015 0.037 0.050 0.075 0.169 0.180 0.187 0.152 0.116 289 D 0.070 0.092 0.059 0.217 0.194 0.139 0.115 0.053 0.034 0.017 0.010 290 S 0.065 0.064 0.072 0.104 0.094 0.102 0.139 0.112 0.111 0.087 0.051 291 T 0.043 0.082 0.047 0.133 0.140 0.129 0.171 0.102 0.081 0.047 0.025 292 G 0.044 0.033 0.018 0.042 0.051 0.080 0.166 0.143 0.164 0.138 0.120 293 L 0.029 0.047 0.028 0.117 0.146 0.159 0.186 0.111 0.088 0.055 0.033 294 A 0.018 0.023 0.020 0.063 0.086 0.122 0.198 0.151 0.156 0.101 0.062 295 I 0.012 0.007 0.016 0.027 0.028 0.038 0.095 0.139 0.213 0.226 0.199 296 Q 0.001 0.005 0.018 0.036 0.054 0.084 0.172 0.178 0.208 0.142 0.100 297 D 0.001 0.005 0.028 0.030 0.032 0.054 0.149 0.174 0.211 0.184 0.133 298 V 0.001 0.002 0.015 0.030 0.057 0.099 0.204 0.170 0.183 0.141 0.098 299 A 0.001 0.003 0.025 0.025 0.026 0.045 0.156 0.183 0.233 0.174 0.128 300 V 0.001 0.001 0.003 0.005 0.009 0.021 0.109 0.168 0.243 0.243 0.198 301 A 0.001 0.001 0.002 0.002 0.004 0.013 0.091 0.130 0.232 0.275 0.252 302 K 0.001 0.002 0.054 0.108 0.151 0.211 0.245 0.106 0.068 0.038 0.018 303 V 0.001 0.001 0.013 0.017 0.026 0.050 0.175 0.204 0.233 0.177 0.104 304 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.029 0.081 0.209 0.332 0.344 305 Y 0.001 0.001 0.005 0.010 0.024 0.065 0.232 0.209 0.234 0.149 0.072 306 E 0.001 0.008 0.202 0.210 0.191 0.191 0.123 0.041 0.021 0.009 0.004 307 N 0.001 0.002 0.008 0.016 0.033 0.118 0.391 0.205 0.143 0.063 0.021 308 A 0.001 0.001 0.002 0.003 0.003 0.009 0.045 0.122 0.236 0.318 0.259 309 L 0.004 0.015 0.054 0.098 0.130 0.185 0.237 0.127 0.080 0.046 0.024 310 S 0.035 0.060 0.392 0.151 0.118 0.093 0.078 0.035 0.023 0.010 0.005 311 K 0.067 0.071 0.051 0.137 0.141 0.165 0.209 0.085 0.043 0.023 0.009 312 N 0.404 0.254 0.062 0.098 0.060 0.044 0.034 0.017 0.014 0.009 0.005 313 V 0.018 0.041 0.018 0.067 0.089 0.115 0.172 0.150 0.144 0.108 0.079 314 G 0.375 0.182 0.067 0.135 0.112 0.064 0.040 0.013 0.007 0.003 0.002 315 S 0.109 0.135 0.092 0.181 0.142 0.106 0.110 0.056 0.037 0.019 0.012 316 K 0.049 0.088 0.053 0.188 0.185 0.167 0.143 0.061 0.037 0.019 0.011 317 I 0.002 0.002 0.003 0.008 0.015 0.030 0.095 0.155 0.234 0.232 0.221 318 K 0.157 0.186 0.205 0.262 0.106 0.046 0.024 0.008 0.004 0.002 0.001 319 F 0.025 0.039 0.055 0.113 0.123 0.153 0.214 0.122 0.084 0.047 0.025 320 F 0.013 0.008 0.005 0.018 0.022 0.039 0.111 0.149 0.196 0.220 0.219 321 R 0.079 0.112 0.051 0.147 0.140 0.129 0.149 0.076 0.060 0.036 0.021 322 I 0.069 0.063 0.051 0.085 0.077 0.076 0.111 0.112 0.137 0.122 0.098