# TARGET T0218 # Using neural net t04-2621-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0218.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 6 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.402 0.132 0.072 0.120 0.076 0.062 0.055 0.034 0.024 0.016 0.008 2 Q 0.472 0.160 0.067 0.135 0.076 0.041 0.029 0.011 0.005 0.002 0.001 3 V 0.063 0.098 0.058 0.103 0.118 0.124 0.179 0.125 0.078 0.039 0.017 4 R 0.140 0.336 0.109 0.194 0.113 0.057 0.028 0.011 0.006 0.004 0.002 5 I 0.069 0.040 0.056 0.080 0.098 0.116 0.178 0.123 0.116 0.077 0.046 6 E 0.346 0.189 0.216 0.156 0.058 0.019 0.011 0.003 0.001 0.001 0.001 7 R 0.053 0.113 0.174 0.321 0.156 0.094 0.059 0.018 0.007 0.003 0.001 8 A 0.029 0.032 0.081 0.062 0.069 0.101 0.177 0.137 0.137 0.110 0.065 9 E 0.032 0.022 0.213 0.085 0.083 0.121 0.229 0.101 0.067 0.032 0.015 10 R 0.022 0.067 0.532 0.229 0.092 0.034 0.017 0.005 0.002 0.001 0.001 11 I 0.004 0.021 0.058 0.041 0.057 0.095 0.182 0.146 0.156 0.143 0.097 12 E 0.057 0.090 0.203 0.177 0.173 0.107 0.104 0.041 0.030 0.012 0.005 13 S 0.314 0.144 0.333 0.097 0.049 0.028 0.023 0.006 0.004 0.002 0.001 14 E 0.098 0.150 0.238 0.218 0.138 0.076 0.051 0.016 0.008 0.004 0.002 15 L 0.039 0.032 0.039 0.041 0.062 0.109 0.233 0.157 0.135 0.093 0.060 16 E 0.156 0.170 0.169 0.183 0.130 0.079 0.069 0.022 0.012 0.006 0.003 17 E 0.433 0.164 0.233 0.097 0.038 0.017 0.010 0.003 0.002 0.001 0.001 18 H 0.154 0.143 0.058 0.149 0.132 0.111 0.124 0.057 0.038 0.023 0.012 19 V 0.062 0.040 0.022 0.041 0.055 0.084 0.165 0.146 0.160 0.130 0.094 20 G 0.290 0.278 0.074 0.115 0.086 0.063 0.051 0.020 0.013 0.007 0.003 21 D 0.341 0.221 0.129 0.170 0.076 0.034 0.017 0.006 0.003 0.001 0.001 22 Q 0.339 0.108 0.051 0.115 0.102 0.090 0.088 0.045 0.032 0.018 0.011 23 T 0.161 0.234 0.151 0.214 0.118 0.059 0.038 0.014 0.007 0.003 0.002 24 F 0.020 0.020 0.018 0.041 0.064 0.110 0.223 0.189 0.154 0.109 0.052 25 V 0.056 0.097 0.109 0.178 0.176 0.135 0.128 0.060 0.036 0.017 0.009 26 E 0.157 0.156 0.240 0.175 0.100 0.065 0.056 0.024 0.015 0.008 0.005 27 E 0.109 0.092 0.073 0.175 0.157 0.131 0.135 0.060 0.037 0.022 0.010 28 S 0.217 0.100 0.060 0.104 0.098 0.102 0.127 0.077 0.059 0.037 0.018 29 R 0.305 0.204 0.136 0.147 0.085 0.052 0.042 0.015 0.009 0.004 0.002 30 F 0.051 0.065 0.066 0.116 0.119 0.128 0.189 0.106 0.076 0.055 0.027 31 L 0.016 0.025 0.017 0.038 0.053 0.079 0.175 0.161 0.171 0.156 0.109 32 E 0.184 0.221 0.188 0.206 0.110 0.049 0.027 0.008 0.004 0.002 0.001 33 E 0.268 0.174 0.163 0.160 0.101 0.062 0.042 0.016 0.008 0.004 0.002 34 D 0.350 0.243 0.105 0.136 0.073 0.038 0.028 0.012 0.008 0.005 0.002 35 E 0.260 0.107 0.072 0.133 0.117 0.108 0.107 0.045 0.030 0.015 0.007 36 Q 0.197 0.176 0.149 0.165 0.098 0.071 0.074 0.033 0.019 0.012 0.007 37 R 0.119 0.130 0.148 0.144 0.112 0.109 0.108 0.051 0.039 0.026 0.015 38 E 0.304 0.188 0.080 0.144 0.082 0.061 0.061 0.031 0.024 0.017 0.009 39 G 0.430 0.142 0.084 0.121 0.068 0.054 0.049 0.021 0.017 0.010 0.005 40 E 0.429 0.159 0.105 0.124 0.060 0.044 0.036 0.016 0.013 0.007 0.006 41 I 0.025 0.044 0.041 0.124 0.109 0.156 0.212 0.120 0.089 0.053 0.028 42 L 0.015 0.021 0.037 0.078 0.106 0.139 0.193 0.143 0.124 0.079 0.065 43 D 0.047 0.102 0.227 0.262 0.171 0.086 0.062 0.026 0.012 0.004 0.001 44 Q 0.016 0.052 0.073 0.232 0.258 0.208 0.111 0.032 0.012 0.004 0.002 45 I 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.010 0.044 0.133 0.249 0.307 0.250 46 I 0.001 0.001 0.002 0.014 0.045 0.113 0.297 0.243 0.159 0.082 0.044 47 F 0.001 0.002 0.004 0.007 0.008 0.014 0.077 0.153 0.251 0.261 0.224 48 V 0.001 0.001 0.001 0.003 0.006 0.017 0.071 0.137 0.233 0.285 0.247 49 D 0.006 0.042 0.015 0.095 0.113 0.108 0.189 0.166 0.141 0.078 0.046 50 G 0.088 0.081 0.032 0.155 0.137 0.117 0.137 0.097 0.077 0.050 0.029 51 K 0.193 0.143 0.065 0.222 0.173 0.093 0.066 0.026 0.012 0.005 0.003 52 R 0.083 0.153 0.047 0.236 0.180 0.122 0.098 0.042 0.024 0.010 0.005 53 R 0.006 0.008 0.007 0.037 0.062 0.109 0.164 0.171 0.186 0.150 0.100 54 S 0.085 0.087 0.040 0.148 0.136 0.137 0.168 0.088 0.061 0.034 0.018 55 F 0.014 0.030 0.030 0.134 0.158 0.190 0.191 0.116 0.072 0.042 0.021 56 V 0.003 0.004 0.004 0.009 0.013 0.024 0.081 0.132 0.220 0.270 0.241 57 R 0.016 0.048 0.047 0.216 0.218 0.173 0.156 0.062 0.036 0.018 0.010 58 I 0.001 0.002 0.002 0.006 0.009 0.013 0.055 0.103 0.213 0.292 0.304 59 T 0.040 0.124 0.073 0.257 0.230 0.134 0.088 0.030 0.015 0.006 0.004 60 T 0.125 0.152 0.048 0.166 0.134 0.124 0.134 0.060 0.031 0.017 0.009 61 D 0.433 0.207 0.067 0.140 0.076 0.038 0.021 0.008 0.005 0.003 0.002 62 E 0.476 0.205 0.056 0.130 0.065 0.035 0.020 0.006 0.004 0.002 0.001 63 G 0.257 0.171 0.046 0.151 0.128 0.085 0.077 0.034 0.024 0.015 0.011 64 I 0.014 0.025 0.009 0.045 0.073 0.117 0.210 0.158 0.164 0.113 0.074 65 T 0.029 0.095 0.047 0.219 0.225 0.172 0.124 0.043 0.027 0.013 0.007 66 G 0.026 0.017 0.014 0.050 0.078 0.117 0.193 0.143 0.153 0.118 0.091 67 I 0.018 0.016 0.016 0.073 0.106 0.138 0.237 0.151 0.119 0.078 0.047 68 F 0.004 0.006 0.010 0.021 0.024 0.036 0.118 0.157 0.232 0.224 0.169 69 A 0.006 0.006 0.031 0.026 0.023 0.034 0.101 0.135 0.198 0.230 0.210 70 E 0.006 0.011 0.061 0.064 0.072 0.102 0.181 0.162 0.145 0.117 0.079 71 L 0.002 0.005 0.046 0.019 0.014 0.017 0.072 0.130 0.214 0.259 0.222 72 C 0.001 0.002 0.014 0.012 0.013 0.023 0.081 0.114 0.193 0.258 0.290 73 V 0.003 0.007 0.053 0.025 0.023 0.038 0.125 0.129 0.207 0.208 0.183 74 G 0.007 0.012 0.040 0.056 0.069 0.110 0.220 0.159 0.152 0.106 0.068 75 A 0.006 0.008 0.017 0.020 0.024 0.050 0.132 0.136 0.202 0.218 0.187 76 V 0.011 0.017 0.025 0.046 0.067 0.088 0.167 0.156 0.179 0.141 0.101 77 I 0.012 0.021 0.021 0.059 0.082 0.101 0.170 0.149 0.159 0.126 0.101 78 W 0.012 0.025 0.026 0.070 0.099 0.124 0.205 0.141 0.124 0.103 0.072 79 D 0.120 0.137 0.079 0.221 0.158 0.104 0.091 0.042 0.026 0.014 0.007 80 R 0.268 0.113 0.067 0.142 0.107 0.099 0.093 0.046 0.031 0.022 0.011 81 E 0.443 0.187 0.059 0.109 0.056 0.036 0.043 0.023 0.019 0.015 0.009 82 G 0.356 0.149 0.035 0.079 0.061 0.057 0.082 0.054 0.053 0.043 0.031 83 G 0.229 0.237 0.049 0.118 0.088 0.073 0.070 0.043 0.038 0.030 0.024 84 T 0.072 0.092 0.041 0.144 0.148 0.142 0.136 0.083 0.069 0.044 0.030 85 K 0.206 0.136 0.084 0.205 0.155 0.094 0.058 0.028 0.018 0.010 0.006 86 T 0.048 0.087 0.067 0.206 0.196 0.140 0.127 0.064 0.039 0.018 0.007 87 L 0.006 0.006 0.007 0.018 0.026 0.042 0.114 0.171 0.226 0.219 0.165 88 F 0.015 0.029 0.036 0.087 0.109 0.130 0.207 0.144 0.119 0.076 0.048 89 S 0.062 0.106 0.096 0.170 0.121 0.098 0.140 0.085 0.066 0.037 0.018 90 P 0.249 0.079 0.039 0.107 0.092 0.092 0.128 0.083 0.062 0.046 0.023 91 D 0.450 0.198 0.038 0.096 0.064 0.043 0.043 0.025 0.022 0.014 0.008 92 K 0.190 0.092 0.032 0.108 0.090 0.093 0.116 0.091 0.083 0.063 0.042 93 P 0.223 0.163 0.041 0.106 0.097 0.096 0.113 0.064 0.049 0.031 0.016 94 P 0.154 0.207 0.061 0.174 0.136 0.099 0.082 0.041 0.026 0.014 0.007 95 V 0.035 0.021 0.010 0.037 0.050 0.065 0.131 0.163 0.191 0.177 0.121 96 K 0.084 0.090 0.103 0.255 0.208 0.117 0.083 0.032 0.018 0.007 0.004 97 E 0.129 0.151 0.192 0.277 0.131 0.064 0.033 0.014 0.007 0.003 0.001 98 R 0.003 0.009 0.008 0.041 0.075 0.141 0.265 0.211 0.135 0.078 0.033 99 V 0.006 0.011 0.016 0.039 0.051 0.078 0.158 0.165 0.182 0.166 0.128 100 L 0.002 0.006 0.015 0.027 0.041 0.064 0.179 0.163 0.209 0.169 0.127 101 G 0.028 0.089 0.120 0.249 0.184 0.128 0.106 0.045 0.026 0.015 0.009 102 F 0.002 0.004 0.003 0.010 0.016 0.025 0.089 0.138 0.215 0.254 0.243 103 S 0.076 0.119 0.076 0.201 0.210 0.134 0.107 0.041 0.024 0.008 0.004 104 Q 0.207 0.154 0.123 0.203 0.128 0.077 0.063 0.023 0.013 0.006 0.003 105 S 0.345 0.212 0.090 0.153 0.082 0.047 0.040 0.014 0.008 0.005 0.003 106 F 0.020 0.017 0.009 0.026 0.040 0.085 0.183 0.172 0.171 0.153 0.124 107 Q 0.283 0.318 0.079 0.128 0.081 0.048 0.034 0.013 0.008 0.004 0.003 108 E 0.503 0.141 0.109 0.100 0.055 0.038 0.026 0.011 0.008 0.004 0.003 109 E 0.267 0.196 0.058 0.160 0.125 0.074 0.064 0.027 0.015 0.009 0.005 110 G 0.138 0.179 0.069 0.165 0.134 0.108 0.091 0.045 0.035 0.021 0.015 111 Y 0.008 0.011 0.008 0.035 0.063 0.099 0.180 0.166 0.168 0.138 0.122 112 E 0.182 0.174 0.175 0.199 0.108 0.066 0.050 0.022 0.013 0.007 0.005 113 E 0.136 0.116 0.077 0.208 0.157 0.114 0.103 0.044 0.027 0.012 0.006 114 V 0.016 0.012 0.007 0.025 0.032 0.054 0.116 0.151 0.190 0.203 0.194 115 G 0.099 0.103 0.037 0.125 0.116 0.119 0.135 0.088 0.081 0.057 0.040 116 G 0.108 0.098 0.068 0.189 0.143 0.122 0.119 0.064 0.044 0.027 0.016 117 I 0.009 0.009 0.005 0.022 0.030 0.047 0.125 0.158 0.194 0.211 0.191 118 L 0.055 0.144 0.090 0.314 0.197 0.105 0.055 0.020 0.012 0.005 0.004 119 F 0.004 0.005 0.004 0.013 0.021 0.039 0.107 0.148 0.260 0.229 0.168 120 K 0.123 0.224 0.142 0.275 0.138 0.057 0.029 0.008 0.003 0.001 0.001 121 V 0.005 0.011 0.006 0.020 0.030 0.043 0.141 0.165 0.221 0.207 0.150 122 V 0.016 0.042 0.036 0.163 0.178 0.172 0.167 0.088 0.067 0.039 0.032 123 K 0.219 0.193 0.125 0.179 0.123 0.073 0.053 0.018 0.010 0.004 0.002 124 E 0.188 0.180 0.110 0.200 0.120 0.081 0.067 0.027 0.015 0.008 0.004 125 G 0.487 0.142 0.045 0.088 0.066 0.053 0.051 0.027 0.020 0.013 0.008 126 K 0.108 0.146 0.082 0.212 0.163 0.119 0.095 0.037 0.022 0.010 0.006 127 D 0.171 0.224 0.169 0.169 0.109 0.066 0.048 0.020 0.013 0.007 0.005 128 A 0.025 0.027 0.016 0.048 0.060 0.095 0.188 0.156 0.158 0.129 0.098 129 M 0.073 0.059 0.041 0.099 0.140 0.157 0.197 0.108 0.073 0.037 0.015 130 Q 0.218 0.165 0.227 0.185 0.092 0.049 0.033 0.014 0.009 0.005 0.003 131 S 0.111 0.163 0.118 0.210 0.140 0.108 0.083 0.033 0.019 0.010 0.005 132 I 0.016 0.011 0.014 0.018 0.023 0.045 0.121 0.156 0.214 0.214 0.169 133 D 0.167 0.170 0.192 0.237 0.123 0.063 0.033 0.008 0.004 0.001 0.001 134 L 0.093 0.093 0.414 0.173 0.088 0.059 0.044 0.017 0.011 0.005 0.003 135 Y 0.043 0.037 0.069 0.100 0.101 0.132 0.221 0.119 0.089 0.054 0.035 136 M 0.025 0.018 0.049 0.048 0.055 0.093 0.210 0.168 0.166 0.107 0.061 137 R 0.019 0.048 0.428 0.191 0.131 0.092 0.057 0.019 0.009 0.004 0.002 138 S 0.104 0.108 0.433 0.174 0.079 0.049 0.033 0.010 0.006 0.003 0.001 139 L 0.096 0.054 0.105 0.073 0.080 0.102 0.197 0.117 0.093 0.058 0.025 140 E 0.077 0.122 0.158 0.125 0.094 0.108 0.150 0.069 0.049 0.032 0.016 141 I 0.012 0.028 0.175 0.105 0.117 0.162 0.201 0.087 0.060 0.036 0.016 142 E 0.190 0.113 0.400 0.140 0.072 0.039 0.031 0.009 0.004 0.002 0.001 143 E 0.097 0.111 0.206 0.277 0.173 0.078 0.038 0.012 0.005 0.002 0.001 144 V 0.006 0.010 0.032 0.020 0.031 0.052 0.147 0.151 0.206 0.207 0.139 145 R 0.010 0.027 0.190 0.211 0.227 0.159 0.126 0.030 0.014 0.004 0.002 146 K 0.033 0.068 0.628 0.167 0.060 0.024 0.014 0.004 0.002 0.001 0.001 147 H 0.060 0.107 0.154 0.165 0.152 0.153 0.128 0.042 0.022 0.012 0.006 148 M 0.008 0.010 0.018 0.016 0.021 0.045 0.142 0.135 0.197 0.195 0.213 149 D 0.171 0.239 0.211 0.142 0.104 0.056 0.050 0.015 0.007 0.003 0.002 150 K 0.380 0.184 0.194 0.166 0.050 0.017 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 151 N 0.162 0.165 0.081 0.212 0.154 0.113 0.068 0.023 0.012 0.007 0.004 152 I 0.001 0.002 0.003 0.015 0.034 0.096 0.201 0.203 0.207 0.139 0.099 153 L 0.001 0.002 0.003 0.008 0.020 0.048 0.160 0.211 0.234 0.191 0.123 154 I 0.001 0.002 0.004 0.016 0.024 0.046 0.133 0.173 0.204 0.209 0.189 155 V 0.001 0.002 0.002 0.012 0.024 0.039 0.129 0.194 0.231 0.205 0.161 156 K 0.066 0.064 0.030 0.173 0.160 0.144 0.159 0.094 0.062 0.032 0.017 157 D 0.150 0.150 0.069 0.199 0.128 0.102 0.097 0.048 0.030 0.018 0.008 158 G 0.099 0.095 0.038 0.138 0.122 0.108 0.130 0.092 0.079 0.061 0.037 159 P 0.204 0.287 0.080 0.173 0.109 0.060 0.044 0.019 0.012 0.007 0.004 160 A 0.042 0.035 0.013 0.048 0.054 0.064 0.132 0.137 0.190 0.153 0.132 161 A 0.040 0.028 0.019 0.075 0.102 0.154 0.203 0.135 0.123 0.072 0.048 162 R 0.110 0.120 0.139 0.267 0.149 0.089 0.062 0.029 0.019 0.010 0.006 163 E 0.040 0.073 0.092 0.161 0.154 0.155 0.146 0.077 0.057 0.029 0.016 164 L 0.005 0.004 0.004 0.010 0.018 0.037 0.108 0.164 0.225 0.240 0.186 165 P 0.129 0.217 0.084 0.188 0.131 0.086 0.085 0.035 0.023 0.013 0.008 166 F 0.021 0.026 0.038 0.060 0.067 0.081 0.143 0.133 0.168 0.135 0.129 167 E 0.242 0.178 0.080 0.194 0.135 0.077 0.054 0.020 0.011 0.005 0.003 168 E 0.400 0.213 0.090 0.144 0.066 0.040 0.026 0.010 0.006 0.003 0.002 169 N 0.308 0.174 0.062 0.143 0.104 0.087 0.063 0.027 0.018 0.010 0.006 170 V 0.010 0.015 0.007 0.029 0.047 0.076 0.149 0.173 0.174 0.161 0.158 171 G 0.081 0.136 0.043 0.144 0.142 0.114 0.143 0.082 0.058 0.035 0.023 172 P 0.053 0.038 0.019 0.085 0.109 0.133 0.184 0.129 0.115 0.084 0.052 173 I 0.006 0.009 0.005 0.027 0.037 0.053 0.128 0.161 0.186 0.200 0.187 174 G 0.010 0.025 0.021 0.096 0.109 0.137 0.161 0.139 0.138 0.099 0.065 175 L 0.007 0.014 0.010 0.045 0.069 0.103 0.205 0.198 0.164 0.119 0.068 176 V 0.005 0.005 0.005 0.016 0.019 0.028 0.086 0.151 0.221 0.239 0.225 177 K 0.006 0.012 0.011 0.061 0.106 0.131 0.218 0.168 0.144 0.089 0.053 178 N 0.097 0.163 0.090 0.296 0.165 0.083 0.056 0.024 0.015 0.007 0.004 179 I 0.022 0.023 0.019 0.057 0.070 0.101 0.196 0.172 0.154 0.121 0.066 180 G 0.136 0.203 0.103 0.197 0.115 0.076 0.078 0.037 0.027 0.016 0.011 181 V 0.038 0.053 0.034 0.127 0.150 0.132 0.178 0.115 0.090 0.053 0.029 182 T 0.310 0.194 0.124 0.177 0.087 0.050 0.032 0.012 0.008 0.004 0.002 183 E 0.065 0.067 0.052 0.139 0.163 0.160 0.197 0.083 0.048 0.020 0.007 184 L 0.004 0.005 0.003 0.008 0.015 0.032 0.096 0.148 0.223 0.254 0.212 185 S 0.058 0.492 0.120 0.166 0.084 0.040 0.022 0.008 0.005 0.003 0.002 186 K 0.419 0.095 0.115 0.194 0.103 0.046 0.020 0.005 0.002 0.001 0.001 187 E 0.801 0.087 0.036 0.036 0.017 0.009 0.007 0.003 0.002 0.001 0.001 188 D 0.002 0.017 0.031 0.091 0.095 0.181 0.293 0.147 0.092 0.035 0.014 189 F 0.006 0.006 0.023 0.042 0.083 0.155 0.261 0.189 0.130 0.071 0.033 190 K 0.065 0.065 0.756 0.079 0.023 0.009 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 191 K 0.003 0.020 0.105 0.238 0.230 0.196 0.139 0.040 0.019 0.007 0.002 192 L 0.001 0.001 0.002 0.002 0.003 0.008 0.047 0.093 0.202 0.268 0.374 193 R 0.036 0.056 0.247 0.271 0.195 0.117 0.059 0.013 0.005 0.002 0.001 194 F 0.016 0.080 0.381 0.213 0.144 0.085 0.053 0.014 0.008 0.003 0.001 195 L 0.001 0.001 0.001 0.004 0.008 0.022 0.091 0.131 0.200 0.237 0.305 196 K 0.276 0.289 0.100 0.146 0.079 0.048 0.040 0.013 0.007 0.003 0.002 197 K 0.210 0.200 0.125 0.234 0.117 0.065 0.032 0.010 0.004 0.002 0.001 198 G 0.188 0.078 0.033 0.083 0.079 0.092 0.121 0.094 0.094 0.077 0.061 199 K 0.047 0.171 0.081 0.271 0.196 0.110 0.075 0.024 0.013 0.006 0.004 200 R 0.008 0.016 0.010 0.036 0.050 0.066 0.138 0.147 0.191 0.173 0.165 201 S 0.020 0.029 0.017 0.067 0.091 0.117 0.201 0.159 0.134 0.090 0.075 202 K 0.207 0.175 0.077 0.244 0.141 0.072 0.048 0.019 0.011 0.005 0.003 203 M 0.011 0.020 0.015 0.063 0.086 0.126 0.193 0.148 0.154 0.118 0.067 204 F 0.005 0.012 0.010 0.041 0.054 0.073 0.164 0.172 0.203 0.158 0.108 205 V 0.004 0.008 0.009 0.026 0.042 0.070 0.193 0.187 0.210 0.154 0.098 206 S 0.068 0.142 0.105 0.230 0.164 0.098 0.090 0.048 0.030 0.015 0.008 207 S 0.225 0.170 0.052 0.161 0.128 0.097 0.085 0.042 0.022 0.012 0.005 208 R 0.353 0.172 0.052 0.158 0.104 0.062 0.048 0.024 0.014 0.008 0.004 209 E 0.448 0.165 0.049 0.114 0.073 0.053 0.045 0.022 0.016 0.009 0.006 210 T 0.121 0.119 0.041 0.111 0.099 0.107 0.146 0.097 0.075 0.054 0.029 211 P 0.439 0.240 0.056 0.112 0.057 0.037 0.029 0.013 0.009 0.005 0.003 212 L 0.162 0.073 0.039 0.096 0.095 0.107 0.134 0.096 0.090 0.065 0.043 213 K 0.224 0.210 0.109 0.224 0.111 0.056 0.037 0.015 0.008 0.004 0.003 214 K 0.028 0.067 0.069 0.213 0.201 0.168 0.140 0.059 0.034 0.015 0.006 215 V 0.004 0.006 0.005 0.025 0.041 0.072 0.181 0.210 0.206 0.160 0.090 216 G 0.019 0.063 0.070 0.268 0.235 0.155 0.099 0.046 0.025 0.013 0.007 217 A 0.002 0.004 0.003 0.018 0.027 0.046 0.154 0.208 0.245 0.201 0.093 218 Y 0.003 0.013 0.014 0.094 0.126 0.165 0.219 0.147 0.105 0.067 0.048 219 V 0.001 0.001 0.002 0.006 0.010 0.019 0.082 0.146 0.266 0.275 0.191 220 K 0.011 0.038 0.026 0.189 0.248 0.175 0.165 0.080 0.043 0.017 0.007 221 L 0.001 0.003 0.002 0.009 0.012 0.021 0.077 0.129 0.249 0.268 0.229 222 I 0.009 0.029 0.016 0.137 0.217 0.191 0.205 0.107 0.059 0.022 0.009 223 D 0.215 0.302 0.068 0.205 0.097 0.055 0.035 0.013 0.006 0.002 0.001 224 G 0.522 0.154 0.066 0.139 0.062 0.030 0.016 0.006 0.003 0.002 0.001 225 E 0.380 0.269 0.041 0.130 0.077 0.049 0.030 0.012 0.006 0.003 0.002 226 G 0.123 0.210 0.058 0.185 0.154 0.102 0.085 0.038 0.026 0.012 0.007 227 I 0.012 0.009 0.003 0.018 0.026 0.043 0.103 0.134 0.201 0.211 0.239 228 R 0.032 0.108 0.067 0.230 0.225 0.158 0.105 0.038 0.022 0.010 0.006 229 G 0.030 0.033 0.016 0.087 0.103 0.123 0.196 0.161 0.125 0.083 0.044 230 L 0.006 0.004 0.004 0.016 0.024 0.039 0.104 0.141 0.194 0.222 0.245 231 V 0.003 0.004 0.007 0.018 0.023 0.039 0.125 0.181 0.247 0.212 0.140 232 R 0.003 0.010 0.013 0.068 0.083 0.112 0.177 0.165 0.151 0.123 0.096 233 L 0.001 0.002 0.004 0.007 0.008 0.015 0.060 0.122 0.219 0.296 0.264 234 E 0.003 0.005 0.006 0.027 0.050 0.079 0.200 0.202 0.206 0.133 0.090 235 T 0.010 0.015 0.017 0.033 0.032 0.046 0.122 0.145 0.199 0.210 0.170 236 Y 0.013 0.027 0.021 0.117 0.171 0.173 0.199 0.121 0.081 0.049 0.026 237 V 0.010 0.022 0.018 0.054 0.075 0.096 0.195 0.170 0.174 0.113 0.075 238 K 0.251 0.161 0.056 0.162 0.142 0.092 0.074 0.033 0.018 0.008 0.003 239 D 0.455 0.228 0.072 0.132 0.058 0.030 0.016 0.005 0.003 0.001 0.001 240 D 0.088 0.076 0.034 0.116 0.125 0.126 0.174 0.111 0.076 0.048 0.025 241 N 0.335 0.203 0.057 0.138 0.099 0.065 0.051 0.025 0.015 0.008 0.005 242 Q 0.075 0.271 0.069 0.196 0.136 0.101 0.083 0.034 0.020 0.010 0.004 243 I 0.006 0.006 0.003 0.015 0.034 0.075 0.166 0.183 0.203 0.175 0.134 244 P 0.515 0.205 0.080 0.110 0.048 0.021 0.012 0.004 0.002 0.001 0.001 245 Y 0.023 0.064 0.043 0.219 0.232 0.173 0.148 0.056 0.026 0.011 0.004 246 I 0.003 0.003 0.004 0.007 0.008 0.015 0.061 0.119 0.217 0.273 0.290 247 R 0.005 0.010 0.023 0.145 0.234 0.250 0.199 0.070 0.040 0.017 0.007 248 K 0.050 0.087 0.467 0.205 0.089 0.048 0.032 0.012 0.006 0.003 0.002 249 V 0.001 0.003 0.008 0.024 0.042 0.105 0.249 0.198 0.163 0.134 0.071 250 F 0.001 0.002 0.003 0.005 0.007 0.017 0.098 0.166 0.266 0.255 0.178 251 D 0.017 0.036 0.181 0.287 0.227 0.135 0.069 0.022 0.014 0.007 0.003 252 D 0.051 0.091 0.339 0.201 0.121 0.094 0.060 0.020 0.012 0.006 0.004 253 L 0.004 0.005 0.008 0.021 0.026 0.053 0.162 0.189 0.248 0.183 0.102 254 A 0.005 0.002 0.006 0.010 0.015 0.042 0.162 0.183 0.221 0.198 0.156 255 K 0.015 0.053 0.486 0.235 0.121 0.052 0.023 0.008 0.004 0.002 0.001 256 T 0.009 0.041 0.085 0.132 0.163 0.221 0.200 0.074 0.044 0.020 0.010 257 L 0.002 0.003 0.003 0.009 0.014 0.026 0.080 0.149 0.236 0.264 0.214 258 P 0.159 0.109 0.061 0.129 0.126 0.124 0.142 0.067 0.044 0.023 0.013 259 H 0.250 0.167 0.162 0.199 0.112 0.059 0.032 0.011 0.006 0.002 0.001 260 L 0.004 0.005 0.003 0.015 0.029 0.056 0.149 0.184 0.200 0.191 0.163 261 T 0.115 0.241 0.120 0.196 0.119 0.075 0.063 0.029 0.023 0.011 0.008 262 A 0.058 0.023 0.022 0.042 0.055 0.083 0.175 0.157 0.172 0.127 0.085 263 D 0.526 0.244 0.059 0.101 0.040 0.016 0.010 0.003 0.001 0.001 0.001 264 L 0.023 0.028 0.011 0.046 0.067 0.093 0.183 0.176 0.165 0.129 0.080 265 P 0.343 0.266 0.060 0.137 0.083 0.047 0.030 0.013 0.010 0.007 0.006 266 I 0.087 0.061 0.027 0.085 0.102 0.127 0.179 0.125 0.104 0.068 0.035 267 P 0.333 0.191 0.056 0.144 0.098 0.058 0.054 0.027 0.020 0.012 0.008 268 R 0.079 0.086 0.031 0.130 0.153 0.143 0.159 0.092 0.064 0.039 0.026 269 L 0.047 0.066 0.025 0.082 0.096 0.104 0.149 0.129 0.124 0.101 0.077 270 P 0.070 0.047 0.041 0.111 0.130 0.146 0.182 0.104 0.082 0.051 0.036 271 E 0.350 0.135 0.108 0.180 0.099 0.054 0.041 0.017 0.009 0.005 0.002 272 N 0.054 0.114 0.086 0.184 0.148 0.130 0.140 0.072 0.043 0.021 0.009 273 I 0.013 0.018 0.021 0.047 0.053 0.080 0.140 0.148 0.189 0.169 0.121 274 L 0.027 0.036 0.055 0.076 0.093 0.123 0.201 0.134 0.113 0.083 0.059 275 P 0.004 0.029 0.044 0.077 0.083 0.103 0.186 0.164 0.150 0.102 0.057 276 I 0.004 0.006 0.009 0.014 0.018 0.029 0.103 0.154 0.235 0.236 0.193 277 Q 0.057 0.053 0.080 0.203 0.197 0.166 0.124 0.053 0.037 0.020 0.011 278 F 0.014 0.029 0.091 0.130 0.139 0.145 0.197 0.105 0.077 0.045 0.027 279 L 0.001 0.001 0.006 0.009 0.009 0.014 0.059 0.113 0.227 0.282 0.279 280 E 0.001 0.001 0.010 0.013 0.025 0.065 0.243 0.194 0.208 0.149 0.091 281 E 0.022 0.027 0.497 0.238 0.114 0.054 0.029 0.010 0.005 0.002 0.002 282 N 0.001 0.004 0.019 0.034 0.076 0.189 0.359 0.154 0.092 0.048 0.024 283 L 0.001 0.001 0.004 0.003 0.003 0.005 0.028 0.073 0.203 0.316 0.364 284 S 0.027 0.044 0.104 0.161 0.203 0.191 0.172 0.055 0.027 0.010 0.005 285 Y 0.045 0.077 0.352 0.217 0.125 0.092 0.054 0.020 0.011 0.006 0.002 286 Y 0.022 0.034 0.023 0.068 0.108 0.157 0.288 0.138 0.087 0.050 0.023 287 L 0.008 0.006 0.005 0.009 0.011 0.024 0.097 0.130 0.207 0.227 0.277 288 T 0.096 0.215 0.163 0.172 0.143 0.087 0.066 0.026 0.017 0.010 0.006 289 D 0.188 0.243 0.085 0.171 0.098 0.080 0.068 0.032 0.019 0.010 0.005 290 K 0.243 0.112 0.066 0.146 0.145 0.114 0.096 0.038 0.023 0.011 0.006 291 N 0.373 0.172 0.119 0.170 0.073 0.042 0.029 0.010 0.006 0.003 0.002 292 Y 0.008 0.016 0.023 0.063 0.086 0.145 0.258 0.169 0.129 0.070 0.032 293 M 0.016 0.014 0.039 0.041 0.047 0.079 0.177 0.169 0.179 0.145 0.095 294 N 0.032 0.059 0.258 0.243 0.164 0.106 0.077 0.031 0.018 0.008 0.004 295 T 0.025 0.055 0.162 0.183 0.150 0.144 0.122 0.063 0.051 0.030 0.014 296 R 0.034 0.026 0.049 0.062 0.066 0.099 0.179 0.157 0.153 0.113 0.061 297 L 0.041 0.044 0.101 0.110 0.107 0.126 0.202 0.115 0.087 0.048 0.021 298 F 0.026 0.048 0.232 0.098 0.070 0.062 0.103 0.095 0.110 0.094 0.061 299 A 0.042 0.063 0.138 0.141 0.120 0.121 0.139 0.088 0.073 0.048 0.027 300 Y 0.085 0.087 0.126 0.118 0.103 0.105 0.143 0.091 0.075 0.045 0.022 301 I 0.111 0.087 0.118 0.115 0.097 0.099 0.125 0.086 0.079 0.054 0.028 302 G 0.283 0.157 0.075 0.114 0.096 0.074 0.076 0.045 0.040 0.026 0.014 303 R 0.268 0.146 0.051 0.100 0.082 0.068 0.081 0.064 0.061 0.048 0.031