# TARGET T0214 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0214.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 37 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 2 E 0.052 0.015 0.005 0.027 0.005 0.030 0.865 3 W 0.117 0.017 0.022 0.038 0.228 0.115 0.463 4 E 0.343 0.019 0.029 0.045 0.117 0.071 0.376 5 M 0.624 0.022 0.012 0.040 0.034 0.020 0.248 6 G 0.762 0.013 0.008 0.023 0.025 0.013 0.157 7 L 0.653 0.016 0.013 0.028 0.049 0.026 0.214 8 Q 0.489 0.006 0.008 0.045 0.049 0.021 0.382 9 E 0.088 0.016 0.073 0.403 0.077 0.058 0.284 10 E 0.023 0.012 0.047 0.557 0.088 0.073 0.201 11 F 0.013 0.004 0.049 0.705 0.039 0.062 0.127 12 L 0.004 0.001 0.023 0.915 0.017 0.017 0.024 13 E 0.008 0.001 0.010 0.947 0.008 0.012 0.014 14 L 0.005 0.001 0.013 0.953 0.007 0.010 0.011 15 I 0.006 0.002 0.007 0.953 0.009 0.014 0.009 16 K 0.006 0.002 0.011 0.899 0.009 0.062 0.011 17 L 0.002 0.001 0.007 0.299 0.025 0.658 0.009 18 R 0.003 0.001 0.003 0.023 0.047 0.881 0.043 19 K 0.037 0.005 0.001 0.001 0.164 0.020 0.772 20 K 0.195 0.007 0.002 0.001 0.152 0.009 0.635 21 K 0.775 0.007 0.003 0.001 0.044 0.006 0.165 22 I 0.944 0.002 0.001 0.001 0.006 0.002 0.044 23 E 0.984 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.013 24 G 0.936 0.006 0.001 0.001 0.002 0.001 0.055 25 R 0.734 0.009 0.001 0.001 0.026 0.006 0.223 26 L 0.408 0.019 0.005 0.001 0.122 0.054 0.391 27 Y 0.071 0.023 0.006 0.002 0.448 0.062 0.387 28 D 0.032 0.014 0.014 0.012 0.482 0.052 0.394 29 E 0.011 0.009 0.226 0.129 0.217 0.236 0.172 30 K 0.012 0.013 0.372 0.156 0.131 0.188 0.127 31 R 0.008 0.003 0.728 0.113 0.027 0.068 0.052 32 R 0.032 0.002 0.544 0.143 0.033 0.145 0.101 33 Q 0.056 0.016 0.408 0.126 0.074 0.174 0.145 34 I 0.099 0.035 0.058 0.061 0.225 0.046 0.476 35 K 0.067 0.009 0.032 0.017 0.077 0.029 0.769 36 P 0.047 0.006 0.080 0.018 0.128 0.625 0.097 37 G 0.048 0.002 0.062 0.004 0.082 0.742 0.060 38 D 0.409 0.011 0.018 0.004 0.081 0.021 0.456 39 V 0.890 0.017 0.002 0.001 0.011 0.003 0.077 40 I 0.953 0.005 0.001 0.001 0.003 0.001 0.037 41 S 0.946 0.002 0.001 0.001 0.005 0.004 0.041 42 F 0.881 0.009 0.001 0.001 0.012 0.012 0.085 43 E 0.435 0.008 0.014 0.001 0.098 0.313 0.132 44 G 0.051 0.002 0.016 0.001 0.249 0.634 0.047 45 G 0.162 0.005 0.023 0.001 0.229 0.428 0.152 46 K 0.636 0.008 0.004 0.001 0.054 0.043 0.254 47 L 0.900 0.013 0.001 0.001 0.022 0.002 0.062 48 K 0.959 0.004 0.001 0.001 0.004 0.001 0.032 49 V 0.969 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.028 50 R 0.981 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.014 51 V 0.974 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.023 52 K 0.975 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.020 53 A 0.946 0.002 0.001 0.001 0.005 0.001 0.045 54 I 0.788 0.003 0.003 0.002 0.032 0.010 0.161 55 R 0.704 0.012 0.004 0.005 0.057 0.016 0.201 56 V 0.524 0.031 0.006 0.015 0.086 0.018 0.321 57 Y 0.209 0.010 0.007 0.049 0.108 0.023 0.594 58 N 0.102 0.013 0.076 0.342 0.100 0.110 0.257 59 S 0.038 0.010 0.066 0.468 0.108 0.116 0.195 60 F 0.017 0.005 0.097 0.633 0.057 0.092 0.099 61 R 0.010 0.001 0.067 0.719 0.063 0.077 0.063 62 E 0.011 0.002 0.056 0.703 0.046 0.106 0.076 63 M 0.007 0.006 0.050 0.707 0.052 0.081 0.097 64 L 0.007 0.004 0.028 0.699 0.044 0.105 0.113 65 E 0.006 0.003 0.024 0.711 0.032 0.133 0.090 66 K 0.007 0.003 0.018 0.716 0.064 0.085 0.107 67 E 0.010 0.005 0.017 0.746 0.049 0.051 0.122 68 G 0.007 0.002 0.034 0.785 0.039 0.047 0.086 69 L 0.007 0.003 0.052 0.820 0.020 0.055 0.043 70 E 0.007 0.003 0.048 0.806 0.020 0.078 0.038 71 N 0.009 0.005 0.038 0.649 0.045 0.189 0.065 72 V 0.012 0.008 0.029 0.441 0.101 0.262 0.148 73 L 0.013 0.012 0.047 0.165 0.154 0.150 0.459 74 P 0.015 0.013 0.084 0.150 0.156 0.292 0.291 75 G 0.010 0.009 0.076 0.096 0.195 0.326 0.289 76 V 0.012 0.013 0.059 0.083 0.345 0.149 0.341 77 K 0.014 0.018 0.052 0.130 0.262 0.128 0.396 78 S 0.007 0.012 0.055 0.159 0.137 0.069 0.561 79 I 0.003 0.003 0.126 0.473 0.049 0.229 0.118 80 E 0.004 0.002 0.108 0.496 0.058 0.257 0.075 81 E 0.007 0.008 0.089 0.613 0.064 0.111 0.107 82 G 0.010 0.012 0.030 0.712 0.039 0.066 0.132 83 I 0.014 0.003 0.023 0.796 0.032 0.029 0.102 84 Q 0.014 0.001 0.039 0.876 0.013 0.030 0.027 85 V 0.007 0.001 0.041 0.899 0.008 0.029 0.015 86 Y 0.009 0.002 0.035 0.904 0.006 0.031 0.013 87 R 0.015 0.002 0.029 0.884 0.012 0.041 0.016 88 R 0.020 0.001 0.030 0.824 0.017 0.085 0.024 89 F 0.012 0.003 0.029 0.740 0.059 0.085 0.072 90 Y 0.034 0.014 0.037 0.453 0.104 0.073 0.284 91 D 0.021 0.005 0.123 0.273 0.084 0.214 0.280 92 E 0.024 0.003 0.167 0.216 0.085 0.319 0.186 93 E 0.045 0.011 0.116 0.176 0.192 0.127 0.332 94 K 0.057 0.031 0.047 0.070 0.130 0.047 0.618 95 E 0.035 0.008 0.164 0.122 0.113 0.290 0.269 96 K 0.029 0.010 0.202 0.042 0.137 0.393 0.186 97 K 0.046 0.010 0.170 0.023 0.224 0.217 0.309 98 Y 0.088 0.011 0.041 0.009 0.288 0.200 0.363 99 G 0.267 0.005 0.013 0.002 0.302 0.101 0.310 100 V 0.813 0.012 0.001 0.001 0.015 0.005 0.154 101 V 0.949 0.003 0.001 0.001 0.006 0.001 0.040 102 A 0.975 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.020 103 I 0.959 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.037 104 E 0.917 0.001 0.001 0.001 0.012 0.001 0.070 105 I 0.901 0.002 0.001 0.001 0.008 0.001 0.086 106 E 0.924 0.003 0.001 0.001 0.011 0.001 0.059 107 P 0.895 0.003 0.001 0.002 0.017 0.002 0.080 108 L 0.742 0.010 0.001 0.004 0.029 0.006 0.207 109 E 0.382 0.013 0.002 0.006 0.007 0.016 0.573 110 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998